アンチセンス鎖の分子機能解析

• Project Area: Functional machinery for non-coding RNAs
• Project/Area Number: 24115702
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Chuo University
• Principal Investigator: 村上 浩士 中央大学, 理工学部, 教授 (80262020)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000); Fiscal Year 2013: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2012: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
• Keywords: 減数分裂 / 転写因子 / アンチセンス鎖 / 遺伝子発現 / 遺伝子

Outline of Annual Research Achievements

分裂酵母において減数分裂に特異的なスプライシングが数多くの遺伝子において報告されている(Averbeck et　al., Mol Cell, 18:491, 2005; Wilhelm et al., Nature, 453:1239, 2008)。一方、Mei4は減数分裂の進行と胞子形成において中心的な役割を果たす転写因子である(Horie et al., Mol Cell Biol 18:2118, 1998) (Murakami-Tonami et al., Proc Natl Acad Sci USA 104:14688, 2007)。申請者は、東京大学の白髭博士との共同研究により、イントロンの差を検出できる感度の高い方法を用いてMei4のターゲットを解析している。このタイリングアレイの実験から、Mei4の新しいターゲットや多くのアンチセンス鎖の発現を見出している。また、減数分裂に特異的にスプライシングされる遺伝子の９割以上にアンチセンス鎖の転写産物は体細胞分裂や減数分裂を通じて大きな変化はみられないが、減数分裂時に少し現象している遺伝子も存在していた。このアンチセンス鎖の機能については、未解明である。しかし、研究途中で別のグループからこれとほぼ同様の内容の研究が発表された(Chen et al., PLos One, 2012, e29917)。そのため、実験計画を見直しを迫られた。そして、アンチセンス鎖の発現が確認されたspo6について解析を行ったが、顕著な表現型が得られなかった。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Sexual development of Schizosaccharomyces pombe is induced by zinc or iron limitation through Ecl1 family genes. (2015)
  • Author(s): Ohtsuka H, Ishida M, Naito C, Murakami H, Aiba H.
  • Journal Title: Mol Genet Genomics. Volume: 290 Issue: 1 Pages: 173-185
  • DOI: 10.1007/s00438-014-0911-8
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A new pma1 mutation identified in a chronologically long-lived fission yeast mutant. (2014)
  • Author(s): Naito C, Ito H, Oshiro T, Ohtsuka H, Murakami H, Aiba H.
  • Journal Title: FEBS Open Bio. Volume: 4 Issue: 1 Pages: 829-833
  • DOI: 10.1016/j.fob.2014.09.006
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Regulation of wee1(+) expression during meiosis in fission yeast. (2014)
  • Author(s): Murakami-Tonami Y, Ohtsuka H, Aiba H, Murakami H.
  • Journal Title: Cell Cycle. Volume: 13 Issue: 18 Pages: 2853-2858
  • DOI: 10.4161/15384101.2014.946807
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Ecl1 is activated by the transcription factor Atf1 in response to H2O2 stress in Schizosaccharomyces pombe. (2014)
  • Author(s): Shimasaki T, Ohtsuka H, Naito C, Murakami H, Aiba H.
  • Journal Title: Mol Genet Genomics. Volume: 289 Issue: 4 Pages: 685-693
  • DOI: 10.1007/s00438-014-0845-1
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Inactivation of SMC2 shows a synergistic lethal response in MYCN-amplified neuroblastoma cells. (2014)
  • Author(s): Murakami-Tonami Y, Kishida S, Takeuchi I, Katou Y, Maris JM, Ichikawa H, Kondo Y, Sekido Y, Shirahige K, Murakami H, Kadomatsu K.
  • Journal Title: Cell Cycle. Volume: 13 Issue: 7 Pages: 1115-1131
  • DOI: 10.4161/cc.27983
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Another way to induce synchronous meiosis. (2012)
  • Author(s): Murakami H, Aiba H.
  • Journal Title: Cell Cycle Volume: 15 Issue: 10 Pages: 1874-1874
  • DOI: 10.4161/cc.20511
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Transient structure associated with the spindle pole body directs meiotic microtubule reorganization in S. pombe. (2012)
  • Author(s): Charlotta Funaya
  • Journal Title: Current Biology Volume: 22 Issue: 7 Pages: 562-574
  • DOI: 10.1016/j.cub.2012.02.042
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Chronological lifespan extension by Ecl1 family proteins depends on Prr1 response regulator in fission yeast. (2012)
  • Author(s): Ohtsuka H, Azuma K, Kubota S, Murakami H, Giga-Hama Y, Tohda H, Aiba H.
  • Journal Title: Genes Cells. Volume: 17 Pages: 39-52
  • Peer Reviewed