• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

動物由来RNAウイルスが制御する非コードRNAマシナリーの探索と解析

Publicly Offered Research

Project AreaFunctional machinery for non-coding RNAs
Project/Area Number 24115709
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

本田 知之  京都大学, ウイルス研究所, 助教 (80402676)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2013: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2012: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywords非コードRNA / 核 / ウイルス / スペックル
Research Abstract

ボルナ病ウイルス (BDV) は細胞核で複製するマイナス鎖をゲノムに持つRNAウイルスである。BDVが持続感染した核内には、ウイルスゲノムRNAを含む核内スペックル(vSPOT)が形成される。vSPOTはウイルスの転写・複製の場と考えられてきたが、既存の宿主核内構造物のマーカーとは共局在せず、その詳細な構成分子ならびに宿主細胞へ及ぼす影響については未だ不明である。一方、近年、細胞核にはタンパク質をコードしない長鎖非コードRNA(ncRNA) が存在することがわかってきた。BDVゲノムと長鎖ncRNAは、ともに核内に局在する長鎖ncRNAであり、核内でタンパク質が集積した構造物を形成する。また、クロマチンの構造や細胞の転写と関連している点も共通した特徴である。そこで本研究では、長鎖ncRNAのモデルとして、vSPOTと最近発見した内在性ボルナウイルス様配列(EBLN)の詳細な解析を行う。本年度の研究において、vSPOTマシナリー及びEBLNについて以下の結果を得た。
1)超解像度顕微鏡を用いて、vSPOTを詳細に観察した。その結果、ウイルスタンパク質は均一にvSPOTに局在するのではなく、NはvSPOT外周側、Pは内周側に局在する傾向を認めた。
2)vSPOTには、宿主分子HMGB1が局在する。BDV感染細胞中で、BDVリボタンパク複合体(RNP)およびHMGB1と相互作用する分子HBPを同定した。しかし、vSPOTでは、HBP-1とBDV RNPとの相互作用を認めなかった。以上から、vSPOTは、HBP-1とBDV RNPの相互作用を回避する構造である可能性が考えられた。
3)BDV持続感染細胞において、EBLN RNAをアンチセンスオリゴでノックダウンすると、BDV量が増加した。このことから、EBLNはRNAとして機能してBDV感染を阻害する可能性が示唆された。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (34 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (25 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] Nucleocytoplasmic shuttling of viral proteins in Borna disease virus infection.2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 5 Issue: 8 Pages: 1978-1990

    • DOI

      10.3390/v5081978

    • NAID

      120005650271

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Chaperones: Cell Surface Receptors for Viruses2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Journal Title

      Moonlighting Cell Stress Proteins in Microbial Infections

      Volume: 印刷中

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bornavirus closely associates and segregates with host chromosomes to ensure persistent intranuclear infection.2012

    • Author(s)
      Yusuke Matsumoto
    • Journal Title

      Cell Host Microbe.

      Volume: 11 Issue: 5 Pages: 492-503

    • DOI

      10.1016/j.chom.2012.04.009

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Generation of Human Bronchial Epithelial Cell Lines Expressing Inactive Mutants of GALNT32012

    • Author(s)
      Shoko Nakamura
    • Journal Title

      Journal of Veterinary Medical Science

      Volume: 74 Issue: 11 Pages: 1493-1496

    • DOI

      10.1292/jvms.12-0199

    • NAID

      130001879727

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionarily conserved interaction between the phosphoproteins and X proteins of bornaviruses from different vertebrate species.2012

    • Author(s)
      Kan Fujino
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 7 Issue: 12 Pages: e51161-e51161

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0051161

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Epigenetic regulation of an endogenous bornavirus element expression in the human genome2014

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      Mobile Genetic Elements and Genome Evolution
    • Place of Presentation
      USA
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 核内におけるウイルスRNA検知機構の解明2014

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第2回感染症国際センターシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ボルナ病ウイルス由来宿主非コードRNAの機能解析2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第6回ボルナウイルス研究会
    • Place of Presentation
      東京農工大学
    • Year and Date
      2013-03-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 宿主細胞による核内ウイルスRNPの認識機構の解明2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      2nd Negative Strand Virus-Japan Symposium
    • Place of Presentation
      沖縄ラグナガーデンホテル
    • Year and Date
      2013-01-15
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of a novel HMGB1-binding protein: implication for the intranuclear sensing of viral RNP2013

    • Author(s)
      Keizo Tomonaga
    • Organizer
      The 2nd Meeting on RNA and Biofunctions-ASIA Study RNA Biofunctions and Viruses
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2013-01-09
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 内在性RNAウイルス由来lncRNAの発現と機能解析2013

    • Author(s)
      朝長 啓造
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 内在性RNAウイルス由来lncRNAの発現と機能解析2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      RNA Frontier Meeting 2013
    • Place of Presentation
      静岡
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Endogenous viral elements: a novel restriction non-coding RNA of Borna disease virus infection2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      Riboclub 2013
    • Place of Presentation
      Canada
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Epigenetic regulation of an endogenous bornavirus element in the human genome2013

    • Author(s)
      Kozue Sofuku
    • Organizer
      The 12th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] A cooperative role of the mutations within the polymerase gene and the leader sequence of Borna disease virus in viral transcription activity and viral factory formation2013

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      The 12th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞核におけるボルナ病ウイルス持続感染機構の解明2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第31回染色体ワークショップ、第12回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] クロマチン結合タンパク質RBMXを介したボルナウイルスの複製制御機構の解析2013

    • Author(s)
      平井 悠哉
    • Organizer
      第31回染色体ワークショップ、第12回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 内在性ボルナ病ウイルス様エレメントによるボルナ病ウイルスの新しい制御機構2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ボルナウイルス感染細胞における特異的核内構造体vSPOTの構造形成メカニズムの解明2013

    • Author(s)
      平井 悠哉
    • Organizer
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAウイルスとLINE-1との相互作用解析2013

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第36回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ボルナ病ウイルス感染細胞における核内ウイルスRNPの制御機構の解明2012

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2012-12-13
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] vSPOT: an interaction platform of viral RNP and host factors in the nucleus2012

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      International Bornavirus Meeting in Freiburg 2012
    • Place of Presentation
      University of Freiburg
    • Year and Date
      2012-12-10
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] ボルナウイルスと宿主細胞との核内における攻防2012

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      生命科学セミナー
    • Place of Presentation
      京都産業大学
    • Year and Date
      2012-11-28
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ボルナ病ウイルス核内構造物の存在意義の解明2012

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場
    • Year and Date
      2012-11-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] ヒト由来内在性ボルナウイルス様ヌクレオプロテイン-2の機能解明2012

    • Author(s)
      藤野 寛
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場
    • Year and Date
      2012-11-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 内在性ボルナウイルス様Nエレメント1の転写制御機構の解明2012

    • Author(s)
      惣福 梢
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場
    • Year and Date
      2012-11-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of Borna disease viru s-induced RNA speckles in the nucleus2012

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      The 11th Awaji International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台
    • Year and Date
      2012-09-13
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 私たちの中のボルナウイルス2012

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      第15回 Summer Retrovirus Conference
    • Place of Presentation
      本能寺会館
    • Year and Date
      2012-07-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 内在性RNAウイルスエレメントの発現と機能解析2012

    • Author(s)
      本田 知之
    • Organizer
      生命科学研究科シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2012-07-11
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of Virus-induced RNA Speckle in the Nucleus2012

    • Author(s)
      Tomoyuki Honda
    • Organizer
      The 22nd CDB Meeting RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II
    • Place of Presentation
      理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
    • Year and Date
      2012-06-11
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks] 朝長研究室:京都大学ウイルス研究所ヒトがんウイルス研究分野

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/tomonaga-hp/

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] ボル研web

    • URL

      https://www.facebook.com/pages/%E3%83%9C%E3%83%AB%E7%A0%94web/386637678098111

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] 朝長研究室:京都大学ウイルス研究所ヒトがんウイルス研究分野

    • URL

      http://www.virus.kyoto-u.ac.jp/Lab/tomonaga-hp/index.html

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks] ボル研web

    • URL

      https://www.facebook.com/pages/%E3%83%9C%E3%83%AB%E7%A0%94web/386637678098111

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi