ＮＦ－κＢとｍｉＲＮＡが形成する制御ネットワークと自然炎症のホメオスタシス

• Project Area: Homeostatic inflammation: Molecular basis and dysregulation
• Project/Area Number: 24117704
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 伊庭 英夫 東京大学, 医科学研究所, 教授 (60111449)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2014-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000); Fiscal Year 2013: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2012: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
• Keywords: 内在性NF-κB / SWI/SNF 複合体 / miRNA / 制御ネットワーク / 上皮細胞 / アダプタータンパク質 / d4ファミリータンパク質

Research Abstract

NF-κBが標的とする遺伝子群は細胞種特異的に、また内在性、外来性の刺激に依存してその発現が決定されていて免疫応答や炎症反応において決定的な役割を果たす。本研究では癌化した上皮細胞中でbasal levelに発現される高レベルのNF-κBの活性に注目してこれを自然炎症のホメオタシスの破綻のモデル系として使用して自然炎症の分子基盤を明らかにすることを目的とする。
１．これまでに解析した３０種のヒト上皮・正常癌細胞株が、Type 1細胞[Egr-1(+)/miR-199a(+)/Brm(-)]とType 2細胞[Egr-1(-)/miR-199a(-)/Brm(+)]の２群に分かれる事、またこれがdouble-negative feed back機構によって安定に維持されることを示した。TypeI特異的に恒常的に発現される遺伝子として、CD44,MET,CAV1,CAV2を同定し、これらがmiR-199aの標的であると同時に、その発現がBrm依存的であることを示しこれらがBrm,Mir-199aの下流にあってFeed-forword loopを形成することを示した。
２．数多くのサイトカイン／ケモカイン遺伝子のmRNAの発現レベルを検索した所、IL6, IL8, MCP-1, Gro2及びIL1β遺伝子（A群）は、Type1のいくつかの細胞株で発現が見られたが、Type2のすべてで発現が見られなかった。一方IL1A, TNFα及びRANTETS(B群）はType1,Type2にかかわらずいくつかの細胞株で見られた。両者の遺伝子群の詳細な解析からA群はすべてその発現にBrm型SWI/SNF複合体を必要とし、一方B群はこれを必要としないことが示された。さらにA群のほとんどがNF-κBを介した活性化をうけること、この活性化にはd4ファミリータンパクが要求されることも示された。

Current Status of Research Progress

Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] 7SK small nuclear ribonucleoprotein complex is recruited to the HIV-1 promoter via short viral transcripts. (2014)
  • Author(s): Mizutani, T., Ishizaka, A., Suzuki, Y., and Iba, H.
  • Journal Title: FEBS Letters, Volume: 588: Issue: 9 Pages: 1630-1636
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2014.01.067
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A potent 2'-O-methylated RNA-based microRNA inhibitor with unique secondary structures (2012)
  • Author(s): Haraguchi,T., Nakano, H., Tagawa, T., Ohki, T., Ueno, Y., Yoshida, T., Iba, H.
  • Journal Title: Nucleic Acids Res. Volume: (in press) Issue: 8 Pages: 1-13
  • DOI: 10.1093/nar/gkr1317
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Double PHD finger proteins DPF3a and 3b are reouired as transcriptional coactivators in the SWI/SNF complex-dependent activation of the NF-κB Re1A/p50 heterodimer (2012)
  • Author(s): Ishizaka A, Mizutani T, Kobayashi K, Tando T, Sakurai K, Fujiwara T, Iba H
  • Journal Title: The Journal of Biological Chemistry Volume: (印刷中) Issue: 15 Pages: 11924-11933
  • DOI: 10.1074/jbc.m111.322792
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Extracellular ATP mediates mast cell-dependent intestinal inflammation through P2X7 purinoceptors (2012)
  • Author(s): Y. Kurashima, T. Amiya, T. Nochi, K. Fujisawa, T. Haraguchi, H. Iba, H. Tsutsui, S. Sato, S. Nakajima, H. Iijima, M. Kubo, J. Kunisawa, H. Kiyono
  • Journal Title: Nat Commun. Volume: 3-1034 Issue: 1 Pages: 1034-1034
  • DOI: 10.1038/ncomms2023
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Multiple microRNAs induced by Cdx1 suppress Cdx2 in human colorectal tumour cells (2012)
  • Author(s): Tagawa T
  • Journal Title: Biochem J Volume: 447 Issue: 3 Pages: 449-455
  • DOI: 10.1042/bj20120434
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 2’-OME RNAオリゴを基盤とした独特の二次構造を持つ新規microRNA阻害剤、S-TuD. (2012)
  • Author(s): 原口 健
  • Journal Title: 遺伝子医学MOOK Volume: 23 Pages: 169-175
• [Presentation] A crosstalk between HCV replication and host lipogenesis is mediated by miRNAs. (2013)
  • Author(s): Munakata,T., Haraguchi,T., Iba，H .，and Kohara，M .
  • Organizer: The 20th International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses to be held in Melbourne
  • Place of Presentation: Australia, Melbourne
• [Presentation] Dependency of the SWI/SNF complex and d4 family proteins for the expression of NF-κB target genes. (2013)
  • Author(s): Kobayashi, K., Hiramatsu, H., haraguchi, T., Sakurai, K., Iba, H.
  • Organizer: 第72回日本癌学会学術総会 横浜
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] Comparative analysis of efficient expression vectors for miRNA inhibitory decoy “TuD RNA” (2013)
  • Author(s): Haraguchi, T., Hiramatsu, H, and Iba, H.
  • Organizer: 第72回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] 東京理科大学RNA科学総合研究センター公開シンポジウム (2013)
  • Author(s): 伊庭英夫
  • Organizer: 東京理科大学公開シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京理科大学
• [Presentation] マイクロRNAの新展開と創薬への利用 (2013)
  • Author(s): 伊庭英夫
  • Organizer: ゲノム創薬フォーラム第32回談話 会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] Molecular switches formed by miR-199a and Brm, a catalytic subunit ofSWI/SNF chromatin remodeling factor,determine inflammation status in cancer cells. (2012)
  • Author(s): Iba, H.
  • Organizer: Innate Immunity Society (IEIIS) meeting
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2012-10-25
• [Presentation] SWI/SNFcomplex catalytic subunit, Brm, as a key epigenetical regulatorin cancer cells. (2012)
  • Author(s): Iba, H.
  • Organizer: 第71回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2012-09-19
• [Remarks] 宿主寄生体学分野
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/div-host-parasite/Version1.html