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新規トランスジェニック細胞樹立の基盤技術確立と合成生物学への応用

Publicly Offered Research

Project AreaSynthetic biology for the comprehension of biomolecular networks
Project/Area Number 24119506
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

野村 渉  東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 准教授 (80463909)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥14,040,000 (Direct Cost: ¥10,800,000、Indirect Cost: ¥3,240,000)
Fiscal Year 2013: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2012: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Keywordsタンパク質 / 合成生物学 / ゲノム編集 / DNA / ヌクレアーゼ / ゲノム修飾 / ケミカルバイオロジー / 蛋白質 / ゲノム / 遺伝子 / 酵素 / 分子進化
Research Abstract

Synthetic Biology(合成生物学)の分野では,細胞を部品の集合であると考え,それらの部品を人工的なものに置き換えてみる,もしくは完全な人工物で集合体(細胞・広い意味での生物)を組み上げる(再構成する)研究が進んでおり,細胞ベースの優れた技術を生み出す領域としての役割も担う。細胞の構成要素としてのゲノムは,普遍的遺伝情報を格納する場としてその他の生体高分子の成り立ちにも大きく影響をもつ。従って,ゲノムを自在に操作および制御する技術が,合成生物学研究,特に哺乳類細胞における研究の発展に大きく貢献すると期待される。
ゲノムに対する人為的な制御を可能とするためには30億塩基対から構成されるヒトゲノム配列に対して標的となるDNA配列に対して高い特異性で結合するタンパク質が必要となる。これを用いてエフェクタードメインを融合させ,酵素機能を有する機能分子を創製することができ,かつタンパク質発現系を利用して細胞内で作用させることができる。
DNA切断反応を用いたゲノム編集技術によって内因性遺伝子に自在にトランス遺伝子や変異を導入できる。本研究では,ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)を用いたトランスジェニック(ノックアウト)細胞樹立を行い,テロメア伸長酵素であるhTERT遺伝子のプロモーター領域を標的としたゲノム編集に成功した。他の標的としてこれまでノックアウトマウスの作製が困難であったASH1遺伝子(耐性致死)のエクソン配列を標的とし,それぞれZFNによる配列特異的なDNA切断による変異導入で標的箇所をゲノム編集した細胞を得ることに成功した。また,標的遺伝子部分を特異的に組み換えるDNA組換え酵素(ZFR)を用いた研究では目的とする欠損配列を生成させることに成功した。以上の結果は哺乳類細胞での内因性遺伝子に対するエンジニアリング技術基盤の確立につながると考えられる。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (31 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (15 results) (of which Invited: 5 results) Book (4 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] A CD4 Mimic as an HIV Entry Inhibitors: Pharmacokinetics2013

    • Author(s)
      Hashimoto, C., Narumi, T., Otsuki, H., Hirota, Y., Arai, H., Yoshimura, K., Harada, S., Ohashi, N., Nomura, W., Miura, T., Igarashi, T., Matsuhita, S., Tamamura, H.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 21 Issue: 24 Pages: 7884-7889

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.10.005

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CXCR4-derived synthetic peptides inducing anti-HIV-1 antibodies.2013

    • Author(s)
      Hashimoto C, Nomura W, Narumi T, Fujino M, Nakahara T, Yamamoto N, Murakami T, Tamamura H.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 21 Issue: 22 Pages: 6878-6885

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.09.037

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Anti-HIV-1 Peptide Derivatives Based on the HIV-1 Co-receptor CXCR4.2013

    • Author(s)
      Hashimoto C, Nomura W, Narumi T, Fujino M, Tsutsumi H, Haseyama M, Yamamoto N, Murakami T, Tamamura H.
    • Journal Title

      ChemMedChem

      Volume: 8 Issue: 10 Pages: 1668-1672

    • DOI

      10.1002/cmdc.201300289

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell-Permeable Stapled Peptides Based on HIV-1 Integrase Inhibitors Derived from HIV-1 Gene Products.2013

    • Author(s)
      Nomura W, Aikawa H, Ohashi N, Urano E, Metifiot M, Fujino M, Maddali K, Ozaki T, Nozue A, Narumi T, Hashimoto C, Tanaka T, Pommier Y, Yamamoto N, Komano JA, Murakami T, Tamamura H.
    • Journal Title

      ACS Chem. Biol.

      Volume: 8 Issue: 10 Pages: 2235-2244

    • DOI

      10.1021/cb400495h

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptide-based Ligand Screening and Functional Analysis of Protein Kinase C2013

    • Author(s)
      Ohashi, N., Nomura, W., Narumi, T., Tamamura, H.
    • Journal Title

      Biopolymers: Peptide Science

      Volume: 100 Issue: 6 Pages: 613-620

    • DOI

      10.1002/bip.22324

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multimerized CHR-Derived Peptides as HIV-1 Fusion Inhibitors.2013

    • Author(s)
      Nomura W, Hashimoto C, Suzuki T, Ohashi N, Fujino M, Murakami T, Yamomoto N, Tamamura H.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 21 Issue: 15 Pages: 4452-4458

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.05.060

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Low Molecular Weight CXCR4 Ligands with Variable Spacers.2013

    • Author(s)
      Narumi, T., Aikawa, H., Tanaka, T., Hashimoto、C., Ohashi, N., Nomura, W., Kobayakawa, T., Takano, H., Hirota, Y., Murakami, T., Yamamoto, N. and Tamamura, H.
    • Journal Title

      ChemMedChem

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 118-124

    • DOI

      10.1002/cmdc.201200390

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CD4 mimics as HIV entry inhibitors: Lead optimization studies of the aromatic substituents.2012

    • Author(s)
      Narumi T, Arai H, Yoshimura K, Harada S, Hirota Y, Ohashi N, Hashimoto C, Nomura W, Matsushita S, Tamamura H
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.

      Volume: 21 Pages: 2518-2526

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pharmacophore-Based Small Molecule CXCR4 Ligands.2012

    • Author(s)
      Narumi, T., Tanaka, T., Hashimoto, C., Nomura, W., Aikawa, H., Sohma, A., Itotani, K., Kawamata, K., Murakami, T., Yamamoto, N. and Tamamura, H.
    • Journal Title

      Bioorg.Med. Chem. Lett.

      Volume: 22 Issue: 12 Pages: 4169-4172

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.04.032

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of a Synthetic C34 Trimer of HIV-1 gp41 as AIDS Vaccines2012

    • Author(s)
      Hashimoto, C., Nomura, W., Ohya, A., Urano, E., Miyauchi, K., Narumi, T., Aikawa, H., Komano, J.A., Yamamoto, N., Tamamura, H.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem.

      Volume: (in press) Issue: 10 Pages: 3287-3291

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.03.050

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 人工酵素によるゲノム編集工学とその応用、可能性2014

    • Author(s)
      野村渉
    • Organizer
      日本薬学会第134年会
    • Place of Presentation
      ホテル日航熊本
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ジンクフィンガー融合酵素による遺伝子発現制御法の開発2013

    • Author(s)
      野村渉
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2013-03-27
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ジンクフィンガーヌクレアーゼによるテロメア活性の制御2013

    • Author(s)
      野村渉、増田朱美、玉村啓和
    • Organizer
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Effects of Zinc Finger Nucleases Targeting Telomerase Promoter Region2013

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Akemi Masuda, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      The 2nd Annual Conference of the International Chemical Biology Society
    • Place of Presentation
      京都大学紫蘭会館
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA Modification Enzymes Utilizing Sequence-Specificity of Zinc Finger Domains2013

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      CBI学会2013年大会
    • Place of Presentation
      船堀タワーホール
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Creation of Zinc Finger Nucleases Targeting Telomerase Promoter Region2013

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Akemi Masuda, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      4th Asia-Pacific International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of Peptide-derived Molecular Probes and Inhibitors Based on the Interactions with Biomacromolecules2013

    • Author(s)
      Wataru Nomura
    • Organizer
      4th Asia-Pacific International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] テロメラーゼプロモーター領域を標的としたゲノム編集2013

    • Author(s)
      野村渉、増田朱美、玉村啓和
    • Organizer
      細胞を創る会6.0
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学鶴岡タウンキャンパス
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ジンクフィンガーからゲノム編集ツールへの展開2013

    • Author(s)
      野村渉
    • Organizer
      2013年東日本スクリプス会
    • Place of Presentation
      ゆうぽうと五反田
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Development of Zinc Finger Enzymes for Genome Engineering.2012

    • Author(s)
      Nomura W, Masuda A, Tamamura H
    • Organizer
      The First International Symposium on Biofunctional Chemistry
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2012-11-28
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工酵素のデザインに基づくゲノム修飾・編集法の開発2012

    • Author(s)
      野村 渉
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会 5.0
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2012-11-21
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 設計型 DNA組換え酵素の配列特異的反応に関する定量的解析2012

    • Author(s)
      増田朱美、野村渉、玉村啓和
    • Organizer
      第49回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      鹿児島市
    • Year and Date
      2012-11-07
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of zinc finger nucleases targeting Epstain-Barr virus genome for suppression of viral production in B cells.2012

    • Author(s)
      Nomura W, Kondo A, Masuda A, Ryo A, Tamamura H
    • Organizer
      FASEB SRC, Genome Engineering: Research Applications
    • Place of Presentation
      Lucca, Italy
    • Year and Date
      2012-09-02
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Studies of Designer Zinc Finger Enzymes and Applications for Genome Editing and Modification.2012

    • Author(s)
      Nomura W, Masuda A, Kondo A, Ohba K, Yamamoto N, Tamamura H
    • Organizer
      The 26th Annual Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      2012-08-05
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] ジンクフィンガー融合型酵素によるゲノム編集法の開発2012

    • Author(s)
      野村渉、増田朱美、卜部亜里沙、玉村啓和
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第 7回年会
    • Place of Presentation
      京都市
    • Year and Date
      2012-06-07
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Book] Peptide Science 20122013

    • Author(s)
      Masuda A, Nomura W, Tamamura H.
    • Total Pages
      419
    • Publisher
      Kazuhisa Sugimura (Ed.), The Japanese Peptide Society, Osaka
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Book] Peptide Science 20122013

    • Author(s)
      Hashimoto C, Nomura W, Komano JA, Tamamura H.
    • Total Pages
      419
    • Publisher
      Kazuhisa Sugimura (Ed.), The Japanese Peptide Society, Osaka
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Book] Peptide Science 20122013

    • Author(s)
      Nomura W, Narumi T, Aikawa H, Tamamura H.
    • Total Pages
      419
    • Publisher
      Kazuhisa Sugimura (Ed.), The Japanese Peptide Society, Osaka
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Book] 「HIV阻害剤・腫瘍認識プローブとしてのケモカイン受容体リガンド」ペプチド医薬の最前線2012

    • Author(s)
      野村 渉
    • Total Pages
      240
    • Publisher
      (株)シーエムシー出版
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks] 東京医科歯科大学生体材料工学研究所メディシナルケミストリー分野 研究業績

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/i-mde/www/molb/publication/index.html

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] 東京医科歯科大学生体材料工学研究所メディシナルケミストリー分野ウェブページ

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/i-mde/www/molb/member/nomura.html

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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