翻訳システム改変による人工細胞創成
Publicly Offered Research
| Project Area | Synthetic biology for the comprehension of biomolecular networks |
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| Project/Area Number |
24119515
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Complex systems
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| Research Institution | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology |
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Principal Investigator |
宮崎 健太郎 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究グループ長 (60344123)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2013)
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| Budget Amount *help |
¥14,040,000 (Direct Cost: ¥10,800,000、Indirect Cost: ¥3,240,000)
Fiscal Year 2013: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2012: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
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| Keywords | リボソーム / 翻訳 / 宿主 / 16S rRNA / 遺伝子発現 / 表現型 / 機能改変 / 合成生物学 / メタゲノム |
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| Research Abstract |
大腸菌の翻訳プロファイル改変を目的に、リボソームの改変を行った。様々な環境よりメタゲノムより16S rRNA遺伝子をPCR増幅した。得られた増幅産物を16S rRNA遺伝子発現ベクターに組み込み、次いで大腸菌16S rRNA遺伝子欠損株Δ7株を形質転換した。ショ糖によるカウンターセレクションにより機能相補株を選抜し、数万規模のライブラリーを構築した。コロニーの大きさなどの観点からいくつかの変異株を選抜し、16S rRNA遺伝子の配列解析を行った結果、大腸菌の属するプロテオバクテリアとは門(Phylum)のレベルで異なる遺伝子が生育を相補することを 示した。これらの変異株の生育速度は野生株（Δ7株を大腸菌16S rRNAで機能相補した株）と比較して遅い値を示したが、実験室内進化を行うことにより、生育速度の短縮した変異株を得ることに成功した。変異株に含まれる16S rRNA遺伝子を解析した結果、大腸菌に残存する16S rRNA遺伝子断片と一部の領域で組換えが生じていることが判明した。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(44 results)
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[Journal Article] Meeting Report: 1st International Functional Metagenomics Workshop May 7–8, 2012, St. Jacobs, Ontario, Canada2013
Author(s)
Engel K, Ashby D, Brady SF, Cowan DA, Doemer J, Edwards EA, Fiebig K, Martens EC, McCormac D, Mead DA, Miyazaki K, Moreno-Hagelsieb G, O'Gara F, Reid A, Rose DR, Simonet P, Sjöling S, Smalla K, Streit WR, Tedman-Jones J, Valla S, Wellington EMH, Wu C-C, Liles MR, Neufeld JD, Sessitsch A, Charles TC
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Journal Title
Standards in Genomic Sciences
Volume: 8
Issue: 1
Pages: 106-111
DOI
Related Report
Peer Reviewed
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