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In situ膜蛋白質間相互作用NMR検出技術

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative understanding of biological processes mediated by transient macromolecular complexes; New technology for visualizing physiologically metastable states.
Project/Area Number 24121719
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

児嶋 長次郎  大阪大学, 蛋白質研究所, 准教授 (50333563)

Project Period (FY) 2012
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
KeywordsNMR / 構造生物学 / 膜蛋白質
Research Abstract

動的複合体状態は生命現象を理解する上で極めて重要であるが、原子レベル精度でそれらを解析するのは未だに困難である。特に膜蛋白質では足場としての膜自身の役割が大きく、in situでの動的複合体の解析が必須と考えられる。そこで本研究では膜蛋白質複合体を生きている細胞のまま原子レベル精度で解析可能なNMR技術を開発する。具体的には、生きている大腸菌で相互作用を観測したい膜蛋白質のみを安定同位体標識する技術を開発し、生きている細胞へDNP法を適用して測定感度を大幅向上させることで、in situで膜蛋白質問の動的相互作用を原子レベル精度で解析する。
平成24年度は、生きている大腸菌で相互作用を観測したい膜蛋白質のみを安定同位体標識する技術を開発した。生きている細胞のまま膜蛋白質を検出するには、生きている細胞に安定同位体を取り込ませ、膜蛋白質のみを安定同位体標識する技術が不可欠である。そこで2回膜貫通型蛋白質pHtrIIの大腸菌大量発現系において、培養時に非標識培地を、誘導時に安定同位体標識培地を用いることで、観測したい膜蛋白質のみを安定同位体標識することとした。従来法では,バックグラウンドとなる大腸菌由来の目的膜蛋白質以外のNMR信号が検出され、大きな問題となっていた。そこで、バックグラウンドとなる目的蛋白質以外の新規蛋白質合成を完全に阻害することが可能な大菌のSPPシステムを用いることで、目的膜蛋白質のみを安定同位体標識することに成功し、生きている大腸菌での観測にも成功した。

Report

(1 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2013 2012

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Utilization of lysine ^<13>C-methylation NMR for protein-protein interaction studies2013

    • Author(s)
      Yoshikazu Hattori
    • Journal Title

      Journal of Biomolecular NMR

      Volume: 55(In pres)

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insights into substrate recognition by the E. coli orf135 protein through its solution structure2012

    • Author(s)
      Kumiko Kawasaki
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 420 Issue: 2 Pages: 263-268

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2012.02.146

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ¹H, ¹³C and ¹⁵N NMR assignments of the Escherichia coli Orf135 protein.2012

    • Author(s)
      Kumiko Kawasaki
    • Journal Title

      Biomol NMR Assign.

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 1-4

    • DOI

      10.1007/s12104-011-9312-7

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 固体NMR法を用いた生理的環境での膜蛋白質pHtrIIの構造解析2012

    • Author(s)
      江川文子
    • Organizer
      第51回NMR討論会
    • Place of Presentation
      ウインクあいち(名古屋市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-11-10
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-05-31   Modified: 2019-07-29  

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