Local circuit census with retro-barcoding

Publicly Offered Research

Project Area	Census-based biomechanism of circuit construction and transition for adaptive brain functions
Project/Area Number	24H01235
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (III)
Research Institution	Kagoshima University (2025) Kyoto University (2024)
Principal Investigator	濱口航介鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (50415270)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥13,780,000 (Direct Cost: ¥10,600,000、Indirect Cost: ¥3,180,000) Fiscal Year 2025: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000) Fiscal Year 2024: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
Keywords	空間トランスクリプトーム / バーコード / カルシウムイメージング / 狂犬病ウィルス
Outline of Research at the Start	神経細胞には様々な細胞タイプが存在し，複雑な神経回路網を形成している．空間トランスクリプトームの方法は，空間構造を保持したまま，細胞の持つ遺伝子発現パターンを調べる事ができる強力な手法であるが，神経細胞同士の接続情報を調べる事ができない．本研究ではバーコード付き狂犬病ウィルスを用い，細胞同士の接続情報を空間トランスクリプトームに付け加える技術を開発する．