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Mechanochemical Modelling of cell crawling in diorama environment

Publicly Offered Research

Project AreaAdvanced mechanics of cell behavior shapes formal algorithm of protozoan smartness awoken in giorama conditions.
Project/Area Number 24H01485
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (IV)
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

多羅間 充輔  九州大学, 理学研究院, 助教 (90756834)

Project Period (FY) 2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords細胞運動 / メカノケミカルモデル / アクティブマター / 走硬性 / 反応拡散方程式 / 基盤接着
Outline of Research at the Start

細胞運動は発生や恒常性維持などの生命現象に非常に重要な役割を持つ。生体内の力学的な性質は均一ではなく、生化学的要因に加えてこの力学的相互作用により個々の細胞の運動が制御され、組織全体の変形などが適切に実現する。生体内における力学的性質の不均一性を細胞が感知し、運動を応答するプロセスの背後に潜むメカニズムを理解するために、硬さが不均一な基盤により構築されたジオラマ環境における細胞の這走運動を対象にした理論研究を進める。

Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では、生体内における力学環境の不均一性を細胞が感知し、運動を応答するプロセスがどのように実現するのかを理解するために、硬さが不均一な基盤により構築されたジオラマ力学環境下での運動における細胞の力学応答メカニズムの解明を目指している。本研究の目的達成のために、細胞運動のメカノケミカルモデルを用いて、細胞と同程度の長さスケールに渡る基盤硬さの不均一性を細胞が感知して、その情報を細胞内部のシグナル反応系にフィードバックすることで細胞の運動が変化する過程を数理モデルを用いて実現し、そのメカニズムを理論的に解析する。本年度は、まず最も単純な場合として、力学環境の影響を取り入れた細胞運動のメカノケミカルモデルを構築して、基盤の硬さが一様な場合に着目して研究を進めた。基盤の硬さを変化させたときに細胞の運動性がどのように変化するかを調べたところ、基盤硬さに対して非単調な結果を得た。この結果は先行研究で報告されている実験結果と整合するものである。そのメカニズムの解析も進めて、細胞の力生成と基盤接着の対称性の破れの結果として、概ね理解することに成功した。一方、硬さが非一様な基盤上での運動についても数値計算を進めて、さまざまな基盤のパターンに対して、細胞が基盤のパターンに応じて運動を変化することを確認した。また、一様基盤上での細胞運動の非単調性とも関係する結果が得られたが、その詳しい解析は今後の課題である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

一様基盤上での運動について、当初想定していた解析方法ではうまく説明できないことがわかった。そこで、解析方法を再検討することで細胞スケールでのメカニズムの解明に成功した。硬さが非一様な基盤の上での運動については数値計算のデータは取れており、その解析を現在進めている。

Strategy for Future Research Activity

今後は、一様基盤上での運動の結果を論文にまとめると同時に、パターン基盤上での運動の解析とそのメカニズムの解明を進める。特に、一様基盤上での運動性の結果との関係を詳しく解析する。また、並行して、力学環境から細胞内化学反応へのフィードバックプロセスを導入したモデルの実装も進める。

Report

(1 results)
  • 2024 Annual Research Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2025 2024 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 3 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Heinrich-Heine-Universitaet Duesseldorf(ドイツ)

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] University of Warwick(英国)

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] University of Geneva(スイス)

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] National University of Singapore(シンガポール)

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] Interaction between synchronizing elevators2025

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama, Sakurako Tanida
    • Organizer
      International Active Matter Workshop 2025
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 同期するエレベータの相互作用2025

    • Author(s)
      多羅間 充輔
    • Organizer
      非線形科学研究会2025 in 筑紫
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Modelling cell crawling on different substrate stiffness2025

    • Author(s)
      Sohei Nakamura, Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      DPG Spring Meeting of the Condensed Matter Section 2025
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞運動と組織形成のアクティブダイナミクス2025

    • Author(s)
      多羅間 充輔
    • Organizer
      日本物理学会 2025年春季大会
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 異なる硬さの基盤上での細胞の運動性2025

    • Author(s)
      多羅間 充輔
    • Organizer
      ジオラマ行動力学 第7回 領域全体会議
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] Optimal substrate stiffness for cell migration2025

    • Author(s)
      Sohei Nakamura, Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      International Active Matter Workshop 2025
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Impact of substrate stiffness on cell crawling2025

    • Author(s)
      Sohei Nakamura, Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      International workshop on Active and Soft Matter sensing and responsive to its environment
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Data Assimilation of Deformable Self-Propelled Particles Based on Nonlinear Deformation-Mode Model2025

    • Author(s)
      Daisuke Irikura, Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      International workshop on Active and Soft Matter sensing and responsive to its environment
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Torque-free rotation of cells crawling on a substrate2025

    • Author(s)
      Daisuke Katayama and Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      International Active Matter Workshop 2025
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Rotation and migration of a model cell induced by torque dipole2025

    • Author(s)
      Daisuke Katayama and Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      International workshop on Active and Soft Matter sensing and responsive to its environment
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Actin Cytoskeletal Structures via Micro and Macro Phase- Separation2024

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Oscillations and Dynamic Instabilities in Chemical Systems
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 走化性自己推進粒子の散乱と捕獲2024

    • Author(s)
      多羅間充輔, Hartmut Loewen
    • Organizer
      日本物理学会 第79回年次大会
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] ジオラマ環境下での細胞の這走運動のメカノケミカルモデル2024

    • Author(s)
      多羅間充輔
    • Organizer
      ジオラマ行動力学 第6回 領域全体会議
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] Micro and macro phase-separation of actin cytoskeleton2024

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      12th Liquid Matter Conference 2024
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞運動のアクティブソフトマター2024

    • Author(s)
      多羅間 充輔
    • Organizer
      ソフトバイオ研究会2024
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] エレベータは本当に同時に来るのか?2024

    • Author(s)
      多羅間充輔、谷田桜子
    • Organizer
      第34回非線形反応と協同現象研究会
    • Related Report
      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 複数台エレベータの同期現象に関する理論的考察2024

    • Author(s)
      多羅間充輔、谷田桜子
    • Organizer
      2024年度 MIMS 現象数理学研究拠点 共同研究集会「社会物理学とその周辺」
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 自己駆動液滴系に対するデータ同化2024

    • Author(s)
      入倉 大輔, 多羅間 充輔
    • Organizer
      日本物理学会 第79回年次大会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞運動における基盤の“硬さ”に対する応答2024

    • Author(s)
      中村草平, 多羅間充輔
    • Organizer
      日本物理学会 第79回年次大会
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞運動における化学-力学結合モデルの走硬性への適用2024

    • Author(s)
      中村草平,多羅間充輔
    • Organizer
      ジオラマ行動力学 第6回 領域全体会議
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      2024 Annual Research Report
  • [Presentation] 硬さの異なる基盤上での細胞運動2024

    • Author(s)
      中村草平,多羅間充輔
    • Organizer
      第130回日本物理学会九州支部例会
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  • [Presentation] 変形を伴う自己駆動液滴に対するデータ同化2024

    • Author(s)
      入倉大輔, 多羅間充輔
    • Organizer
      第130回日本物理学会九州支部例会
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      2024 Annual Research Report
  • [Funded Workshop] International workshop on Active and Soft Matter sensing and responsive to its environment2025

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Published: 2024-04-05   Modified: 2025-12-26  

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