Improving the sensitivity of DNA analysis from bioarchaeological samples

Publicly Offered Research

Project Area	Integrative bioarchaeological studies on human prehistory in the Japanese archipelago
Project/Area Number	24H01579
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (I)
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	三浦史仁東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任教授 (50447348)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2025)
Budget Amount *help	¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000) Fiscal Year 2025: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000) Fiscal Year 2024: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords	古代人ゲノム / １本鎖DNA / ライブラリー調製 / 次世代シークエンサー / DNA断片化 / １本鎖DNAリガーゼ / 古代生物
Outline of Research at the Start	生物考古学において古代生物由来DNAの分析は最も重要な情報源の１つである。だだ、古代生物由来のDNAは断片化が進行しており、一般的な生物から得られたDNAの配列決定とは異なるライブラリー調製戦略が必要となることが近年明らかになってきた。本研究は申請者が独自に開発してきた１本鎖DNAからのライブラリー調製技術であるSDL-TOPO法を古代生物由来DNAに適用するための最適化を行うこと、および、この技術を必要とする研究者に対して技術の移転や試薬供与、ライブラリー調製の支援を行うことでこの領域のDNA配列決定操作の高速化と高感度化を促進し、その結果、本領域の国際競争力を確保することに貢献することを試みる。