Natural product expansion using chemical structure generator oriented toward the creation of novel functional compounds

Publicly Offered Research

Project Area	Latent Chemical Space Based on Diverse Natural Products for Bio-active Molecular Design
Project/Area Number	24H01765
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (II)
Research Institution	Nagoya University
Principal Investigator	海東和麻名古屋大学, 情報学研究科, 特任助教 (10955488)
Project Period (FY)	2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help	¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000) Fiscal Year 2024: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywords	天然物化学 / ケモインフォマティクス / 構造生成器 / フラグメント / 医薬品化学
Outline of Research at the Start	天然物は古来より医薬品の魅力的なリソースとして機能してきたが、その合成は一般に困難であり、構造活性相関解明の制約となっている。初期条件に基づき化学構造式を発生させるアルゴリズムである構造生成器は多数開発されているが、天然物の化学構造表現は複雑となることから、それを数値ベクトルとして表現した潜在空間は数学的に低密度となり、機械学習による探索は困難となる。本研究では、天然物の構造展開を指向した構造生成器の開発と機能性分子の創製を目的とする。部分構造空間の構築と逐次的構造変換アルゴリズムを構築して、天然物の機能を抽出した化合物の構造式出力を目指す。