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細胞の動きが規則的な空間パターン形成に与える影響の構成的理解

Publicly Offered Research

Project AreaCross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular systems
Project/Area Number 25111712
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

戎家 美紀  独立行政法人理化学研究所, 生命システム研究センター, ユニットリーダー (00544933)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2014: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2013: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Keywords側方抑制 / 細胞分化 / 細胞運動 / パターン形成
Outline of Annual Research Achievements

Delta-Notchシグナルを使った側方抑制機構で細胞集団が自己組織化する際に、細胞の動きがどのように影響するかを、実際に人工側方抑制ネットワークを培養細胞上に作ることで検証した。結果、側方抑制機構によって生じる2タイプの細胞(Delta陽性細胞とNotch活性細胞)の比率が、細胞がランダムに動きまわることで大きく影響を受けること明らかにした。細胞密度が低いなど細胞がよく動く条件下では、Delta陽性細胞の比率が増加した。一方、細胞接着因子を強制発現して細胞が動きにくい条件にすると、Notch活性細胞の比率が増加した。さらに、細胞が動き回ることが、細胞比率が動的平衡(細胞タイプが絶えず入れ替わる)ではなく静的平衡(同じタイプで居続ける)を保つのに貢献していることを見出した。最後に、数理モデルを用いて、側方抑制ネットワークと細胞比率の関係をシミュレートすることができた。以上の成果は、2015年にNat Commun誌上にて発表した。
これまでDelta陽性細胞とNotch活性細胞の比率は一定と考えられてきた。一因としては、生体内で細胞の動きを制御するのは難しいためと思われる。一方本研究では、実験操作の容易な培養細胞上に人工側方抑制ネットワークを作製したため、様々な条件下で細胞比率を調べることが可能になり、その結果、細胞の動きによって比率が大きく変化し得ることを示せた。よって、当初の目的はおおむね達成できたと言える。ただし、今回の実験は全てCHO細胞(繊維芽細胞様の形態)を用いて行ったものである。研究開始当初は、上皮細胞のような規則的な形態の細胞で同様の研究を行うことを予定しており、それは引き続き今後の課題である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (17 results) (of which Invited: 15 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Synthetic lateral inhibition governs cell-type bifurcation with robust ratios2015

    • Author(s)
      Matsuda M, Koga M, Woltjen K, Nishida E & Ebisuya M
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 6195-6195

    • DOI

      10.1038/ncomms7195

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Dual role of YAP and TAZ in renewal of the intestinal epithelium2015

    • Author(s)
      Imajo M, Ebisuya M & Nishida E
    • Journal Title

      Nature Cell Biology

      Volume: 17 Issue: 1 Pages: 7-19

    • DOI

      10.1038/ncb3084

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Foxd1 is a mediator and indicator of the cell reprogramming process2014

    • Author(s)
      Makito Koga, Mitsuhiro Matsuda, Teruhisa Kawamura, Takahiro Sogo, Asako Shigeno, Eisuke Nishida, Miki Ebisuya
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 5 Issue: 1 Pages: 3197-3197

    • DOI

      10.1038/ncomms4197

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of pluripotency in male germline stem cells by Dmrt1.2013

    • Author(s)
      Takashima S, Hirose M, Ogonuki N, Ebisuya M, Inoue K, Kanatsu-Shinohara M, Tanaka T, Nishida E, Ogura A & Shinohara T.
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: 27 Pages: 1949-1958

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 細胞間コミュニケーションによる自己組織化の再構成2015

    • Author(s)
      戎家美紀
    • Organizer
      生命動態の分子メカニズムと数理
    • Place of Presentation
      京都府、京都市、京都大学芝蘭会館
    • Year and Date
      2015-03-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Reconstitution of multicellular development with synthetic minimum gene circuits2014

    • Author(s)
      Miki Ebisuya
    • Organizer
      EMBL invited seminar
    • Place of Presentation
      ドイツ、ハイデルベルグ、EMBL
    • Year and Date
      2014-12-08
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      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞間に違いを生み出すしくみの再構成2014

    • Author(s)
      戎家美紀
    • Organizer
      第一回六甲医学研究会
    • Place of Presentation
      日本、神戸、六甲山ホテル
    • Year and Date
      2014-11-07
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 遺伝子発現パターンの再構成2014

    • Author(s)
      戎家美紀
    • Organizer
      遺伝研研究会「クロマチンにおけるゲノムDNAの機能発現メカニズム」
    • Place of Presentation
      愛知県、三島市、国立遺伝学研究所
    • Year and Date
      2014-10-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Cell-type diversification through reconstituted lateral inhibition2014

    • Author(s)
      Miki Ebisuya
    • Organizer
      JSPS Japan-China Scientific Cooperation Program China-Japan-Korea Joint Symposium on Developmental Biology
    • Place of Presentation
      中国、北京、Chinese Academy of Sciences
    • Year and Date
      2014-10-22
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞間に非対称性を生みだすしくみの再構成2014

    • Author(s)
      戎家美紀
    • Organizer
      分生研セミナー
    • Place of Presentation
      東京都、東京大学分子細胞学研究所
    • Year and Date
      2014-10-01
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞間に非対称性を生み出すしくみの再構成2014

    • Author(s)
      戎家美紀
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      北海道、札幌市、札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25
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      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Reconstitution of intercellular symmetry breaking2014

    • Author(s)
      Miki Ebisuya
    • Organizer
      日米数理生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      大阪府、大阪市、大阪国際会議場
    • Year and Date
      2014-07-31
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      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 側方抑制によって細胞集団が多様化するしくみの再構成2014

    • Author(s)
      戎家美紀
    • Organizer
      第47回日本発生生物学会年会
    • Place of Presentation
      愛知県、名古屋市、ウインクあいち
    • Year and Date
      2014-05-30
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      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Genesis of asymmetry through synthetic cell-cell positive feedback

    • Author(s)
      Miki Ebisuya
    • Organizer
      Quan Tissue meeting "Computational approaches to networks, cells and tissues"
    • Place of Presentation
      スペイン バルセロナ
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 女性に人気の研究室の秘密 細胞運命を非対称化させる遺伝子回路の作製

    • Author(s)
      戎家 美紀
    • Organizer
      第2回バイオアセンブラ若手シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学 生産技術研究所 コンベンションセンター(東京都)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 同種の細胞間に違いを生むしくみの再構成

    • Author(s)
      戎家 美紀
    • Organizer
      熊本シンポジウム2013
    • Place of Presentation
      熊本大学発生医学研究所(熊本県)
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Genesis of Asymmetry Through Reconstituted Lateral Inhibition

    • Author(s)
      Miki Ebisuya
    • Organizer
      The 61st NIBB Conference"Cellular Community in Mammalian Embryogenesis"
    • Place of Presentation
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県)
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 均質な細胞間に「非対称性」を持たせるしくみの再構成

    • Author(s)
      戎家 美紀
    • Organizer
      第25回高速シンポジウム
    • Place of Presentation
      延暦寺会館(滋賀県)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 人工遺伝子ネットワークの開発 - 細胞運命を非対称化するしくみの再構成 -

    • Author(s)
      戎家 美紀
    • Organizer
      Frontier bioscience colloquium
    • Place of Presentation
      大阪大学大学院生命機能研究科(大阪府)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞間に非対称性を生み出すしくみの再構成

    • Author(s)
      戎家 美紀
    • Organizer
      生物リズム現象の数理フロンティア
    • Place of Presentation
      近畿大学 東大阪キャンパス(大阪府)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞間に違いを生み出すしくみの再構成

    • Author(s)
      戎家 美紀
    • Organizer
      第7回京阪奈計算生物物理学セミナー
    • Place of Presentation
      大阪大学中之島センター(大阪府)
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      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] 理化学研究所プレスリリース 均一な細胞集団に自発的に違いを生み出す仕組みを再構成

    • URL

      http://www.riken.jp/pr/press/2015/20150205_1/

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      2014 Annual Research Report
  • [Remarks] 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター内の研究室紹介ページ

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/jp/02_research/0207_strategic06.html

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      2013 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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