細胞の３次元運動理論
Publicly Offered Research
| Project Area | Cross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular systems |
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| Project/Area Number |
25111721
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
西村 信一郎 九州大学, 理学(系)研究科(研究院), 研究員 (60402541)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Project Status |
Declined (Fiscal Year 2014)
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| Budget Amount *help |
¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2014: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2013: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
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| Keywords | 低コスト型クラスター / ３次元シミュレーション / 細胞運動の本質 / 細胞性粘菌 / アメーバ運動 / ケラトサイト |
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| Research Abstract |
実施計画に従いクラスターシステムを設置した。本クラスターシステムは１ノードに６４コアを持ちそれを３台用意することで、個人で使用するにはきわめて強力なマシンパワーを持つものとなった。本クラスターシステムを使い、平面接着基盤上を動く細胞のシミュレーションを実施した。これまでマシンパワー不足で計算できなかった計算を行うことにより、さまざまな結果を得ることができた。シミュレーションにおける細胞には接着パラメータが設定されている。接着パラメータの大きくすると、細胞は基盤上に強く結合する。小さくすると基盤による制限は小さくなる。このパラメータが細胞の運動パターンに大きな変化を及ぼすことが確認された。Takagi et al. 2008 における野生型細胞性粘菌（5.5時間飢餓処理後）の運動データと比較をおこなったところ、接着パラメータが小さくすることがこのデータに近い運動パターンを生成することの必要条件であることがわかった。（ただし十分条件ではない）逆に 細胞性粘菌 amB(-)変異体や fish epidermal keratocyte によく似た、三日月型のパターンは接着力をより大きくすることが必要条件であった。残念ながらamiB(-)変異体や keratocyte より細胞性粘菌野生株の方が接着力が弱いという知見は私の知る限り公的な場では発表されていない。しかしながら、今後の実験によって確かめることができるだろう。
本研究は次年度においてもさらに発展させる計画だったが、研究職の任期満了によりやむなく辞退へと至った。不可抗力とはいえ、次年度に続けることができず自身の不覚のいたすところとしか言いようがなく、本研究をサポートしていただいた方々に申し訳なく、いつかこの研究の発展があることを、それがたとえ私自身によるものではないとしても、望みたい。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。
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Report
(1 results)
Research Products
(2 results)
