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細胞運動における細胞レオロジーと応力場のクロストーク

Publicly Offered Research

Project AreaCross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular systems
Project/Area Number 25111726
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

中垣 俊之  北海道大学, 電子科学研究所, 教授 (70300887)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2014: ¥8,840,000 (Direct Cost: ¥6,800,000、Indirect Cost: ¥2,040,000)
Fiscal Year 2013: ¥8,840,000 (Direct Cost: ¥6,800,000、Indirect Cost: ¥2,040,000)
Keywords計算物理 / 生体生命情報学 / 生物物理学 / 細胞、組織 / アクティブソフトマター
Outline of Annual Research Achievements

細胞原形質のレオロジー特性、とくに応力付加に対する応答性を実験的に明らかにするために、原形質の主たる構成タンパク質であるアクチン分子の集団挙動を、ズリ流れ下で観察した。一本一本のFアクチン分子を蛍光標識して可視化し、レーザー共焦点顕微鏡で単一分子レベルの挙動を動画像観察しながらズリを負荷した。Fアクチン溶液がシアバンド性を示すことをすでに発見しているが、本研究でその集団的分子構造すなわち紐状分子の絡み合いの変化とずり方向への配向度を測定できた。これにより、統計力学的な見地から応力について考察した。
また、粘菌変形体アメーバ運動時に発生する基質面への力学張力を可視化することに成功し、その時のアクチン分子の状態を蛍光染色と全方位複屈折顕微鏡で観察することができた。これにより粘菌アメーバ運動の力学機構の理解が進んだ(J. Royal. Soc. Interfaceにて誌上発表済み)。
粘菌の管ネットワーク形成において、閉じ込められた空間から這い出るとき、多様な空間形状に適応した効率的排出輸送流路ネットワークを作ることを発見し、その輸送性能を定量的に評価できた。さらにその力学機構を理解するための数理モデルを構築した。
粘菌の走性発現の方向決定における、外部摂動の効果を実験的に検証し、同一刺激に対する行動でさえも異なる様式が現れること、刺激の複合化よって行動パタンの多様性が増すこと、を見いだした。その力学機構を、反応拡散方程式モデルに基づいて提案できた(投稿準備中)。
加えて、繊毛虫の細胞運動において、キャピラリー空間から逃げ出るような適応行動の創発現象や、狭い空間の大きさを学習すること、を発見し、その仕組みを細胞膜電位の基本方程式(ホジキンハクスレー型方程式)の挙動から解明できた(一部はFrontiers in Microbiologyにて誌上発表済、一部は投稿準備中)。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 16 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Periodic traction in migrating large amoeba of Physarum Polycephalum2015

    • Author(s)
      Jean-Paul Rieu, Helene Delano-Ayari, Seiji Takagi, Yoshimi Tanaka, Toshiyuki Nakagaki
    • Journal Title

      Journal of Royal Society Interface

      Volume: 12 Issue: 106 Pages: 20150099-20150099

    • DOI

      10.1098/rsif.2015.0099

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Attempts to retreat from a dead-ended long capillary by backward swimming in Paramecium2014

    • Author(s)
      Itsuki Kunita, Shigeru Kuroda, Kaito Ooki, Toshiyuki Nakagaki
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 5 Pages: 1-8

    • DOI

      10.3389/fmicb.2014.00270

    • NAID

      120005465482

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Common mechanics of mode switching in locomotion of limbless and legged animals2014

    • Author(s)
      Shigeru Kuroda, Itsuki Kunita, Yoshimi Tanaka, Akio Ishiguro, Ryo Kobayashi, and Toshiyuki Nakagaki
    • Journal Title

      Journal of Royal Society Interface

      Volume: 印刷中

    • NAID

      120005611254

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 粘菌によせる関心の由来ー生物らしさとはー2013

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Journal Title

      科学

      Volume: 83 Pages: 892-893

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] イグノーベル賞顛末記ー単細胞の情報通信をめぐってー2014

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      電子情報通信学会アンテナ伝播研究会 IEEE AP-S JC 特別講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2014-10-16
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 粘菌のエソロジーからヒトの行動を考える2014

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      国立民俗学博物館学術交流サロン
    • Place of Presentation
      国立民俗学博物館
    • Year and Date
      2014-10-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Rules for biologically inspired network design2014

    • Author(s)
      Toshiyuki Nakagaki
    • Organizer
      Hokudai-NCTU Joint Symposium on Nano, Photo and Bio Sciences
    • Place of Presentation
      Hokkaido University
    • Year and Date
      2014-09-10
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Transport network in bio-systems -From vein-network in Physarum-2014

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      国際高等研究所研究プロジェクト「ネットワーク科学」
    • Place of Presentation
      国際高等研究所
    • Year and Date
      2014-08-04
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Biomechanics of peristaltic crawling in limbless and legged organism2014

    • Author(s)
      Toshiyuki Nakagaki
    • Organizer
      RIMS Conference Sapporo Summer Conference on Dynamics of patterns in material Science
    • Place of Presentation
      Hokkaido University
    • Year and Date
      2014-07-26 – 2014-07-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 化学反応系のパターン形成2014

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      日本化学会生体機能関連化学部会若手の会第26回サマースクール
    • Place of Presentation
      ラフォーレ蔵王
    • Year and Date
      2014-07-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Rich types of repulsive behavior to quinine in Physarum Plasmodium2014

    • Author(s)
      Toshiyuki Nakagaki
    • Organizer
      47th Ann. Meeting of the Jap. Soc. of Developmental Biology
    • Place of Presentation
      WINC Aichi
    • Year and Date
      2014-05-27 – 2014-05-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Rules for biologically inspired adaptive network design2013

    • Author(s)
      Toshiyuki Nakagaki
    • Organizer
      RIES-Hokudai International Symposium「網」
    • Place of Presentation
      Sapporo Gateaux Kingdom(北海道)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Behavioral diversity and decision-making of an amoeboid cell2013

    • Author(s)
      Toshiyuki Nakagaki
    • Organizer
      The 7th International Conference on Engineering of Chemical Complexity
    • Place of Presentation
      Conference Center Hohe Dune (Rostock-Warnemunde, Germany)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] いきものマテリアルとしての粘菌

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      第5回ニコニコ学会βシンポジウム「生命の境界ー2nd session いきものマテリアルー」
    • Place of Presentation
      東京六本木ニコファーレ(東京都)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アメーバとヒトのあいだー生命知の起源とイグノーベル賞ー

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      第50回慶応大学理工学部「人間教育講座」
    • Place of Presentation
      慶応大日吉キャンパス(横浜市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 化学機械としてみた粘菌の行動知

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      平成25年度機械学会熱工学カンファレンス特別講演会
    • Place of Presentation
      弘前大学(弘前市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アメーバの賢さを解き明かすレオロジー

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      平成25年度資源素材関係学協会合同秋季大会 市民参加型特別講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 粘菌運動アルゴリズム

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      北大創成シンポジウム--未来を開く生態予測シミュレーション--
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 粘菌のレオロジーとエソロジー

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      分子ロボティクス研究会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 粘菌のエソロジーとダイナミクス

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      第13回学習院大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      学習院大学(東京都)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] 粘菌 偉大なる単細胞が世界を救う2015

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Total Pages
      198
    • Publisher
      文藝春秋社
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Book] 「物理学ガイダンス(日本評論社編集部編)」生命現象の物理学ー生物行動の運動方程式をめざしてー2014

    • Author(s)
      黒田茂、中垣俊之
    • Publisher
      日本評論社
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      2013 Annual Research Report
  • [Book] 「現象数理学入門(三村昌泰編)」生命情報処理の現象数理学ー粘菌の迷路解きー2013

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Publisher
      東京大学出版会
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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