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バクテリア滑走マシナリーの幾何学と力学

Publicly Offered Research

Project AreaHarmonized supramolecular machinery for motility and its diversity
Project/Area Number 25117526
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

和田 浩史  立命館大学, 理工学部, 准教授 (50456753)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords生体運動マシナリー / バクテリア / 滑走運動 / バイオメカニクス / 数理モデル / 数理的力学モデル
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、細菌の運動、とくにバクテリア界で最速の滑走運動を示す細菌のひとつ、フラボバクテリアジョンソニエの動きの仕組みを、実験結果をもとに数理モデルを構築することで解明する、という課題に取り組んだ。細胞運動の生成メカニズムを探求することは、生命のメカニカルな設計原理を明らかにすることに貢献するだけでなく、感染症予防や新たな医療技術を始めとしてさまざまな応用が期待される重要な基礎研究である。
最新の実験結果(新学術領域計画班A03による研究成果)から、ジョンソニエの細胞表面には多数の接着性タンパク質SprBが流動しており、これが基盤と相互作用することで細胞の牽引力を生み出すということが示唆されてきた。25年度は1次元の数理モデルを構築し、このような動的な構造から細胞全体が方向性を持った運動がいかにして出現しうるか、その機構を明らかにする理論モデルを提案し、その解析結果を観測結果と比較した。
26年度はこのアイデアにもとづき、1次元モデルをより現実的な3次元モデルに拡張し、SprBタンパク質のらせん軌道、細胞の形状と両極の効果、基盤との物理的な相互作用など、より現実的な運動を調べるために必要な全ての要素をモデルに取り入れ、このモデルのふるまいを数値シミュレーションによって調べてきた。その結果、軌道上でのSprBタンパク質流の偏り(一時的な渋滞現象)があると、自発的にフリップやピボットといった、特徴的で複雑な細胞の3次元的な運動がすべて再現されることがわかった。これは、これまで顕微鏡下で観察されてきた一見複雑で多様な細胞運動の仕組みを統一的に理解することに貢献する、特筆すべき成果であると感じている。26年度の成果は現在、出版へ向けて準備中である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Bidirectional bacterial gliding motility powered by the collective transport of cell surface proteins2013

    • Author(s)
      Hirofumi Wada, Daisuke Nakane, Hsuan-Yi Chen
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 111 Issue: 24 Pages: 248102-248102

    • DOI

      10.1103/physrevlett.111.248102

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Helical flow of surface protein required for bacterial gliding motility.2013

    • Author(s)
      102. Nakane D, Sato K, Wada H, McBride MJ, Nakayama K
    • Journal Title

      Proc. Nat. Acd. Sci. USA

      Volume: 110 Issue: 27 Pages: 11145-11150

    • DOI

      10.1073/pnas.1219753110

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] バイオメカニクス:力学から見る生命現象2013

    • Author(s)
      和田 浩史
    • Journal Title

      日本物理学会誌

      Volume: 68 Pages: 612-615

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Morphodynamics of self-twisting biofilaments2014

    • Author(s)
      Hirofumi Wada
    • Organizer
      2014 KSIAM (Korean Society for Industrial and Applied Mathematics) Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Jeju, South Korea
    • Year and Date
      2014-11-21
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Physical basis for the bacterial gliding motility powered by the helical transport of cell surface proteins2014

    • Author(s)
      Hirofumi Wada
    • Organizer
      Minisymposia "Current rise of physical ethology in an individual lower organism" in "JSMB/SMB 2014
    • Place of Presentation
      グランキューブ大坂(大阪府)
    • Year and Date
      2014-07-31
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Mechanical basis for the helical pattern in twisting mutants of Arabidopsis2014

    • Author(s)
      Hirofumi Wada
    • Organizer
      COMPO 2014 Nanocomposites and Biocomposites
    • Place of Presentation
      Tel Aviv, Israel
    • Year and Date
      2014-04-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Model for bacterial gliding motility driven by helical flow of cell surface proteins

    • Author(s)
      Hirofumi Wada
    • Organizer
      7th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 微生物のうごき:数理モデル研究でできること、できないこと

    • Author(s)
      和田 浩史
    • Organizer
      原生動物学会若手の会シンポジウム
    • Place of Presentation
      広島大学,広島県
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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