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新規質量イメージングを用いたNーアセチルグルコサミン修飾タンパク質の時空間的解析

Publicly Offered Research

Project AreaRegulation of signal transduction by post-translational modifications and its pathogenic dysregulation
Project/Area Number 25117710
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

山本 一夫  東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (20174782)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥7,540,000 (Direct Cost: ¥5,800,000、Indirect Cost: ¥1,740,000)
Fiscal Year 2014: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2013: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Keywords糖鎖修飾 / 翻訳後修飾 / N-アセチルグルコサミン
Outline of Annual Research Achievements

昨年度は、N-アセチルガラクトサミン転移酵素をコードするcDNAをHEK293細胞の細胞質や核内に発現させて、核内及び細胞質タンパク質に見出されるN-アセチルグルコサミン(O-GlcNAc)修飾を伸長させることを行い、また、この伸長させた糖鎖に特異的に結合する新規のレクチンを見出した。これらの系を用いて、細胞質及び核内の新規のO-GlcNAc修飾タンパク質を特定したが、これらの糖鎖修飾が、どのアミノ酸残基に伸長した糖鎖が付加されているかについて詳細に検討した。修飾残基が1箇所知られているc-Relタンパク質をモデルとして、Mycタグを付加したc-Rel cDNAを上記のHEK293細胞に発現させ、免疫沈降してウエスタンブロッティングを行うと、GalNAc-GlcNAcに特異的なWJAへの結合が上昇し、抗O-GlcNAc抗体への結合は低下した。また、2次元電気泳動後、c-Relのスポットをゲルから切り出し、トリプシンによるゲル内消化を行い、回収したペプチドをMALDI-TOF質量分析で解析したところ、既知のSer残基が確かに2糖に伸長していることが示された。また、WJAレクチンを用いたアフィニティクロマトグラフィーで糖修飾ペプチドを特異的に精製することを試みたところ、GlcNAc修飾のみのペプチドに比べて2糖の方がレクチンに対する親和性が大きく亢進するため、効率よい濃縮が可能であると思われた。O-GlcNAc修飾のイメージングに関しては、WGAレクチンをGFP融合タンパク質として細胞質内に発現させることを行った。細胞活性化時における変化は、自家蛍光を排除するための対照とするレクチンが必要であり、今後の検討課題である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014 2013

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Association of malectin with ribophorin I is crucial for attenuation of misfolded glycoprotein secretion2014

    • Author(s)
      Takeda, K., Qin, S., Matsumoto, N., Yamamoto, K.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 454 Issue: 3 Pages: 436-440

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.10.102

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Assessment of weak sugar-binding ability using lectin tetramer and membrane-based glycans2014

    • Author(s)
      Yamamoto, K.
    • Journal Title

      Methods Mol. Biol.

      Volume: 1200 Pages: 413-418

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-1292-6_36

    • ISBN
      9781493912919, 9781493912926
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Journal Article] Carbohydrate-binding specificity of lectins using multiplexed glyco-bead array2014

    • Author(s)
      Yamamoto, K.
    • Journal Title

      Methods Mol. Biol.

      Volume: 1200 Pages: 319-326

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-1292-6_27

    • ISBN
      9781493912919, 9781493912926
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Journal Article] Comprehensive list of lectins: origins, natures, and carbohydrate specificities2014

    • Author(s)
      Kobayashi, Y, Tateno, H, Ogawa, H, Yamamoto, K, Hirabayashi, J.
    • Journal Title

      Methods Mol. Biol.

      Volume: 1200 Pages: 555-577

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-1292-6_45

    • ISBN
      9781493912919, 9781493912926
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Journal Article] Intracellular lectins are involved in quality control of glycoproteins2014

    • Author(s)
      Yamamoto, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the Japan Academy, Series B

      Volume: 90 Issue: 2 Pages: 67-82

    • DOI

      10.2183/pjab.90.67

    • NAID

      130003392354

    • ISSN
      0386-2208, 1349-2896
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Terminal N-acetylgalactosamine-specific leguminous lectin from Wisteria japonica as a probe for human lung squamous cell carcinoma.2013

    • Author(s)
      Soga et al.
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 8(12) Issue: 12 Pages: e83886-e83886

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0083886

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A novel method to identify O-GlcNAcylated proteins using a soluble N-acetylgalactosaminyltransferase2015

    • Author(s)
      Yamamoto, K.
    • Organizer
      2nd International symposium on protein modifications in pathogenic dysregulation of signaling
    • Place of Presentation
      東京大学医科学研究所大講堂(東京都、港区)
    • Year and Date
      2015-01-23 – 2015-01-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 核移行糖転移酵素を用いた核内N-アセチルグルコサミン修飾タンパク質同定法の確立2014

    • Author(s)
      山本一夫
    • Organizer
      第65回日本電気泳動学会総会
    • Place of Presentation
      横浜情報文化センター(神奈川県、横浜市)
    • Year and Date
      2014-10-24 – 2014-10-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] マメ科レクチンのスキャフォールド解析2014

    • Author(s)
      山本一夫
    • Organizer
      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都府、京都市)
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 糖鎖認識のための分子基盤:スキャフォールド解析から見えたこと2014

    • Author(s)
      曽我慶介、山本一夫
    • Organizer
      第33回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学豊田講堂(愛知県、名古屋市)
    • Year and Date
      2014-08-10 – 2014-08-12
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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