トップダウンリン酸化プロテオミクスを指向したアフィニティー磁気ビーズの創出
Publicly Offered Research
| Project Area | Regulation of signal transduction by post-translational modifications and its pathogenic dysregulation |
|---|
| Project/Area Number |
25117718
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
|
| Allocation Type | Single-year Grants |
|---|
| Review Section |
Biological Sciences
|
|---|
| Research Institution | Hiroshima University |
|---|
Principal Investigator |
木下 英司 広島大学, 医薬保健学研究院(薬), 准教授 (80304418)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2014)
|
| Budget Amount *help |
¥10,660,000 (Direct Cost: ¥8,200,000、Indirect Cost: ¥2,460,000)
Fiscal Year 2014: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2013: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
|
|---|
| Keywords | フォスタグ / リン酸化 / プロテオーム / 翻訳後修飾 / マグネットビーズ |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
これまでに申請者は，リン酸基を特異的に捕捉する亜鉛錯体（フォスタグ）をクロマト単体であるアガロースビーズに固定化させた分離剤を開発している。しかしながらこの分離剤は，迅速性と簡便性の点で課題を残していた。本研究では，迅速性や簡便性において特に優れたマグネット技術とフォスタグ技術を融合させることで従来の課題を解決する。当該年度では，前年度に合成した新規リン酸親和性磁気ビーズを利用することにより，分析ターゲットの絞り込みがなされ，リン酸化プロテオーム解析がいっそう容易，かつ，迅速になることを想定しながら以下の検討項目を実施した。
１）リン酸化プロテオーム解析を行うための緩衝液系の決定：リン酸親和性磁気ビーズに亜鉛を十分に結合させる平衡緩衝液として，0.1 M 酢酸亜鉛を含む 0.1 M Bis-Tris-AcOH (pH 7）を使用した。サンプルを結合させ，洗浄する緩衝液として，0.1 M 酢酸ナトリウムを含む 0.1 M Bis-Tris-AcOH (pH 7）を使用した。サンプルを溶出させる緩衝液として，0.1 M ピロリン酸ナトリウム-AcOH（pH 7）を使用した。
２）リン酸化プロテオーム解析の実行：OVISE 細胞のショットガンペプチドを上記の緩衝液系を利用して精製，濃縮を行った。精製濃縮されたペプチド 3.75 μg を質量分析により測定した結果，同定ペプチド数（850以上），並びに同定リン酸化率（90%以上）ともに従来のフォスタグアガローズビーズ法と比較してほぼ同様であることがわかった。さらには，その作業工程に関して，従来法よりも最大で60分以上短縮できることが明らかとなった。
以上のことより，新規リン酸親和性磁気ビーズを用いた本手法が，従来法より迅速性や簡便性において優れていることが証明でき，リン酸化プロテオーム解析にも十分に応用できることが示唆された。
|
| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
Report
(2 results)
Research Products
(49 results)
-
-
-
-
[Journal Article] Simple enrichment of thiol- containing biomolecules by using zinc(II)-cyclen-functionalized magnetic beads2014
Author(s)
Fujioka, H., Tsunehiro, M., Kawaguchi, M., Kuramoto, Y., Kurosaki, H., Hieda, Y., Kinoshita-Kikuta, E., Eiji Kinoshita, and Koike, T.
-
Journal Title
J. Sep. Sci.
Volume: 37
Issue: 13
Pages: 1601-1609
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Excystment-dependent alteration of protein expression in terrestrial ciliate Colpoda cucullus.2013
Author(s)
Sogame, Y., Kojima, K., Takeshita, T., Eiji Kinoshita, Funadani, R., and Matsuoka, T.
-
Journal Title
Microbes Environ.
Volume: 28
Pages: 388-390
NAID
Related Report
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Increase in Lipophilicity of Enalaprilat by Complexation with Copper(II) or Zinc(II) Ions.2013
Author(s)
Fujioka, H., Hieda, Y., Kuramoto, Y, Konishi, K., Kinoshita-Kikuta, E., Eiji Kinoshita, and Koike T.
-
Journal Title
Yakugaku Zasshi
Volume: 33
Pages: 1135-1141
NAID
Related Report
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
