AEP複合体による転写サイクルの制御メカニズム

• Project Area: Integral understanding of the mechanism of transcription cycle through quantitative, high-resolution approaches
• Project/Area Number: 25118511
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 横山 明彦 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (10506710)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2014)
• Budget Amount: ¥10,400,000 (Direct Cost: ¥8,000,000、Indirect Cost: ¥2,400,000); Fiscal Year 2014: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2013: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
• Keywords: 転写 / 遺伝子発現 / クロマチン / ヒストン修飾 / ゲノム / 癌 / 発現制御 / 生体分子 / 内科 / 蛋白質

Outline of Annual Research Achievements

本研究は我々が以前に分離同定したAEP複合体が転写サイクルの様々な局面でどのような働きをしているのかを調べる。AEPはSuper Elongation Complexとも呼ばれ、主に転写の伸長に関わっていると考えられているがその実体は良く分っていない。平成２６年度はAEPが転写サイクルの中で果たしている役割を調べるために(1)AEPのゲノムワイドな局在をChIP-seqにて同定する事、及び(2) AEPがクロマチン上で形成する複合体を同定する事に取り組んだ。(1)については15種類ほどのクロマチン結合因子、転写関連因子、ヒストン修飾のゲノムワイドな分布を明らかにした。これによってAEPが局在するクロマチン環境が明らかになった。(2)については、まずAEP構成因子の一つであるENLの複合体を精製したところ、いくつかの新しい結合因子が同定された。それらの因子はAEPが標的クロマチンを認識する上で重要な役割を果たしていると考えられた。そこでsh-RNAを用いてこれらの共作用因子をノックダウンしたところ、AEP依存性の転写が低下するものが見出された。今後これらの因子を詳細に解析することで、AEP依存性の転写のメカニズムを明らかにすることができると期待される。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Molecular mechanisms of MLL-associated leukemia. (2015)
  • Author(s): Yokoyama, A.
  • Journal Title: International journal of hematology Volume: 101 Issue: 4 Pages: 352-361
  • DOI: 10.1007/s12185-015-1774-4
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] MLL fusion proteins link transcriptional coactivators to previously active CpG-rich promoters (2014)
  • Author(s): Okuda H, Kawaguchi M, Kanai A, Matsui H, Kawamura T, Inaba T, Kitabayashi I, Yokoyama A
  • Journal Title: Nucleic Acid Research Volume: 未定 Issue: 7 Pages: 1-16
  • DOI: 10.1093/nar/gkt1394
  • NAID: 120005439160
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cleary ML MLL becomes functional through intra-molecular interaction not by proteolytic processing. (2013)
  • Author(s): Yokoyama A, Ficara F, Murphy M, Meisel C, Hatanaka C, Kitabayashi I,
  • Journal Title: PLOS ONE Volume: 8(9) Issue: 9 Pages: e73649-e73649
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0073649
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Mechanisms of aberrant self-renewal caused by MLL fusion oncoproteins (2015)
  • Author(s): Akihiko Yokoyama
  • Organizer: 4th Global Cancer Genomics Consortium
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2015-11-14 – 2015-11-15
  • Invited
• [Presentation] Reading epigenetic marks and activating transcription by MLL fusion proteins (2014)
  • Author(s): Akihiko Yokoyama
  • Organizer: 9th 3R symposium
  • Place of Presentation: 御殿場
  • Year and Date: 2014-11-17 – 2014-11-21
  • Invited
• [Presentation] The molecular mechanisms of MLL fusion-dependent leukemic transformation (2014)
  • Author(s): Akihiko Yokoyama
  • Organizer: 5th JSH International Symposium
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2014-05-24 – 2014-05-25
  • Invited
• [Presentation] MLL白血病の分子メカニズム (2013)
  • Author(s): 横山明彦
  • Organizer: 第７回先進血液学レクチャー
  • Place of Presentation: 東京都、東京ドームホテル
  • Invited
• [Presentation] Molecular mechanism of MLL-associated leukemia (2013)
  • Author(s): 横山明彦
  • Organizer: 第72回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 神奈川県、パシフィコ横浜
  • Invited