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基本転写因子TFIIDを介した転写調節機構の解明

Publicly Offered Research

Project AreaIntegral understanding of the mechanism of transcription cycle through quantitative, high-resolution approaches
Project/Area Number 25118520
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

古久保 哲朗  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (10271587)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2014: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2013: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywords転写調節 / 転写因子 / 基本転写因子 / TAND / 出芽酵母 / TFIID / TAF / TBP
Outline of Annual Research Achievements

基本転写因子TFIIDは、TATA結合タンパク質(TBP)と14種類のTBP随伴タンパク質(TAF)から成る巨大なタンパク質複合体であり、コアプロモーター構造を直接認識するとともに、転写調節において中心的な役割を果たすと考えられている。我々は、以前の研究において、TAF1のN末端に存在するTBP機能阻害領域(TAND; TAF1 N-terminal domain)がTFIIDによる転写活性化の分子スイッチとして機能することを見出し、"二段階ハンドオフモデル"と呼ぶ転写活性化の分子モデルを構築した。また最近では海外のグループとの共同研究により、出芽酵母由来のTAND-TBP複合体の構造を高解像度で決定することにも成功している。しかしながら、未だTANDの分子機能を完全に理解するまでには至っていない。
昨年度我々は、TAF11 or TAF12の上流にGAL1プロモーター(GAL1pro)を組み込み、グルコース(Glu)培地上での生育を調べたところ、前者のみが生育可能であることを見出した。そこで今年度は、本現象のTAF特異性について詳しく調べるため、GAL1pro-TAF1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 13株を作製し、Glu培地上での生育の有無について検討を行った。その結果、いずれのTAFもその欠失株は致死性を示す(全て必須遺伝子である)にもかかわらず、lobe Aに含まれるGAL1pro-TAFX株のみがGAL1pro-TAF11株と同様にGlu培地上で生育し得ることを見出した。興味深いことに、本現象はTAND依存性を示したことから、その分子基盤の解明は、TANDの機能を理解する上で極めて有用と考えられる。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] The physical size of transcription factors is key to transcriptional regulation in chromatin domains.2015

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima, Kazunari Kaizu, Sachiko Tamura, Tadasu Nozaki, Tetsuro Kokubo, Koichi Takahashi.
    • Journal Title

      J. Phys.: Condens. Matter

      Volume: 27 Issue: 6 Pages: 064116-064116

    • DOI

      10.1088/0953-8984/27/6/064116

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Both HMG boxes in Hmo1 are essential for DNA binding in vitro and in vivo.2015

    • Author(s)
      A. Higashino, Y. Shiwa, H. Yoshikawa, T. Kokubo, K. Kasahara
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 79(3) Issue: 3 Pages: 384-393

    • DOI

      10.1080/09168451.2014.978258

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] High-resolution structure of TBP with TAF1 reveals anchoring patterns in transcriptional regulation2013

    • Author(s)
      Anandapadamanaban M, Andresen C, Helander S, Ohyama Y, Siponen MI, Lundström P, Kokubo T, Ikura M, Moche M, Sunnerhagen M
    • Journal Title

      Nat Struct Mol Biol

      Volume: 20(8) Issue: 8 Pages: 1008-14

    • DOI

      10.1038/nsmb.2611

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 出芽酵母においてgal2 変異とミトコンドリア機能阻害が誘起するガラクトース培地特異的な生育阻害効果2014

    • Author(s)
      岩見亮, 大山良文, 高井直樹, 古久保哲朗
    • Organizer
      日本分子生物学会第37回年会
    • Place of Presentation
      横浜(パシフィコ横浜)
    • Year and Date
      2014-11-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ハイスループット型レポーターシステムを用いた出芽酵母由来の新規コアプロモーターエレメントの同定及びその機能解析2014

    • Author(s)
      渡邉清, 矢部誠, 古久保哲朗
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      横浜(横浜産貿ホール )
    • Year and Date
      2014-06-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母におけるTFIIDを介したGAL遺伝子群の脱抑制機構

    • Author(s)
      矢部 誠,大山 良文,高井 直樹,古久保 哲朗
    • Organizer
      日本分子生物学会第36回年会
    • Place of Presentation
      神戸(ポートピアホテル)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] リボソーム構成因子の発現調節に関わる酵母Hmo1タンパク質のDNA 結合機構

    • Author(s)
      東野 綺子,雲財 悟,中山 理紗,土屋 奈穂,吉川 博文,古久保 哲朗,笠原 浩司
    • Organizer
      日本分子生物学会第36回年会
    • Place of Presentation
      神戸(ポートピアホテル)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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