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植物体内におけるケイ素吸収・輸送・集積過程のモデル解析

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrated analysis of strategies for plant survival and growth in response to global environmental changes
Project/Area Number 25119723
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNational Institute for Agro-Environmental Sciences

Principal Investigator

櫻井 玄  独立行政法人農業環境技術研究所, その他部局等, 研究員 (70452737)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
Fiscal Year 2014: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords数理モデル / イネ / ケイ素 / シミュレーション実験 / ミネラル / トランスポーター / 作物成長モデル
Outline of Annual Research Achievements

作物においてケイ素は重要なミネラルであり、作物の病害や倒伏を防ぐ上で重要な役割を果たす。従って、植物体内でケイ素がどのように吸収・輸送され、そして蓄積されるのかを定量的に明らかにすることは、すぐれた収量安定性の品種開発などのために重要な課題であると同時に、近年その詳細化が求められている作物生長予測のための数理モデルの発展のためにも必須の課題である。本研究では、これまでの植物のケイ素の吸収・輸送に関わる分子生物学的な知見をもとに、数理モデルを作成し、また、作物体における濃度分布などのデータを統計的に数理モデルと融合させることにより、ケイ素輸送メカニズムの定量的に理解することを目的とする。
本研究ではまず、拡散方程式系を用いて、植物の根におけるケイ素の吸収・輸送をシミュレートする数理モデルを作成した。次に、そのモデルを実験室内におけるイネの実験データと統計的に融合することにより、ケイ素の根における吸収を精緻に予測することができるモデルを開発することができた。さらに、このモデルを利用したシミュレーション実験の結果、ケイ素吸収においてイネの根に特有の二重のカスパリー線 (根の障壁の役割を担う機関) とケイ素輸送体の共役が重要な役割を果たしていることなど、イネにおいて高いケイ素吸収能が実現されているメカニズムが明らかになった。
さらに、数理モデルをイネの節におけるケイ素の分配をシミュレートできるように拡張し、イネにおいて、ケイ素の吸収・輸送・分配をシミュレートすることができるモデルを開発した。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] 植物栄養と数理モデルの接点ー数理モデルで植物栄養の仕組みを理解する2015

    • Author(s)
      馬建鋒・小林高範・山地直樹・小林安文・小山博之・岩本明敏・櫻井玄
    • Journal Title

      日本土壌肥料学会誌

      Volume: 86 Pages: 226-230

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Journal Article] イネの根におけるケイ素吸収・輸送過程のモデル化と実証研究との連携2015

    • Author(s)
      櫻井玄
    • Journal Title

      JSMB Newsletter

      Volume: 76 Pages: 1-4

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Journal Article] Inversely estimating the vertical profile of the soil CO2 production rate in a deciduous broadleaf forest using a particle filtering method2015

    • Author(s)
      Sakurai, G., Yonemura, S., Kishimoto-Mo, A.W., Murayama, S., Ohtsuka, T., Yokozawa, M.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: March 20 Pages: 1-15

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In silico simulation modeling reveals the importance of the Caspian strip2014

    • Author(s)
      Sakurai, G., Satake, A., Yamaji, N., Mitani-Ueno, N., Yokozawa, M., Feugier, F.G.,
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 56 Issue: 4 Pages: 631-639

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv017

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] How much has the increase in atmospheric CO2 directly affected past soybean production?2014

    • Author(s)
      Gen Sakurai, Toshichika Iizumi, Motoki Nishimori & Masayuki Yokozawa
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: 1-5

    • DOI

      10.1038/srep04978

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イネにおけるケイ素吸収・輸送モデルによる植物体構造とその意義の解明2014

    • Author(s)
      櫻井玄
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2014年度東京大会
    • Place of Presentation
      東京農工大学
    • Year and Date
      2014-09-09 – 2014-09-10
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] The role of Casparian strips and Lsi transporter distribution in efficient Si transport in rice2014

    • Author(s)
      Sakurai, G.
    • Organizer
      6th International Conference on Silicon in Agriculture
    • Place of Presentation
      ストックホルム大学
    • Year and Date
      2014-08-26 – 2014-08-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 作物収量統計データを利用した作物成長モデルMCMCによる全地球キャリブレーション

    • Author(s)
      櫻井玄, 飯泉仁之直, 横沢正幸
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合2013年大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] A data-oriented semi-process model for evaluating the yields of major crops at global scale (PRYSBI-2)

    • Author(s)
      Sakurai, G, Iizumi, T, Yokozawa, M
    • Organizer
      AGU Fall Meeting 2013
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 過去の四半世紀における二酸化炭素濃度増加に伴う作物収量増加量

    • Author(s)
      櫻井玄, 飯泉仁之直, 横沢正幸
    • Organizer
      日本生態学会第61回全国大会
    • Place of Presentation
      広島
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] イネのケイ素輸送におけるカスパリー線の役割とトランスポーター配置

    • Author(s)
      櫻井玄, 馬建鋒, 佐竹暁子, 横沢正幸, 山地直樹, 三谷奈見季
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Book] 土壌炭素動態の環境応答モデリング (シリーズ現代の生態学 地球環境変動の生態学)2014

    • Author(s)
      横沢正幸, 櫻井玄 (原 登志彦 編)
    • Total Pages
      17
    • Publisher
      共立出版
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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