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材料科学からアプローチするバイオクレプティックス

Publicly Offered Research

Project AreaInnovative Materials Engineering Based on Biological Diversity
Project/Area Number 25120512
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

出口 茂  独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, 研究開発センター長 (40344296)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
Fiscal Year 2014: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2013: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywordsセルラーゼ / セルロース / ナノファイバー / バイオセンシング / 深海
Outline of Annual Research Achievements

SPOT(Surface Pitting Observation Technology)と呼ばれる、従来法とは異なる原理に基づいたセルラーゼ活性のセンシング手法を開発した。本手法はセルロースナノファイバーからなるヒドロゲルを基質に用い、ゲル表面に数十pLのセルラーゼ溶液を滴下した際に加水分解によって形成されるピットの体積を指標としてセルロースの酵素加水分解をセンシングする。
平成25年度の研究で、SPOTによるセルラーゼ活性検出機構を解明するためには、測定の時間分解能を向上させる必要があることが明確になった。そこで平成26年度は高速スキャンを特徴とする3D顕微鏡を用いた新たな実験システムを構築した。新システムでは、試料ステージ上に設置したナノファイバー基板の温度制御を可能にしたことに加えて、基板からの水の蒸発とそれに伴う基板表面の変形を抑制するための加湿チャンバーを構築した。ゼラチン/プロテアーゼを新たなモデル系に用いた実験では、4つのピットの体積を約20秒程度で測定可能であり(従来システムでは1つのピットの体積測定に約5分)、測定の時間分解能を大幅に向上させることに成功した。加えて酵素の基板中における拡散、基板との反応、さらには基板の幾何学形状を合わせて考慮した数理モデルを構築し、その数値シミュレーションによってピット形成メカニズムを再現することにも成功した。
また平成25年度までに、SPOTを用いて深海環境から単離したセルラーゼ生産菌GE09株からセルラーゼ遺伝子をクローニングした。平成26年度は組換え酵素のキャラクタリゼーションを行い、低温での活性(10℃から活性が認められ35℃で活性消失)や添加塩濃度に依存した比活性の上昇など、深海環境に適応した酵素であることを示唆する知見を得た。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (31 results)

All 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (1 results) Presentation (27 results) (of which Invited: 13 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] 「ビーナスの花かご」とバイオミメティクス2015

    • Author(s)
      出口 茂
    • Journal Title

      日本歯科医師会雑誌

      Volume: 67 Pages: 886-887

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Ultra-Sensitive Assay of Cellulose Hydrolysis by Using Nanofibrous Substrates Combined with 3D Profilometry2015

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes
    • Place of Presentation
      Proctor Academy、アンドーバー、アメリカ
    • Year and Date
      2015-08-02 – 2015-08-07
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ナノファイバー基質表面での酵素加水分解に伴うピット形成2015

    • Author(s)
      津留美紀子、山本美希、阪口 秀、出口 茂
    • Organizer
      セルロース学会第22回年次大会
    • Place of Presentation
      北海道大学、北海道札幌市
    • Year and Date
      2015-07-09 – 2015-07-10
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 深海生物の特異な生存戦略に基づくバイオミメティクス2015

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      日本化学会第95回春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス、千葉県船橋市
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ナノファイバー基質表面でのピット形成を利用した酵素活性の超高感度アッセイ2015

    • Author(s)
      津留美紀子、出口 茂
    • Organizer
      日本化学会第95回春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学理工学部船橋キャンパス、千葉県船橋市
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] White Nanobiotechnology for Deep-Sea Bioprospecting2014

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi, Mikiko Tsudome, Kohsuke Uchimura, Tohru Kobayashi
    • Organizer
      AsiaNano 2014
    • Place of Presentation
      Ramada Plaza Jeju Hotel、済州市、韓国
    • Year and Date
      2014-10-26 – 2014-10-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Biomimetic initiatives from deep-sea organisms at JAMSTEC2014

    • Author(s)
      Remi Tsubaki, Shigeru Deguchi
    • Organizer
      Biomimetics meets Museum: French-German-Japan Workshop on Mariage d’Histoire Naturelle et Nanotechnology
    • Place of Presentation
      パリ自然史博物館、パリ、フランス
    • Year and Date
      2014-10-16
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      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] オカッパリで挑む深海研究 ~極限環境生物圏にインスパイヤードされたソフトマテリアルの創成~2014

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      関西大学先端科学技術推進機構講演会
    • Place of Presentation
      関西大学、大阪府吹田市
    • Year and Date
      2014-10-03
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    • Invited
  • [Presentation] 高分子からアプローチするバイオクレプティクス2014

    • Author(s)
      出口 茂、津留美紀子、内村康祐、小林 徹
    • Organizer
      第63回高分子討論会
    • Place of Presentation
      長崎大学、長崎県長崎市
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-26
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  • [Presentation] 高分子ナノファイバーを利用した深海微生物資源の開拓2014

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      29th Summer University in Hokkaido
    • Place of Presentation
      定山渓ビューホテル、北海道札幌市
    • Year and Date
      2014-08-29 – 2014-08-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 3D可視化技術を用いたセルロース酵素加水分解過程の超高感度・リアルタイムアッセイ2014

    • Author(s)
      津留美紀子、出口 茂
    • Organizer
      第63回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県名古屋市
    • Year and Date
      2014-05-28 – 2014-05-30
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      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] White Nanobiotechnology for Elucidating Functional Diversity of Extremophiles in the Deep Sea2014

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      Department Seminar at the University of Porto
    • Place of Presentation
      University of Porto、ポルト、ポルトガル
    • Year and Date
      2014-05-21
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Elucidating Functional Diversity of Deep-Sea Extremophiles2014

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      Joint International Symposium on “Nature-Inspired Technology (ISNIT) 2014” and “Engineering Neo-Biomimetics V”
    • Place of Presentation
      Hokkaido University、北海道
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] White Nanobiotechnology for Prospecting Unidentified Bioresource in the Deep-Sea2014

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      The 7th Kyoto International Forum for Energy and Environment (KIFEE) Symposium
    • Place of Presentation
      Doshisha University、京都府
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] レーザー計測技術を用いた大腸菌コロニー形成過程の3次元リアルタイム解析2014

    • Author(s)
      津留美紀子
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス、東京都
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 3D Laser Profilometric Sensing of Cellulose Hydrolysis and Its Application for Prospecting the Deep-Sea Bioresource2013

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      3rd International Conference on Bio-Sensing Technology
    • Place of Presentation
      Melia Sitges、スペイン
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Cellulase Activity Assay Using Pit Formation on Nanofibrous Cellulose Matrix2013

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      62nd SPSJ (The Society of Polymer Science, Japan) Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference Center、京都府
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ナノファイバーセルロースを基質に用いた酵素加水分解速度の超高感度測定2013

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      セルロース学会第20回年次大会
    • Place of Presentation
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 複合エマルションを鋳型にした多孔質セルロースマイクロ粒子の調製2013

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      セルロース学会第20回年次大会
    • Place of Presentation
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ナノファイバーセルロースを用いた深海微生物資源のプロスペクティング2013

    • Author(s)
      津留美紀子
    • Organizer
      セルロース学会第20回年次大会
    • Place of Presentation
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 深海微生物が生産するセルロース分解酵素2013

    • Author(s)
      内村康祐
    • Organizer
      セルロース学会第20回年次大会
    • Place of Presentation
      京都大学宇治キャンパス おうばくプラザ、京都府
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Ultra-Sensitive Functional Screening of Cellulolytic Microorganisms Using Surface Pitting on Nanofiber Matrix2013

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      Enzyme Engineering XXII: Emerging Topics in Enzyme Engineering
    • Place of Presentation
      Toyama International Conference Center、富山県
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Ultra-Sensitive Kinetic Measurements of Enzymatic Hydrolysis of Cellulose Using Surface Pitting on Nanofibrous Matrix2013

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi
    • Organizer
      EPNOE 2013 International Polysaccharide Conference
    • Place of Presentation
      Nice Acropolis Convention and Exhibition Center、フランス
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] セルロースナノファイバーを用いた酵素分解プロセスの超高感度3D分析2013

    • Author(s)
      津留美紀子
    • Organizer
      第22回ポリマー材料フォーラム
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀、東京都
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] コロニー成長過程のリアルタイム三次元解析

    • Author(s)
      津留美紀子
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2013年度大会
    • Place of Presentation
      慶応大学日吉キャンパス、神奈川県
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 白いナノバイオテクノロジーが明らかにした深海生物資源の新たな有用性

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      第3回次世代の物質科学・ナノサイエンスを探る
    • Place of Presentation
      北海道大学、北海道
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 陸っぱり深海研究

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      第6回豊田理研懇話会
    • Place of Presentation
      豊田理化学研究所、愛知県
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 白いナノバイオテクノロジーが解き明かす深海生物資源の新たな姿

    • Author(s)
      出口 茂
    • Organizer
      第2回グリーンテクノロジー研究セミナー
    • Place of Presentation
      法政大学、東京都
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] セルロースナノファイバーの調製、分散・複合化と製品応用2015

    • Author(s)
      出口 茂、津留美紀子
    • Total Pages
      535
    • Publisher
      技術情報協会
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Book] Aqua extrema and vita incognita deep below the waves2014

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi, Keigo Kinoshita, Takaaki Kubota
    • Total Pages
      497
    • Publisher
      Connor Court
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  • [Book] Optical reactors for microscopic visualization of chemical processes in sub- and supercritical water2014

    • Author(s)
      Shigeru Deguchi, Sada-atsu Mukai
    • Total Pages
      474
    • Publisher
      Springer
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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