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セマフォリンシグナルの応答・伝達機構の解明に向けた受容体細胞外領域全長の構造解析

Publicly Offered Research

Project AreaStructural basis of cell-signalling complexes mediating signal perception, transduction and responses
Project/Area Number 25121729
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

禾 晃和  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 准教授 (40379102)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2014: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2013: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Keywordsシグナル伝達 / 受容体 / X線結晶構造解析 / 糖タンパク質 / 動物細胞発現系 / 構造生物学 / X線結晶構造解析
Outline of Annual Research Achievements

セマフォリンは軸索ガイダンス因子として発見された蛋白質であり、細胞表面受容体であるプレキシンと相互作用することでシグナルを伝達する。広範な研究から、セマフォリンとプレキシンによるシグナル伝達は、神経発生のみならず、免疫応答や器官形成など、様々な生命現象に関わっており、その異常はがんなどの疾患にもつながることが知られている。ヒトでは、計20種のセマフォリンと9種のプレキシンが存在するが、結合選択性は厳密に規定されており、その組み合わせによって生命現象特異的なシグナルが伝達される。興味深いことに、セマフォリンとプレキシンは、配列が相同なセマドメインと呼ばれる領域を有しており、互いのセマドメインを介して結合する。プレキシンは、計8個または10個のモジュールからなる巨大な細胞外領域を有しており、細胞質側にはGAPドメインが存在する。細胞外におけるセマフォリンとの相互作用は、プレキシンのGAPドメインの活性化を引き起こすが、その詳細な分子機構は不明のままである。また、セマフォリンとプレキシンの結合選択性についても十分な説明はなされていない。そこで、本研究では、プレキシン細胞外領域の構造解析と構造未知のセマフォリン・プレキシンのペアの構造解析に取り組んだ。
プレキシン細胞外領域の構造解析については、長鎖の断片について結晶が得られたが、原子レベルの分解能に達しなかったため、結晶性の改善に向けて糖鎖の除去に取り組んだ。糖鎖を3箇所まで変異で取り除いたものについては、大量発現と精製にも取り組んだ。
構造未知のセマフォリン・プレキシンのペアについては、それぞれ単独の構造決定に成功し、複合体の結晶も得られた。現状では、分解能が不十分であるため、複合体については精密構造の決定には至っていないが、結晶内での2分子の配置はすでに決定されており、結合選択性の議論を行うための情報は取得できた。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Structural basis for amyloidogenic peptide recognition by sorLA.2015

    • Author(s)
      Kitago Y, Nagae M, Nakata Z, Yagi-Utsumi M, Takagi-Niidome S, Mihara E, Nogi T, Kato K, Takagi J
    • Journal Title

      Nat. Struct. Mol. Biol.

      Volume: 22 Pages: 199-206

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] PA tag: a versatile protein tagging system using a super high affinity antibody against a dodecapeptide derived from human podoplanin2014

    • Author(s)
      Fujii Y, Kaneko M, Neyazaki M, Nogi T, Kato Y, Takagi J.
    • Journal Title

      Protein Expr Purif

      Volume: 95 Pages: 240-247

    • DOI

      10.1016/j.pep.2014.01.009

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 神経発生や免疫応答に関わるセマフォリンシグナルをささえる低親和性タンパク質間相互作用2014

    • Author(s)
      禾 晃和
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 結晶の中で再現する蛋白質の生理機能2014

    • Author(s)
      禾 晃和
    • Organizer
      第4回CSJ化学フェスタ2014-日本化学会秋季事業-
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都)
    • Year and Date
      2014-10-16
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] タンパク質結晶の最前線(第II編、第1章、3 動物細胞発現系を用いた細胞外タンパク質の試料調製、25-31ページ)2013

    • Author(s)
      杉山 成(監修)(禾 晃和、三原恵美子、高木淳一)
    • Total Pages
      288
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] Terukazu NOGI / Yokohama City University

    • URL

      http://www-mls.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/xtal-mls/members/nogi/index.html

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Remarks] Terukazu NOGI/Yokohama City University

    • URL

      http://www-mls.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/xtal-mls/members/nogi/index.html

    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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