Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
本研究は、タンパク質のアロステリック構造転移の転移経路と自由エネルギーランドスケープを計算する新しい方法を開発し、その成果をタンパク質間相互作用のシステム生物学と結び付け、分子から細胞機能への融合分野を開拓することを目的としている。このため、27年度は以下のテーマに取り組んだ。その1つは、タンパク質アロステリック転移を表現する自己無撞着な粗視化モデル(カメレオンモデル)の開発である。カメレオンモデルをNtrCに適用し、遷移状態で構造の乱れがおきる様子を計算で示した。もう1つは、KaiABC系の1分子レベルのモデルである。27年度に明らかになった、生化学的実験データ、原子間力顕微鏡観測データ、構造データをもとに26年度までに構築した1分子モデルを再検討し、合理的なモデルに向けて整備を行った。
27年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2016 2015 2014 Other
All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results, Peer Reviewed: 5 results, Open Access: 4 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results, Invited: 5 results)
Biophysics and Physicobiology
Volume: 未定
130005165373
Phys. Chem. Chem. Phys.
Volume: 17 Issue: 43 Pages: 29036-29044
10.1039/c5cp04780c
Scientific Reports
Volume: 5 Issue: 1
10.1038/srep16746
120005822508
PLoS Comput Biol
Volume: 10 Issue: 4 Pages: e1003552-e1003552
10.1371/journal.pcbi.1003552
120005476003
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Volume: 111 Issue: 45 Pages: 15969-15974
10.1073/pnas.1406244111