タンパク質物性から振動の理論生物学へ
Publicly Offered Research
| Project Area | Dynamical ordering of biomolecular systems for creation of integrated functions |
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| Project/Area Number |
26102520
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Science and Engineering
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
笹井 理生 名古屋大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (30178628)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Budget Amount *help |
¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
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| Keywords | アロステリック転移 / 概日周期 / １分子運動論 / 反応システム理論 / 1分子運動論 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、タンパク質のアロステリック構造転移の転移経路と自由エネルギーランドスケープを計算する新しい方法を開発し、その成果をタンパク質間相互作用のシステム生物学と結び付け、分子から細胞機能への融合分野を開拓することを目的としている。このため、２７年度は以下のテーマに取り組んだ。
その１つは、タンパク質アロステリック転移を表現する自己無撞着な粗視化モデル（カメレオンモデル）の開発である。カメレオンモデルをNtrCに適用し、遷移状態で構造の乱れがおきる様子を計算で示した。
もう１つは、KaiABC系の１分子レベルのモデルである。２７年度に明らかになった、生化学的実験データ、原子間力顕微鏡観測データ、構造データをもとに２６年度までに構築した１分子モデルを再検討し、合理的なモデルに向けて整備を行った。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(18 results)
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[Journal Article] Coupling of Lever Arm Swing and Biased Brownian Motion in Actomyosin2014
Author(s)
Nie, QM., Togashi, A., Sasaki, TN., Takano, M., Sasai, M., Terada, TP
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Journal Title
PLoS Comput Biol
Volume: 10
Issue: 4
Pages: e1003552-e1003552
DOI
NAID
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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