化学修飾導入siRNAによる１遺伝子特異的ケムバイオケム型RNA干渉法の開発
| Project Area | Chemical Biology using bioactive natural products as specific ligands: identification of molecular targets and regulation of bioactivity |
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| Project/Area Number |
26102713
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Science and Engineering
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
程 久美子 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50213327)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Budget Amount *help |
¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
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| Keywords | siRNA / 科学修飾 / ケムバイオケム / RNA interference / RNA silencing / 化学修飾 / RNA interfering |
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| Outline of Annual Research Achievements |
RNA interference (RNA干渉)とは、小さな２本鎖RNA (small interfering RNA, siRNA) が、相同な塩基配列をもつmRNAと対合して切断することで、遺伝子発現を抑制するという現象であり、簡便な遺伝子ノックダウン法として広く利用されている。しかしながら、その臨床応用などへの実用化という観点からは、特異性や安定性などにおいて、まだ解決すべき重要な問題を抱えている。本研究では、siRNAの核酸対合の化学的性質（ケム）がサイレンシングの程度を規定するという我々の生物学的な研究成果（バイオ）に基づき、RNAに適切な化学修飾（ケム）を導入することでRNA干渉における問題点を克服し、目的とする１遺伝子特異的ノックダウン法を開発することを目指した。我々は、先行研究において、siRNAの限られた領域とmRNAとの塩基対合力（熱力学的安定性）を調節することで、標的とする１遺伝子に対して特異的にRNA干渉作用を示すsiRNAを選択できる手法を確立している。しかしながら、塩基配列にもで対合力を調節することには限界があり、塩基配列よりも大きな効果が期待できる化学修飾によって塩基対合力を変動させることを検討した。化学修飾としては、DNA, 2′-O-methyl（2′-OMe）, phosphorothioate（PS），DNA-PS, locked nucleic acid（LNA）, Unlocked nucleic acid (UNA)を用いた。２種類のレポーターアッセイとマイクロアレイ解析を行い、これらの化学修飾はすべてguide strandのオフターゲット効果を減弱する作用があることが明らかになった。しかし、passenger strandのオフターゲット効果は、LNAおよびDNA修飾では、未修飾siRNAと同程度であったが、2’-OMeおよびPS修飾では増強されていると考えられ、LNAおよびDNAは非常に有効な化学修飾であると考えられた。この後は実用化にむけて、生体内での特異性などについて検討する必要がある。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(54 results)
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[Presentation] A-to-I editomes.2016
Author(s)
Josephine Galipon, Soh Ishiguro, Rintaro Ishii, Yutaka Suzuki, Masaru Tomita, Kumiko Ui-Tei
Organizer
Quantitative Biology: force, information and dynamics: X factors shaping living systems
Place of Presentation
National Institute of Genetics,Mishima, shizuoka,Japan
Year and Date
2016-01-12
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[Presentation] A-to-I RNA editing fine-tunes miRNA function in human cells.2015
Author(s)
Josephine Galipon, Soh Ishiguro, Rintaro Ishii, Hideaki Kume, Kimihiro Hino, Yutaka Suzuki, Shinji Kondo, Mariko Okada-Hatakeyama, Masaru Tomita, Kumiko Ui-Tei
Organizer
2nd Symposium on Complex Biodynamics & Networks (Bio 2015)
Place of Presentation
慶應義塾大学鶴岡メタボロームキャンパス（山形県）
Year and Date
2015-05-11
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