染色体活性制御と偽ヘテロクロマチン化の相関
Publicly Offered Research
| Project Area | Correlative gene system: establishing next-generation genetics |
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| Project/Area Number |
26113714
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Kinki University |
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Principal Investigator |
佐渡 敬 近畿大学, 農学部, 教授 (70321601)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Budget Amount *help |
¥19,890,000 (Direct Cost: ¥15,300,000、Indirect Cost: ¥4,590,000)
Fiscal Year 2015: ¥10,010,000 (Direct Cost: ¥7,700,000、Indirect Cost: ¥2,310,000)
Fiscal Year 2014: ¥9,880,000 (Direct Cost: ¥7,600,000、Indirect Cost: ¥2,280,000)
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| Keywords | エピジェネティクス / ヘテロクロマチン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
変異型Xist RNAが構築する偽ヘテロクロマチンのヒストン修飾についてChIP-seq解析を行うにはマウス初期胚では十分な材料が得られないため、これに代わる材料として変異胚から樹立したES細胞（ESC）の利用を検討した．その中で生じた最も大きな問題は、メスのESCが培養過程でX染色体を1本欠失し、XOとなる細胞が無視できない頻度で出現することであった．そのため、ESCを利用した解析はこれまでのところ期待通りには進展していない．その打開策として、ESCに変わる新たな材料としてEpiSCの樹立する準備を進めている．
一方、変異Xist RNAが引き起こすサイレンシングの異常の程度を明らかにするため、変異胚を用いたRNA-seqを計画した．胎盤を形成する胚体外組織と胎児を形成する胚体組織の間にはX染色体不活性化の仕組みに違いがあるため、それぞれを分けて解析を行っている．胚体外組織については予定しているシーケンシングの大半を終了し、得られたリードの解析を進めている．胚体組織ついては、順次シーケンシングを行っている状態である．これまでに得られた胚体外組織の解析からは、不活性化すべきX染色体を不活性化できないと、X連鎖遺伝子の発現が2倍になるという単純なものではなく、X連鎖遺伝子にも常染色体連鎖遺伝子にも発現レベルが上昇するもの、減少するものが多数観察された．これはX染色体不活性化が単純に雌雄間のX連鎖遺伝子量の差を補償するためだけの機構にとどまらず、ゲノムワイドの遺伝子発現に大きなインパクトを持つものであることを示唆している．このRNA-seq解析を早急に終え、X染色体不活性化の生物学的意義に関するこの新たな考え方を迅速に成果として公表できるよう努める．
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(29 results)
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[Journal Article] An Xist Activating Antisense RNA Required for X-chromosome Inactivation.2015
Author(s)
Sarkar, M., Gayen, S., Kumar, S., Maclary, E., Buttigieg, E., Hinten, M., Kumari, A., Harris, C., Sado, T., and *Kalantry, S.
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Journal Title
Nature comm.
Volume: 6
Issue: 1
Pages: 8564-8564
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] X Chromosome Reactivation Dynamics Reveal Stages of Reprogramming to Pluripotency2014
Author(s)
Pasque, V., Tchieu, J., Karnik, R., Uyeda, M., Dimashkie, M.S., Case, D., Papp, B., Bonora, G., Patel, S., Ho, R., Schmidt, R., McKee, R., Sado, T., Tada, T., Meissner, A. and Plath, K.
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Journal Title
Cell
Volume: 159
Issue: 7
Pages: 1681-1697
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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