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非コードDNAの相同染色体の認識と対合における役割

Publicly Offered Research

Project AreaFunctions of non-coding DNA region for genome integrity
Project/Area Number 26114725
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNational Institute of Information and Communications Technology

Principal Investigator

丁 大橋  国立研究開発法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所バイオICT研究室, 主任研究員 (50359080)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥11,050,000 (Direct Cost: ¥8,500,000、Indirect Cost: ¥2,550,000)
Fiscal Year 2015: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2014: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Keywords染色体 / 減数分裂 / 対合 / 分裂酵母 / 非コードDNA
Outline of Annual Research Achievements

減数分裂期前期の相同染色体の相互認識・対合は相同組換えの前提条件で、しかし、相同染色体同士がどのようにお互いに見つけて対合する分子メカニズムはほとんど不明である。申請者が分裂酵母において、減数分裂期に転写され、転写されるsme2遺伝子ローカスに集積する非コードRNA、meiRNAが相同染色体を積極的に繋ぎとめる役割をしていることを発見した。本申請研究では、染色体相互認識における染色体集積RNAの作用機構ならびに分子メカニズムの解明を目的としている。昨年までの研究で、sme2ローカスにドット状集積するSmpタンパク質(sme2 localised proteins)を10個(smp1~10)同定し、そのうち5個がsme2ローカスのロバストな対合に必要であることを明らかにした。このsmpタンパクの特徴はsme2ローカス以外にも染色体上に2~4個ドットを作ることで、それらのドットのローカスがsme2対合サイトと同様に相同染色体の相互認識に寄与する期待が高まる。今年度において、ゲノムワイドlacO/lacI-GFP株ライブラリを用いて候補タンパク質のmCherry標識タンパク質の2重染色株を作り、生細胞蛍光顕微鏡観察により共局在ローカスを二つ同定した。その結果、いずれのローカスもsmpタンパクの結合の高いゲノムローカスで、染色体1と3にそれぞれ一つ存在する。smpタンパク質の破壊株では、これらのローカスの対合が下がったので、smpに依存した対合サイトであることを示唆した。今後、これらのローカスでRNAの転写産物の滞留があるかどうか、さらに対合にどのように貢献するのかを詳しく解析していきたい。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] A cohesion-based platform for homologous chromosome pairing in meiosis2016

    • Author(s)
      Da-Qiao Ding, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
    • Journal Title

      Current Genetics

      Volume: 印刷中 Issue: 3 Pages: 499-502

    • DOI

      10.1007/s00294-016-0570-x

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Meiotic cohesion-based chromosome structure is essential for homologous chromosome pairing in Schizosaccharomyces pombe2015

    • Author(s)
      Ding DQ, Matsuda A, Okamasa K, Nagahama Y, Haraguchi T, Hiraoka Y
    • Journal Title

      Chromosoma

      Volume: special issue Issue: 2 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1007/s00412-015-0551-8

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Highly condensed chromatins are formed adjacent to subtelomeric and decondensed silent chromatin in fission yeast.2015

    • Author(s)
      Matsuda A, Chikashige Y, Ding DQ, Ohtsuki C, Mori C, Asakawa H, Kimura H, Haraguchi T, Hiraoka Y.
    • Journal Title

      Nature Communication

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1038/ncomms8753

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 3D-SIM Analysis of Meiotic Chromosome Structure in Live Cells of S. pombe EMBO Conference on Meiosis2015

    • Author(s)
      丁大橋
    • Organizer
      EMBO Conference on Meiosis
    • Place of Presentation
      オックスフォード大学、イギリス
    • Year and Date
      2015-09-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 相同染色体認識における 非コードDNAの役割2015

    • Author(s)
      丁大橋
    • Organizer
      第9回非コードDNA班会議
    • Place of Presentation
      兵庫県淡路島夢舞台
    • Year and Date
      2015-08-05
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 3D-SIM Analysis of Meiotic Chromosome Structure in Live Cells of S.pombe2015

    • Author(s)
      丁大橋
    • Organizer
      Pombe 2015 8TH INTERNATIONAL FISSION YEAST MEETING
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市生田神社会館
    • Year and Date
      2015-06-22
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A role for chromosomal RNA bodies in fission yeast meiosis2014

    • Author(s)
      平岡 泰
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市みなとみらい
    • Year and Date
      2014-11-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の解析2014

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市みなとみらい
    • Year and Date
      2014-11-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 相同染色体対合における非コードDNAの役割2014

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      新学術領域研究 「ゲノムを支える非コードDNA領域の機能」 2014年第7回領域会議
    • Place of Presentation
      神奈川県湯河原温泉ホテルあかね
    • Year and Date
      2014-07-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe2014

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      Gordon Research Conferences Meiosis
    • Place of Presentation
      Colby-Saweyer College, New London, NH, USA
    • Year and Date
      2014-06-02
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Remarks] Cell Magic

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/index.html

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Remarks] CellMagic

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/

    • Related Report
      2014 Annual Research Report

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Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-28  

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