• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

配列解析によるミトコンドリア由来オルガネラにおける品質管理因子の網羅的探索

Publicly Offered Research

Project Area"Matryoshka"-type evolution of eukaryotes
Project/Area Number 26117733
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

今井 賢一郎  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 人工知能研究センター, 主任研究員 (80442573)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2015: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Keywordsミトコンドリア / ミトコンドリア関連オルガネラ / 品質管理 / タンパク質輸送 / 進化 / 進化解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、ミトコンドリア及びミトコンドリア関連オルガネラ(MRO)を持つ生物種がミトコンドリア品質管理関連因子をどれほど維持しているかを調べ、ミトコンドリアの品質管理機構の進化及びMROの品質管理機構を明らかにすること目的としている。まず、開発した膜タンパク質予測法を用いたMROの品質管理機構の新規因子候補探索と共同研究による実験的検証によって、赤痢アメーバのMROや小胞体局在するに系統特異的膜タンパク質を発見することができた。これらの機能と品質管理機構との関連性についてはさらなる解析が必要である。また、ミトコンドリア及びMROのタンパク質輸送複合体(TOM複合体、TIM23複合体)の進化解析についても成果が得られた。真核生物54種に対するタンパク質輸送複合体のサブユニットの精密なオルソログ解析を行い、Last eukaryotic common ancestor (LECA)におけるTOM、TIM複合体の原始モデルを推定した。このモデルをベースに系統解析、祖先配列推定、構造予測、プレ配列欠損/獲得推定などを用い、TOM、TIM23複合体、プレ配列を持つ遺伝子の進化解析を行ったところ、 (i) TOM複合体のチャネルであるTom40の内孔におけるタンパク質輸送に関わる負電荷パッチや疎水性パッチは、LECAの時点で存在しており、タンパク質輸送の基本的なメカニズムはすでにLECAの時点で確立していた可能性があること、(ii) KinetoplastidsのTIM23複合体では、プレ配列のレセプタとなるTim50は、一度、欠損したが、その後、同じフォールドを持つ別のタンパク質ファミリーからマイグレーションにより代わりの遺伝子を獲得していること、(iii) 輸送複合体の進化は、プレ配列を用いた輸送機構を維持するかどうかが束縛条件となっていることがわかった。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2017 2016 2015 2014

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Origin and Evolutionary Alteration of the Mitochondrial Import System in Eukaryotic Lineages2017

    • Author(s)
      Fukasawa Y, Oda T, Tomii K and Imai K
    • Journal Title

      Mol Biol Evol.

      Volume: 印刷中 Issue: 7 Pages: 1574-1586

    • DOI

      10.1093/molbev/msx096

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Screening and discovery of lineage-specific mitosomal membrane proteins in Entamoeba histolytica.2016

    • Author(s)
      Santos, H. J., Imai, K., Hanadate, Y., Fukasawa, Y., Oda, T., Mi-ichi, F., and Nozaki, T.
    • Journal Title

      Mol. Biochem. Parasitol

      Volume: ? Issue: 1-2 Pages: 10-17

    • DOI

      10.1016/j.molbiopara.2016.01.001

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A novel Mitosomal beta-barrel Outer Membrane Protein in Entamoeba2015

    • Author(s)
      Santos HJ, Imai K, Makiuchi T, Tomii K, Horton P, Nozawa A, Ibrahim M, Tozawa Y, *Nozaki T.
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 5 Issue: 1 Pages: 8545-8545

    • DOI

      10.1038/srep08545

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] MitoFates: Improved Prediction of Mitochondrial Targeting Sequences and Their Cleavage Sites.2015

    • Author(s)
      Fukasawa, Y., Tsuji, J., Fu, S. C., Tomii, K., Horton, P., Imai, K.
    • Journal Title

      Molecular & Cellular Proteomics

      Volume: 14 Issue: 4 Pages: 1113-1126

    • DOI

      10.1074/mcp.m114.043083

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] ミトコンドリアタンパク質膜透装置TOM複合体の祖先モデルの推定と進化解析2016

    • Author(s)
      深沢 嘉紀、小田 俊之、富井 健太郎、今井 賢一郎
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] ミトコンドリアタンパク質膜透装置TOM複合体の独立した進化2016

    • Author(s)
      深沢 嘉紀、小田 俊之、富井 健太郎、今井 賢一郎
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-08
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 真核生物におけるミトコンドリアタンパク質輸送機構の動的な進化2015

    • Author(s)
      深沢 嘉紀、小田 俊之、富井 健太郎、今井 賢一郎
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Dynamic evolution of mitochondrial protein importing system in eukaryotes2015

    • Author(s)
      Fukasawa Y, Oda T, Tomii K and Imai K
    • Organizer
      2nd International symposium & 4th annual research meeting on Matryoshka-type evolution of Eukaryotic cells
    • Place of Presentation
      筑波大学(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2015-10-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Human mitochondrial proteome analysis by novel mitochondrial targeting signal prediction2014

    • Author(s)
      Imai K, Fukasawa Y, Tomii K, Horton P
    • Organizer
      GIW ISCB-ASIA 2014
    • Place of Presentation
      プラザ平成
    • Year and Date
      2014-12-15
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 新規ミトコンドリア局在化シグナル予測手法を用いたヒトのミトコンドリアプロテオーム解析2014

    • Author(s)
      今井 賢一郎、深沢嘉紀、富井健太郎、Paul Horton
    • Organizer
      第14回日本ミトコンドリア学会年会
    • Place of Presentation
      九州大学百年講堂
    • Year and Date
      2014-12-03 – 2014-12-05
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Human mitochondrial proteome analysis by novel mitochondrial targeting signal prediction2014

    • Author(s)
      Imai K, Fukasawa Y, Tomii K, Horton P
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Improved prediction of mitochondrial presequence for detecting undiscovered mitochondrial proteins2014

    • Author(s)
      Imai K, Fukasawa Y, Tomii K, Horton P
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Accurate prediction of mitochondrial presequences and their cleavage sites with MitoFates identifies hundreds of novel human mitochondrial protein candidates2014

    • Author(s)
      Fukasawa Y, Imai K, Tsuji J, Fu SC, Tomii K, Horton P
    • Organizer
      ISMB2014
    • Place of Presentation
      Hynes Convention Center
    • Year and Date
      2014-07-13 – 2014-07-15
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 配列解析によるミトコンドリア関連オルガネラ(MRO)における品質管理因子の網羅的探索2014

    • Author(s)
      今井賢一郎
    • Organizer
      第3回マトリョーシカ型生物学研究会
    • Place of Presentation
      神戸大学百年記念館
    • Year and Date
      2014-07-11 – 2014-07-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi