生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク

• Project Area: Crosstalk of transcriptional control and energy pathways by hub metabolites
• Project/Area Number: 16H01688
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 深水 昭吉 筑波大学, 生命領域学際研究センター, 教授 (60199172)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2017-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2016)
• Budget Amount: ¥3,835,000 (Direct Cost: ¥2,950,000、Indirect Cost: ¥885,000); Fiscal Year 2016: ¥3,835,000 (Direct Cost: ¥2,950,000、Indirect Cost: ¥885,000)
• Keywords: 生命素子 / hub metabolite / エネルギー代謝 / 転写環境 / 転写 / 代謝 / 化学修飾

Outline of Annual Research Achievements

本新学術領域研究「生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御」は、転写と代謝のクロストークを支える分子実体とその制御メカニズムを解明することを目的として、平成23年度に発足した。本年度は、領域として推進してきた研究成果のとりまとめを行った。総括・計画研究9件（平成23年度～平成27年度）、公募研究48件（平成24年度～平成25年度；25件、平成26年度～平成27年度；23件）について、新学術領域研究として行ってきた研究と領域内の交流・連携で生れた共同研究の研究内容とその成果を、領域代表を中心に領域の当初の目的と照らし合わせて議論し、研究成果としてとりまとめた。また、若手研究者の自主的な研究会の実施や若手研究者が数多く受賞される（平成24年度～平成25年度；18件、平成26年度～平成27年度；41件）など、若手研究者ネットワークの形成が加速され、研究の成果に加え多くの領域推進の効果が得られた。
たとえば、領域内若手研究者の情報交換の場の提供として、「第４回発生における代謝を考える会」（2017年2月20日・21日、京都大学）の開催に支援した。本研究会は転写代謝システムの計画班連携研究者である日野信次朗助教（熊本大学）や、公募研究班である林良樹助教らを中心とした若手研究者によって構成され、その設立趣旨は、転写代謝システムの学術的コンセプトを発生という切り口から議論し、情報交換することにある。本年度も22演題の口頭発表が行われ、活発な議論が展開された。本会は多くの若手研究者が集結し研究発表・情報交換を行い、本研究課題にとって大変有意義なものとなった。
領域の5年間の活動を通して得られた成果は、研究成果報告書として冊子化し、領域内外の各方面に配布した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Asymmetric arginine dimethylation modulates mitochondrial energy metabolism and homeostasis in Caenorhabditis elegans. (2017)
  • Author(s): Sha L, Daitoku H, Araoi S, Kaneko Y, Takahashi Y, Kako K, and Fukamizu A.
  • Journal Title: Mol. Cell. Biol. Volume: 37 Issue: 6 Pages: 00504-00516
  • DOI: 10.1128/mcb.00504-16
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Simultaneous ablation of prmt-1 and prmt-5 abolishes asymmetric and symmetric arginine dimethylations in Caenorhabditis elegans. (2017)
  • Author(s): Hirota K., Shigekawa C., Araoi S., Sha L., Inagawa T., Kanou A., Kako K., Daitoku H., and Fukamizu A.
  • Journal Title: J. Biochem. Volume: 印刷中 Issue: 6 Pages: 521-527
  • DOI: 10.1093/jb/mvw101
  • NAID: 40021278532
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] PRMT-5 converts monomethylarginines into symmetrical dimethylarginines in Caenorhabditis elegans. (2017)
  • Author(s): Kanou A., Kako K., Hirota K., and Fukamizu A.
  • Journal Title: J. Biochem. Volume: 161 Issue: 2 Pages: 231-235
  • DOI: 10.1093/jb/mvw066
  • NAID: 40021133516
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Xeroderma pigmentosum group C protein interacts with histones: regulation by acetylated states of histone H3. (2017)
  • Author(s): Kakumu E
  • Journal Title: Genes Cells. Volume: 3 Issue: 3 Pages: 310-327
  • DOI: 10.1111/gtc.12479
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The SETD8/PR-Set7 Methyltransferase Functions as a Barrier to Prevent Senescence-Associated Metabolic Remodeling. (2017)
  • Author(s): Tanaka, H., Takebayashi S. I., Sakamoto, A., Igata, T., Nakatsu, Y., Saitoh, N., Hino, S., and Nakao, M.
  • Journal Title: Cell Rep. Volume: 18 Issue: 9 Pages: 2148-2161
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2017.02.021
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Non-transcriptional function of FOXO1/DAF-16 contributes to translesion DNA synthesis. (2016)
  • Author(s): Daitoku H., Kaneko Y., Yoshimochi K., Matsumoto K., Araoi S., Sakamaki J., Takahashi Y., and Fukamizu A.
  • Journal Title: Mol. Cell. Biol. Volume: 36 Issue: 21 Pages: 2755-2766
  • DOI: 10.1128/mcb.00265-16
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] NML-mediated rRNA base methylation links ribosomal subunit formation to cell proliferation in a p53-dependent manner. (2016)
  • Author(s): Waku T., Nakajima Y., Yokoyama W., Nomura N., Kako K., Kobayashi A., Shimizu T., and Fukamizu A.
  • Journal Title: J. Cell Sci. Volume: 129 Issue: 12 Pages: 2382-2393
  • DOI: 10.1242/jcs.183723
  • NAID: 120007129526
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] NRF2 Is a Key Target for Prevention of Noise-Induced Hearing Loss by Reducing Oxidative Damage of Cochlea (2016)
  • Author(s): Honkura, Y. Matsuo, H. Murakami, S. Sakiyama, M. Mizutari, K. Shiotani, A. Yamamoto, M. Morita, I. Shinomiya, N. Kawase, T. Katori, Y. Motohashi, H.
  • Journal Title: Sci Rep Volume: 6 Issue: 1 Pages: 19329-19329
  • DOI: 10.1038/srep19329
  • NAID: 130005260938
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] The transcription factor Bach2 is phosphorylated at multiple sites in murine B cells but a single site prevents its nuclear localization (2016)
  • Author(s): Ando R, Shima H, Tamahara T, Sato Y, Watanabe-Matsui M, Kato H, Sax N, Motohashi H, Taguchi K, Yamamoto M, Nio M, Maeda T, Ochiai K, Muto A, Igarashi K
  • Journal Title: J Biol Chem Volume: 291 Issue: 4 Pages: 1826-1840
  • DOI: 10.1074/jbc.m115.661702
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] KLF15 Enables Rapid Switching between Lipogenesis and Gluconeogenesis during Fasting. (2016)
  • Author(s): Takeuchi Y, Yahagi N, Aita Y, Murayama Y, Sawada Y, Piao X, Toya N, Oya Y, Shikama A, Takarada A, Masuda Y, Nishi M, Kubota M, Izumida Y, Yamamoto T, Sekiya M, Matsuzaka T, Nakagawa Y, Urayama O, Kawakami Y, Iizuka Y, Gotoda T, Itaka K, Kataoka K, Nagai R, Kadowaki T, Yamada N, Lu Y, Jain MK, and Shimano H
  • Journal Title: Cell Rep. Volume: 16 Issue: 9 Pages: 2373-2386
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2016.07.069
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Novel helical assembly in arginine methyltransferase 8 (2016)
  • Author(s): Toma-Fukai S, Kim JD, Park KE, Kuwabara N, Shimizu N, Krayukhina E, Uchiyama S, Fukamizu A, Shimizu T
  • Journal Title: Journal of Molecular Biology Volume: 428 Issue: 6 Pages: 1197-1208
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2016.02.007
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] KEAP1-NRF2 system in stress responss and cancer malignancy (2017)
  • Author(s): Hozumi Motohashi
  • Organizer: Kumamoto University Advence Research Project A & Program for Advancing Strategic International Networks to Accelerate the Circulation of Talented Researchers, International Symposium
  • Place of Presentation: 熊本大学（熊本県中央区）
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Interaction of DNA damage recognition factors with the chromatin structure. (2017)
  • Author(s): Kaoru Sugasawa
  • Organizer: Japan-Swiss Symposium on "Chromatin Structure and Dynamics"
  • Place of Presentation: Basel (Switzerland)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] タンパク質はmultilingual? (2017)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: 生命の機能とかたち 連携セミナーシリーズ第2回
  • Place of Presentation: 筑波大学総合研究棟(茨城県つくば市)
• [Presentation] Regulatory mechanisms and biological significance of the local production of S-adenosylmethionine for local consumption in nuclei (2016)
  • Author(s): Kazuhiko Igarashi
  • Organizer: 11th Asian Epigenomics Meeting 2016
  • Place of Presentation: Bangalore（インド）
  • Year and Date: 2016-09-30
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 栄養・食品と動脈硬化 (2016)
  • Author(s): 矢作直也
  • Organizer: 第48回日本動脈硬化学会総会・学術集会
  • Place of Presentation: 京王プラザホテル（東京都新宿区）
• [Presentation] Novel helical assembly in arginine methyltransferase 8 (2016)
  • Author(s): Sachiko Toma-Fukai, Jun-Dal Kim, Kyung-Eui Park, Naoyuki Kuwabara, Nobutaka Shimizu , Elena Krayukuhina , Susumu Uchiyama , Akiyoshi Fukamizu, and Toshiyuki Shimizu
  • Organizer: Naito Conference
  • Place of Presentation: Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo（北海道札幌市）
• [Presentation] エネルギー代謝とエピジェネティクス (2016)
  • Author(s): 中尾光善
  • Organizer: 第59回日本糖尿病学会年次学術集会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館（京都府京都市）
• [Presentation] 寿命を動かす代謝の仕組み (2016)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: 第39回日本基礎老化学会大会
  • Place of Presentation: 伊勢原市民文化会館（神奈川県伊勢原市）
  • Invited
• [Presentation] 線虫飢餓モデル・妊娠高血圧症モデル (2016)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: 第5回日本DOHaD研究会学術集会
  • Place of Presentation: 国立成育医療研究センター 講堂（東京都世田谷区）
• [Presentation] TCAサイクルとアセチル化・脱アセチル化による初期発生の調節 (2016)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: 第89回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター（宮城県仙台市）
• [Presentation] Arginine methylation and its conditional roles in vivo: PRMT1 and PRMT8 (2016)
  • Author(s): Akiyoshi Fukamizu
  • Organizer: 11th Asian Epigenomics Meeting 2016
  • Place of Presentation: Bangalore（インド ）
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Arginine methylation:its functional roles and diversity (2016)
  • Author(s): Akiyoshi Fukamizu
  • Organizer: Pharmacology Seminar
  • Place of Presentation: ペンシルベニア（アメリカ合衆国)
• [Presentation] エネルギー代謝と転写制御 (2016)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: 第11回臨床ストレス応答学会大会
  • Place of Presentation: 山口大学医学部霜仁会館(山口県宇部市)
• [Presentation] 心血管系に作用するアルギニンメチル化の機能と多様性 (2016)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: シグナル伝達医学講演会
  • Place of Presentation: 神戸大学医学部(兵庫県神戸市)
• [Presentation] アルギニンメチル化酵素の役割とその多様性 (2016)
  • Author(s): 深水昭吉
  • Organizer: 第39回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
• [Book] 遺伝子制御の新たな主役 栄養シグナル (2016)
  • Author(s): 矢作直也
  • Total Pages: 231
  • Publisher: 羊土社
• [Remarks] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
  • URL: http://tmsystem.tara.tsukuba.ac.jp
• [Remarks] 深水昭吉研究室
  • URL: http://akif2.tara.tsukuba.ac.jp/