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2016 Fiscal Year Research-status Report

染色体オーケストレーションシステム

International Activities Supporting Group

Project AreaChromosome Orchestration System
Project/Area Number 15K21761
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

白髭 克彦  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90273854)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岩崎 博史  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (60232659)
篠原 彰  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (00252578)
深川 竜郎  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (60321600)
Project Period (FY) 2015-11-06 – 2020-03-31
Keywords染色体ダイナミクス / 3次元構造 / 4次元構造 / 染色体構造
Outline of Annual Research Achievements

染色体の構造と機能について、その諸機能の連携と階層性を徹底的に洗い直し、機能統合体として働く仕組み(染色体オーケストレーションシステム)を理解することを目的として、当該分野での我が国の国際的優位性を堅持し、さらなる発展を図るよう研究を遂行してきた。具体的には、我が国の染色体研究の国際的なプレゼンスを高めるため、平成28年度は、本研究の評価者でもあり、共同研究を長年行ってきている、Frank Uhlmann博士(The Francis Crick Institute)、John Diffley 博士(The Francis Crick Institute)、Camilla Sjogren博士(カロリンスカ研究所)を招へいし、イギリスロンドンにて国際班会議を開催した。また国際レクチャーシリーズの開催として、Mills Jason博士(The Children’s Hospital of Philadelphia)、Symington Lorraine博士 (Columbia University Medical Center)、Rothstein Rodney博士(Columbia University)、ASBURY CHARLES博士(University of Washington School of Medicine)、Straight Aaron博士(Stanford University Department of Biochemistry)、Sjogren Camilla博士(Karolinska Institute)を招へいして講演して頂いた。また、SINGH ANNU(Indian Institute of Technology Kanpur)、Donmez Nilsu(Istanbul Tecnical University)の2名の学生の受け入れを行い、NGS技術講習会を2か月にわたって開催した。また、Frank Uhlmann博士, Camilla Sjogren博士, Franz Klein博士, Luis Aragon博士, Ian Krantz博士, Rodrigo Bermejo博士, Charles Boone博士, Ann Donaldson博士, Jan Michael Peter博士s, Susan Gasser博士, Keun Kim博士, Andreas Hochwagen博士, Sung Hee Baek博士, Jan Ellenberg博士らと昨年から引き続き共同研究を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

28年度は予定通り遂行することができた。特に、2017年2月に海外で初の試みとして国際班会議を開催することができた。また、国際レクチャーシリーズも引き続き多くの方に海外研究者ご講演して頂くことができ、共同研究も順調に進めているため、概ね順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

今後も引き続き、海外研究者との交流を通じ、領域研究の重要性をアピールしつつ、共同研究を推進していく予定である。29年度は、6月に国際シンポジウムの開催を予定しており、今後も引き続き国際的な情報発信、さらに技術、人的交流による共同研究を強く推進する予定である。

Causes of Carryover

予定通りおおむね遂行されているが、28年度に予定していた招へい研究者の講演や派遣の研究員のスケジュールに変更が生じたため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度以降も計画通り招へい研究者の講演や、6月に開催される国際会議のための費用や、派遣等に使用する予定である。

  • Research Products

    (22 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 7 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results) Funded Workshop (2 results)

  • [Int'l Joint Research] ニュージャージ医科大学/フィラデルフィア小児病院(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ニュージャージ医科大学/フィラデルフィア小児病院
  • [Int'l Joint Research] オックスフォード大学/アバディーン大学/The Francis Crick Institute(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      オックスフォード大学/アバディーン大学/The Francis Crick Institute
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] カロリンスカ研究所(スウェーデン)

    • Country Name
      SWEDEN
    • Counterpart Institution
      カロリンスカ研究所
  • [Int'l Joint Research] Seoul National 大学/Chun-Ang大学(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      Seoul National 大学/Chun-Ang大学
  • [Int'l Joint Research] MFPL/IMP(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      MFPL/IMP
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      4
  • [Journal Article] Decreased cohesin in the brain leads to defective synapse development and anxiety-related behavior.2017

    • Author(s)
      Fujita Y, Masuda K, Bando M, Nakato R, Katou Y, Tanaka T, Nakayama M, Takao K, Miyakawa T, Tanaka T, Ago Y, Hashimoto H, Shirahige K, Yamashita T.
    • Journal Title

      J Exp Med.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1084/jem.20161517.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Identification of a variant-specific phosphorylation of TH2A during spermiogenesis.2017

    • Author(s)
      Hada M, Masuda K, Yamaguchi K, Shirahige K, Okada Y.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 7 Pages: 46228

    • DOI

      10.1038/srep46228.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] ChIP-seq Analysis of Condensin Complex in Cultured Mammalian Cells.2017

    • Author(s)
      Sakata T, Shirahige K, Sutani T.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 1515 Pages: 257-271.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Recent advances in ChIP-seq analysis: from quality management to whole-genome annotation.2017

    • Author(s)
      Nakato R, Shirahige K.
    • Journal Title

      Brief Bioinform.

      Volume: 18(2) Pages: 279-290

    • DOI

      10.1093/bib/bbw023.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chromatin determinants of the inner-centromere rely on replication factors with functions that impart cohesion.2016

    • Author(s)
      Abe T, Kawasumi R, Arakawa H, Hori T, Shirahige K, Losada A, Fukagawa T, Branzei D.
    • Journal Title

      Oncotarget

      Volume: 7(42) Pages: 67934-67947

    • DOI

      10.18632/oncotarget.11982.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Attaching Accessory Devices to the Replisome.2016

    • Author(s)
      Sutani T, Shirahige K.
    • Journal Title

      Mol Cell.

      Volume: 63(3) Pages: 347-8

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2016.07.017.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Physical Association of Saccharomyces cerevisiae Polo-like Kinase Cdc5 with Chromosomal Cohesin Facilitates DNA Damage Response.2016

    • Author(s)
      Pakchuen S, Ishibashi M, Takakusagi E, Shirahige K, Sutani T.
    • Journal Title

      J Biol Chem.

      Volume: 291(33) Pages: 17228-46

    • DOI

      10.1074/jbc.M116.727438.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Transcriptional regulation by cohesin and its loader2017

    • Author(s)
      Katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      第9回NAGOYAグローバルリトリート
    • Place of Presentation
      愛知健康プラザ、愛知県大府市
    • Year and Date
      2017-02-10 – 2017-02-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA 複製の過去・現在・未来 - ゲノム複製からエピゲノム複製へ2016

    • Author(s)
      白髭克彦
    • Organizer
      岡崎フラグメント50周年シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学、愛知県名古屋市
    • Year and Date
      2016-12-21 – 2016-12-22
    • Invited
  • [Presentation] Transcriptional regulation by cohesin and its loader2016

    • Author(s)
      Katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      CdLS symposium
    • Place of Presentation
      アメリカ、フロリダ
    • Year and Date
      2016-06-21 – 2016-06-27
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 希少疾患と癌、その共通の分子病態から学ぶ転写伸長因子コヒーシンの役割2016

    • Author(s)
      白髭克彦
    • Organizer
      愛知県がんセンターセミナー
    • Place of Presentation
      愛知県がんセンター、愛知県名古屋市
    • Year and Date
      2016-06-10 – 2016-06-10
    • Invited
  • [Presentation] Genetic Link of Human Rare Diseases Identify Regulatory Mechanism of Transcription by Cohesin and its Loader2016

    • Author(s)
      Katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      CIFAR Genetic Network Workshop
    • Place of Presentation
      カナダ、トロント
    • Year and Date
      2016-04-15 – 2016-04-17
    • Invited
  • [Presentation] How cohesin and its loader regulate transcription? Clues from newly identi ed disease andin vitro reconstitution system2016

    • Author(s)
      Katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      トロント大学セミナー
    • Place of Presentation
      カナダ、トロント
    • Year and Date
      2016-04-14 – 2016-04-14
    • Invited
  • [Remarks] 染色体オーケストレーションシステム:染色体OS

    • URL

      http://www.chromosomeos.com/

  • [Funded Workshop] The 4th Meeting on GRANT-IN-AID FOR SCIENTIFIC RESEARCH ON INNOVATIVE AREAS “CHROMOSOME ORCHESTRATION SYSTEM (CHROMOSOME OS)”2017

    • Place of Presentation
      イギリス、ロンドン
    • Year and Date
      2017-02-20 – 2017-02-21
  • [Funded Workshop] The 10th 3R Symposium2016

    • Place of Presentation
      ホテル一畑、島根県松江市
    • Year and Date
      2016-11-13 – 2016-11-17

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-10-18  

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