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2019 Fiscal Year Annual Research Report

3D morphologic

Administrative Group

Project AreaDiscovery of the logic that establishes the 3D structure of organisms
Project/Area Number 15H05856
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

近藤 滋  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (10252503)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 芳賀 永  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (00292045)
秋山 正和  明治大学, 先端数理科学インスティテュート, 特任准教授 (10583908)
松本 健郎  名古屋大学, 工学研究科, 教授 (30209639)
上野 直人  基礎生物学研究所, 形態形成研究部門, 教授 (40221105)
松野 健治  大阪大学, 理学研究科, 教授 (60318227)
武田 洋幸  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (80179647)
井上 康博  京都大学, 工学研究科, 教授 (80442929)
大澤 志津江  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (80515065)
Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywords3D形態形成 / 折り畳み / 回転 / シミュレ―ション / 数理モデル
Outline of Annual Research Achievements

終年度であり、各グループがこれまでの研究成果を統合し、当初の目的に到達できるように努める。総括班費は、各グループ間の交流と、共通機器の運営と消耗品、そのための人件費、成果の公開、に使用した。
主な共通機器は、ライトシート顕微鏡(武田研、上野研)、コンフォーカル顕微鏡(芳賀研)、汎用画像解析ソフトイマリス(松野研)、マイクロCT(近藤研)、3Dプリンター(松本研、秋山研)があり、常に、計画班員、公募班員の仕様が行われており、その回数等は、領域全体の報告書に記載している。
また、理論モデル作成のためのチュートリアル講義を、秋山が年数回行っており、そのための旅費と機材も、総括班費から購入している。
個々の班員の研究業績に関しては、班全体の報告書に譲るが、特に、総括班による班員の交流、共同研究の促進の結果として、若手の多くが昇進、あるいはポストを得たことを強調したい。具体的には、本研究領域の活動5年間で23名の若手研究者が常勤研究職に、18名が非常勤研究職に就いた。領域発足時に39歳以下だった3名の計画研究代表者は、准教授から教授への昇任2名、助教から准教授への昇任1名となった。研究領域内の受賞は、文部科学大臣表彰・若手科学者賞(H28)、第18回守田科学研究奨励賞を始め、国際的な賞1件、国内学会等29件、国内財団等8件となった。
総括班費の繰り越しが生じたが、その理由は、非常に班内での使用に対する要望が強かったマイクロCTに、使用者の責任ではない故障が生じ、修理までの期間に使用することが不可能であったことによる。幸い、修理は無償で行い、約半年の遅れは出たが、班員の要望にほぼ沿う形でマイクロCTの運用を次年度に行うことができた。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (24 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 15 results,  Open Access: 15 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 7 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] コスタリカ大学(コスタリカ)

    • Country Name
      COSTA RICA
    • Counterpart Institution
      コスタリカ大学
  • [Journal Article] Genetical control of 2D pattern and depth of the primordial furrow that prefigures 3D shape of the rhinoceros beetle horn.2020

    • Author(s)
      Adachi H, Matsuda K, Niimi T, Kondo S, Gotoh H.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 10 Pages: 18687

    • DOI

      10.1038/s41598-020-75709-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Method for disarranging the pigment pattern of zebrafish by optogenetics2020

    • Author(s)
      Toshihiro Aramaki, Shigeru Kondo
    • Journal Title

      Dev. Biol.

      Volume: 460 Pages: 12-19

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2018.12.019

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mechanical Stress Regulates Epithelial Tissue Integrity and Stiffness through the FGFR/Erk2 Signaling Pathway during Embryogenesis2020

    • Author(s)
      Kinoshita Noriyuki、Hashimoto Yutaka、Yasue Naoko、Suzuki Makoto、Cristea Ileana M.、Ueno Naoto
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 30 Pages: 3875~3888.e3

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.02.074

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure and development of the complex helmet of treehoppers (Insecta: Hemiptera: Membracidae)2020

    • Author(s)
      Adachi Haruhiko、Matsuda Keisuke、Nishida Kenji、Hanson Paul、Kondo Shigeru、Gotoh Hiroki
    • Journal Title

      Zoological Letters

      Volume: 6 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s40851-020-00155-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Intrauterine Pressures Adjusted by Reichert’s Membrane Are Crucial for Early Mouse Morphogenesis2020

    • Author(s)
      Ueda Yoko、Kimura-Yoshida Chiharu、Mochida Kyoko、Tsume Mami、Kameo Yoshitaka、Adachi Taiji、Lefebvre Olivier、Hiramatsu Ryuji、Matsuo Isao
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 31 Pages: 107637~107637

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.107637

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A chordate species lacking Nodal utilizes calcium oscillation and Bmp for left?right patterning2020

    • Author(s)
      Onuma Takeshi A.、Hayashi Momoko、Gyoja Fuki、Kishi Kanae、Wang Kai、Nishida Hiroki
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 117 Pages: 4188~4198

    • DOI

      10.1073/pnas.1916858117

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Combined deletions of IHH and NHEJ1 cause chondrodystrophy and embryonic lethality in the Creeper chicken2020

    • Author(s)
      Kinoshita Keiji、Suzuki Takayuki、Koike Manabu、Nishida Chizuko、Koike Aki、Nunome Mitsuo、Uemura Takeo、Ichiyanagi Kenji、Matsuda Yoichi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s42003-020-0870-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Regrowth of zebrafish caudal fin regeneration is determined by the amputated length2020

    • Author(s)
      Uemoto Toshiaki、Abe Gembu、Tamura Koji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57533-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Liposomal adhesion via electrostatic interactions and osmotic deflation increase membrane tension and lipid diffusion coefficient2020

    • Author(s)
      Oda Atsushi、Watanabe Chiho、Aoki Natsumi、Yanagisawa Miho
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 16 Pages: 4549~4554

    • DOI

      10.1039/d0sm00416b

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Epithelial tissue folding pattern in confined geometry2019

    • Author(s)
      Inoue Yasuhiro、Tateo Itsuki、Adachi Taiji
    • Journal Title

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      Volume: 19 Pages: 815~822

    • DOI

      10.1007/s10237-019-01249-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Horizontal Boundary Cells, a Special Group of Somitic Cells, Play Crucial Roles in the Formation of Dorsoventral Compartments in Teleost Somite2019

    • Author(s)
      Abe Kota、Shimada Atsuko、Tayama Sayaka、Nishikawa Hotaka、Kaneko Takuya、Tsuda Sachiko、Karaiwa Akari、Matsui Takaaki、Ishitani Tohru、Takeda Hiroyuki
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 27 Pages: 928~939.e4

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.03.068

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Proper direction of male genitalia is prerequisite for copulation in Drosophila, implying cooperative evolution between genitalia rotation and mating behavior2019

    • Author(s)
      Inatomi Momoko、Shin Dongsun、Lai Yi-Ting、Matsuno Kenji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-018-36301-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Tissue self-organization based on collective cell migration by contact activation of locomotion and chemotaxis2019

    • Author(s)
      Fujimori Taihei、Nakajima Akihiko、Shimada Nao、Sawai Satoshi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 4291~4296

    • DOI

      10.1073/pnas.1815063116

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Precise staging of beetle horn formation in Trypoxylus dichotomus reveals the pleiotropic roles of doublesex depending on the spatiotemporal developmental contexts2019

    • Author(s)
      Morita Shinichi、Ando Toshiya、Maeno Akiteru、Mizutani Takeshi、Mase Mutsuki、Shigenobu Shuji、Niimi Teruyuki
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 15 Pages: -

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1008063

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Produce, carry/position, and connect: morphogenesis using rigid materials2019

    • Author(s)
      Funayama Noriko
    • Journal Title

      Current Opinion in Genetics & Development

      Volume: 57 Pages: 91~97

    • DOI

      10.1016/j.gde.2019.08.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] KT model and the Origami Method to form the beetle horn2019

    • Author(s)
      近藤 滋
    • Organizer
      Titisee meeting, Titisee, ドイツ
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CUBE IN A CHIP: ONE TOUCH 3D TISSUE INTEGRATION AND REMOVBAL SYSTEM FOR BODY ON A CHIP PLATFORM2019

    • Author(s)
      萩原 将也
    • Organizer
      The 23rd International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, Basel
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Comparative Anatomy of Ascidian Miniature Tailbud2019

    • Author(s)
      堀田 耕司
    • Organizer
      10th International Tunicate Meeting,villefranche sur mer、France
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Collective Movement and 3D Morphology of Epithelial Cells on Viscoelastic Substrates2019

    • Author(s)
      芳賀 永
    • Organizer
      GSS International Symposium(invited speaker),札幌
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] PHYSICAL MODELING OF FORMATION OF CELLULAR ORGANELLE2019

    • Author(s)
      立川 正志
    • Organizer
      4th Africa International Biotechnology and Biomedical Conference, Mombasa Kenya
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Membrane adhesion of liposomes increases membrane tension and regulates in-membrane molecular diffusion2019

    • Author(s)
      柳澤 実穂
    • Organizer
      The 5th International Soft Matter Conference (ISMC2019), Edinburgh, United Kingdom
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Re-patterning and re-sizing in regeneration of vertebrate appendages2019

    • Author(s)
      田村 宏治
    • Organizer
      EMBL Barcelona, Barcelona, Spain,
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 3Dmorphologic 生命の3D形態を構築するロジック

    • URL

      http://www.3d-logic.jp/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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