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2016 Fiscal Year Annual Research Report

染色体オーケストレーションシステム

Administrative Group

Project AreaChromosome Orchestration System
Project/Area Number 15H05970
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

白髭 克彦  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90273854)

Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywordsゲノム / 発現制御 / 生体生命情報学
Outline of Annual Research Achievements

本領域では、染色体の3次元構造の再構築と4次元情報の取得を通じて、染色体機能の調和の仕組み(染色体オーケストレーションシステム)を理解することを目指している。今年度は昨年度に引き続き、1)連携研究の促進として互いの情報と技術を生かした多くの共同研究を実施した(下記参照)。2)総括班会議と国際班会議の開催を2016年7月と2017年2月に開催し、研究者間での進捗状況報告や情報交換等を行った。特に2017年2月はイギリスロンドンにて班会議を初めて行うことができた。3)広報活動としてHPの更新は、論文採録の情報の発信、セミナー情報の公開、班会議の報告、サイエンスカフェの告知等を常に行い、積極的に情報発信を行った。また、公募班員も新たに加わり、研究推進を進めていった。4)アウトリーチ活動として、昨年同様高校生向けに研究室訪問の受け入れ及び出前授業を行った。また本年度は初めての試みとしてサイエンスカフェを開催した。
連携研究として特筆すべきものは以下の通り。平野・大杉-岡田:平野が調整したヒストンシャペロン(ヌクレオプラスミン)を用い、大杉との技術提携によって、マウス精子核中に残存するヒストンの種類と結合部位を同定する方法を確立。篠原‐岡田:篠原が酵母で見出した現象をマウス生殖細胞で確認するために、マウス生殖細胞への遺伝子導入やex vivo培養などの技術提携を行った。深川-平野:モデル化染色体作成に向けて、in-vitroで作成された染色体へセントロメア集合の研究を展開中。今井‐篠原:生化学による解析の共同研究を展開中。伊藤ー深川:深川らが構築したネオセントロメアを含む細胞株を用いて、伊藤と共同で4D解析を行い、セントロメアクロマチンと結合するゲノム部位の特定を行った。今井-白髭:Hi-C、白髭-伊藤-中井:Hi-C解析技法についての共同研究を、白髭-広田:M期における染色体高次構造の研究を展開中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画通りに成果を上げつつ順調に進んでいる。
理由としては、連携研究が数多くなされていること、国際班会議の開催、国際共同研究を行っている海外研究者によるセミナー講演の積極的開催、HP上での活動報告、アウトリーチ活動の一つとしてサイエンスカフェの開催など、活発に領域研究を展開し、それと同時に一般の国民に向けて情報発信を行うことが出来た。

Strategy for Future Research Activity

当初の計画通り進めていく予定である。
今後は、6月には国際会議の開催、9月には班会議を開催所定であり、引き続き、国際的な情報交換や意見交換を積極的に行う予定である。

  • Research Products

    (21 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 7 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results) Funded Workshop (2 results)

  • [Int'l Joint Research] ニュージャージ医科大学/フィラデルフィア小児病院(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ニュージャージ医科大学/フィラデルフィア小児病院
  • [Int'l Joint Research] オックスフォード大学/アバディーン大学/The Francis Crick Institute(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      オックスフォード大学/アバディーン大学/The Francis Crick Institute
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] カロリンスカ研究所(スウェーデン)

    • Country Name
      SWEDEN
    • Counterpart Institution
      カロリンスカ研究所
  • [Int'l Joint Research] Seoul National大学/Chung-Ang大学(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      Seoul National大学/Chung-Ang大学
  • [Int'l Joint Research] MFPL/IMP(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      MFPL/IMP
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      4
  • [Journal Article] Decreased cohesin in the brain leads to defective synapse development and anxiety-related behavior.2017

    • Author(s)
      Fujita Y, Masuda K, Bando M, Nakato R, Katou Y, Tanaka T, Nakayama M, Takao K, Miyakawa T, Tanaka T, Ago Y, Hashimoto H, Shirahige K, Yamashita T.
    • Journal Title

      J Exp Med.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1084/jem.20161517.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Identification of a variant-specific phosphorylation of TH2A during spermiogenesis.2017

    • Author(s)
      Hada M, Masuda K, Yamaguchi K, Shirahige K, Okada Y.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 7 Pages: 46228

    • DOI

      10.1038/srep46228.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] ChIP-seq Analysis of Condensin Complex in Cultured Mammalian Cells.2017

    • Author(s)
      Sakata T, Shirahige K, Sutani T.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 1515 Pages: 257-271.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Recent advances in ChIP-seq analysis: from quality management to whole-genome annotation.2017

    • Author(s)
      Nakato R, Shirahige K.
    • Journal Title

      Brief Bioinform.

      Volume: 18(2) Pages: 279-290.

    • DOI

      10.1093/bib/bbw023.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chromatin determinants of the inner-centromere rely on replication factors with functions that impart cohesion.2016

    • Author(s)
      Abe T, Kawasumi R, Arakawa H, Hori T, Shirahige K, Losada A, Fukagawa T, Branzei D.
    • Journal Title

      Oncotarget.

      Volume: 7(42) Pages: 67934-67947.

    • DOI

      10.18632/oncotarget.11982.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Attaching Accessory Devices to the Replisome.2016

    • Author(s)
      Sutani T, Shirahige K.
    • Journal Title

      Mol Cell.

      Volume: 63(3) Pages: 347-8

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2016.07.017.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Physical Association of Saccharomyces cerevisiae Polo-like Kinase Cdc5 with Chromosomal Cohesin Facilitates DNA Damage Response.2016

    • Author(s)
      Pakchuen S, Ishibashi M, Takakusagi E, Shirahige K, Sutani T.
    • Journal Title

      J Biol Chem.

      Volume: 291(33) Pages: 17228-46.

    • DOI

      10.1074/jbc.M116.727438.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Transcriptional regulation by cohesin and its loader2017

    • Author(s)
      katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      第9回NAGOYAグローバルリトリート
    • Place of Presentation
      愛知健康プラザ、愛知県大府市
    • Year and Date
      2017-02-10 – 2017-02-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA 複製の過去・現在・未来 - ゲノム複製からエピゲノム複製へ2016

    • Author(s)
      白髭克彦
    • Organizer
      岡崎フラグメント50周年シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学、愛知県名古屋市
    • Year and Date
      2016-12-21 – 2016-12-22
    • Invited
  • [Presentation] Transcriptional regulation by cohesin and its loader2016

    • Author(s)
      katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      CdLS symposium
    • Place of Presentation
      アメリカ、フロリダ
    • Year and Date
      2016-09-06 – 2016-09-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 希少疾患と癌、その共通の分子病態から学ぶ転写伸長因子コヒーシンの役割2016

    • Author(s)
      白髭克彦
    • Organizer
      愛知県がんセンター セミナー
    • Place of Presentation
      愛知県がんセンター、愛知県名古屋市
    • Year and Date
      2016-06-10 – 2016-06-10
    • Invited
  • [Presentation] How cohesin and its loader regulate transcription? Clues from newly identi ed disease andin vitro reconstitution system2016

    • Author(s)
      katsuhiko Shirahige
    • Organizer
      トロント大学のセミナー
    • Place of Presentation
      カナダ、トロント
    • Year and Date
      2016-04-14 – 2016-04-14
    • Invited
  • [Remarks] 染色体オーケストレーションシステム

    • URL

      http://www.chromosomeos.com/

  • [Funded Workshop] The 4th Meeting on GRANT-IN-AID FOR SCIENTIFIC RESEARCH ON INNOVATIVE AREAS “CHROMOSOME ORCHESTRATION SYSTEM (CHROMOSOME OS)”2017

    • Place of Presentation
      イギリス、ロンドン
    • Year and Date
      2017-02-20 – 2017-02-21
  • [Funded Workshop] The 10th 3R Symposium2016

    • Place of Presentation
      ホテル一畑、島根県松江市
    • Year and Date
      2016-11-13 – 2016-11-17

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-10-18  

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