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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Systems Science of Bio-Navigation

Administrative Group

Project AreaSystems Science of Bio-navigation
Project/Area Number 16H06535
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

橋本 浩一  東北大学, 情報科学研究科, 教授 (80228410)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 木村 幸太郎  大阪大学, 理学研究科, 招へい教授 (20370116)
妻木 勇一  山形大学, 大学院理工学研究科, 教授 (50270814)
竹内 一郎  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (40335146)
前川 卓也  大阪大学, 情報科学研究科, 准教授 (50447025)
玉木 徹  広島大学, 工学研究科, 准教授 (10333494)
依田 憲  名古屋大学, 環境学研究科, 教授 (10378606)
高橋 晋  同志社大学, 脳科学研究科, 教授 (20510960)
飛龍 志津子  同志社大学, 生命医科学部, 教授 (70449510)
小川 宏人  北海道大学, 理学研究院, 教授 (70301463)
Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywords行動生態 / ロボティクス / 知識発見 / データマイニング
Outline of Annual Research Achievements

領域運営協議:計画研究代表者による領域運営会議を開催し、領域全体としての計画や実施方法などに関して議論した。
技術的支援:A01制御工学:橋本G、前川G、依田Gの共同研究を支援し、イベント駆動型防水ログボットによるデータ収集を行った。A02データ科学:竹内 G、前川Gと依田G、飛龍G、高橋G、小川G、木村Gの共同研究を支援し、海鳥、線虫、コオロギなどの動物のナビゲーション解析が可能な機械学習プログラムを開発し、これらの成果は論文として発表済み、あるいは投稿中である。
融合的若手研究者育成支援:領域の共通技術に関して統計解析相談会,イベント駆動型ログボット講習会,深層学習による軌跡分析ツール講習会,無線マイコン講習会、若手横断合宿を実施した。
各分野の学会への組織的な展開:本領域の融合研究のための体制を領域外の関連分野研究者にも広げるため、下記の企画を実施した。領域主催国際シンポジウム(International Symposium on Systems Science of Bio-Navigation 2018@同志社大)、国際会議(HCII2018招待セッション@米国、BiRD2019@京都国際会館)および国内学会(日本動物学会公募シンポジウム「システム科学的アプローチで迫る動物ナビゲーション」(北海道胆振東部地震により大会中止)、日本生態学会シンポジウム「生物移動に対する新たな挑戦」2019年3月19日@神戸)における企画セッションの運営、各学会論文誌・学会誌における連載・特集号(3件:日本ロボット学会誌、生物の科学遺伝、Advanced Robotics)。
広報活動:領域からの研究成果および上項目での分野融合的な取り組みの成果を、領域ウェブ、フェイスブック、ツイッターで発表した。また、サイエンスカフェ、テレビ報道などのアウトリーチ活動を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

計画班としての統合的な取り組みの成果として、イベント駆動型ログボットの稼働、さまざまなデータ分析手法の確立が実現し、多様な動物に対するナビゲーションの数理モデルが作成され、これらの成果が論文として発表され始めた。すなわち、「共通化された技術による動物ナビゲーションの測定と分析」が大型融合プロジェクトとして実現してきている。

Strategy for Future Research Activity

領域運営協議:計画研究代表者による領域運営会議を開き、領域全体としての計画や実施方法などに関して議論する。なお、領域運営会議は、領域会議や若手合宿と併せて適宜開催する。特に2019年度は2期目の公募班に対して4月からヒアリングや共同研究マッチングを行うなどして、これまで以上に領域内融合研究を進める予定である。
技術支援班:より高度かつ幅広い融合研究を可能とするため、これまでに提供してきた技術を下記の通りさらに進展させる。A01橋本:刺激によるフィード バック介入装置を備えるロガー開発・提供。A01妻木: マイクロ発電システム及び各種無線システムの信頼性・耐久性向上を主眼とした開発・提供。A02竹内: 動物,ヒト,自動車の経路データからのイベント検出とその統計的信頼性保証。A02前川:イベント駆動型ロガーのためのイベント駆動ロジック生成プログラムの提供および深層学習を用いた軌跡分析のWebプラットフォーム提供。A02玉木:ロ ガー映像解析による生物・環境情報抽出。パターン認識技術による多次元データ解析。
融合的若手研究者育成支援班:これまでと同様に若手合宿や若手弟子入り、基礎知識勉強会を開催する。弟子入りに関しては、実現性を考慮し、短期間の滞在 を想定した支援を行う(短期間・複数回の滞在など)。
学術企画班:年次領域会議・国際シンポジウム・ワークショップ・各学会におけるシンポジウムを開催する。特に2019年度は、Neuro2019(第42回日本神経科学大会 第62回日本神経化学会大会)において、計画研究代表者木村をオーガナイザーとしたシンポジウム「データ駆動型/モデル駆動型神経科学研究の幕開け」で、米国Janelia研究所のAlice Robie博士の招へい講演を予定している。
広報活動班:これまでと同様に広報活動(ウェブ、マガジン、ニュース、アウトリーチ)を積極的に進める。

  • Research Products

    (29 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (27 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 27 results,  Open Access: 8 results) Remarks (1 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Journal Article] Female-biased stranding in Magellanic penguins2019

    • Author(s)
      Yamamoto Takashi、Yoda Ken、Blanco Gabriela S.、Quintana Flavio
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 29 Pages: R12~R13

    • DOI

      10.1016/j.cub.2018.11.023

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Context-based semantical vector representations for animal trajectories2019

    • Author(s)
      Ardakani Ilya、Hashimoto Koichi、Yoda Ken
    • Journal Title

      Advanced Robotics

      Volume: 33 Pages: 118~133

    • DOI

      10.1080/01691864.2019.1573704

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient learning algorithm for sparse subsequence pattern-based classification and applications to comparative animal trajectory data analysis2019

    • Author(s)
      Sakuma Takuto、Nishi Kazuya、Kishimoto Kaoru、Nakagawa Kazuya、Karasuyama Masayuki、Umezu Yuta、Kajioka Shinsuke、Yamazaki Shuhei J.、Kimura Koutarou D.、Matsumoto Sakiko、Yoda Ken、Fukutomi Matasaburo、Shidara Hisashi、Ogawa Hiroto、Takeuchi Ichiro
    • Journal Title

      Advanced Robotics

      Volume: 33 Pages: 134~152

    • DOI

      10.1080/01691864.2019.1571438

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Markerless visual servo control of a servosphere for behavior observation of a variety of wandering animals2019

    • Author(s)
      Iwatani Yasushi、Ogawa Hiroto、Shidara Hisashi、Sakura Midori、Sato Takuya、Hojo Masaru K.、Honma Atsushi、Tsurui-Sato Kaori
    • Journal Title

      Advanced Robotics

      Volume: 33 Pages: 183~194

    • DOI

      10.1080/01691864.2019.1570334

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ultrasound navigation based on minimally designed vehicle inspired by the bio-sonar strategy of bats2019

    • Author(s)
      Yamada Yasufumi、Ito Kentaro、Tsuji Takumi、Otani Kohei、Kobayashi Ryo、Watanabe Yoshiaki、Hiryu Shizuko
    • Journal Title

      Advanced Robotics

      Volume: 33 Pages: 169~182

    • DOI

      10.1080/01691864.2019.1573470

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neuronal, mathematical, and molecular bases of perceptual decision-making in C. elegans2019

    • Author(s)
      Tanimoto Yuki、Kimura Koutarou D.
    • Journal Title

      Neuroscience Research

      Volume: 140 Pages: 3~13

    • DOI

      10.1016/j.neures.2018.10.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Can AI predict animal movements? Filling gaps in animal trajectories using inverse reinforcement learning2018

    • Author(s)
      Hirakawa Tsubasa、Yamashita Takayoshi、Tamaki Toru、Fujiyoshi Hironobu、Umezu Yuta、Takeuchi Ichiro、Matsumoto Sakiko、Yoda Ken
    • Journal Title

      Ecosphere

      Volume: 9 Pages: e02447~e02447

    • DOI

      10.1002/ecs2.2447

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spatiotemporal Learning of Dynamic Gestures from 3D Point Cloud Data2018

    • Author(s)
      Owoyemi Joshua、Hashimoto Koichi
    • Journal Title

      Proceedings - IEEE International Conference on Robotics and Automation

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1109/ICRA.2018.8460910

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A full-color single-chip-DLP projector with an embedded 2400-fps homography warping engine2018

    • Author(s)
      Kagami Shingo、Hashimoto Koichi
    • Journal Title

      ACM SIGGRAPH 2018 Emerging Technologies, SIGGRAPH 2018

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1145/3214907.3214927

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Accurate Object Pose Estimation Using Depth Only2018

    • Author(s)
      Li Mingyu、Hashimoto Koichi
    • Journal Title

      Sensors

      Volume: 18 Pages: 1045~1045

    • DOI

      10.3390/s18041045

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Homogeneous light transport matrix estimation based 3D shape measurement2018

    • Author(s)
      Chiba Naoya、Hashimoto Koichi
    • Journal Title

      International Journal of Mechatronics and Automation

      Volume: 6 Pages: 63~63

    • DOI

      10.1504/IJMA.2018.094476

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Understanding Animal Behavior Using Their Trajectories2018

    • Author(s)
      Ardakani Ilya、Hashimoto Koichi、Yoda Ken
    • Journal Title

      Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)

      Volume: - Pages: 3~22

    • DOI

      10.1007/978-3-319-91131-1_1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Understanding Colour Tuning Rules and Predicting Absorption Wavelengths of Microbial Rhodopsins by Data-Driven Machine-Learning Approach2018

    • Author(s)
      Karasuyama Masayuki、Inoue Keiichi、Nakamura Ryoko、Kandori Hideki、Takeuchi Ichiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-018-33984-w

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bayesian-Driven First-Principles Calculations for Accelerating Exploration of Fast Ion Conductors for Rechargeable Battery Application2018

    • Author(s)
      Jalem Randy、Kanamori Kenta、Takeuchi Ichiro、Nakayama Masanobu、Yamasaki Hisatsugu、Saito Toshiya
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-018-23852-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bio-logging and navigation of marine animals2018

    • Author(s)
      YODA KEN
    • Journal Title

      Japanese Journal of Animal Psychology

      Volume: 68 Pages: 49~56

    • DOI

      10.2502/janip.68.1.3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insights into the Foraging Behavior of Magellanic Penguins (Spheniscus magellanicus)2018

    • Author(s)
      Gomez-Laich Agustina、Yoda Ken、Quintana Flavio
    • Journal Title

      Waterbirds

      Volume: 41 Pages: 332~336

    • DOI

      10.1675/063.041.0315

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Individual differences in heart rate reveal a broad range of autonomic phenotypes in a free-living seabird population2018

    • Author(s)
      Muller Martina S.、Vyssotski Alexei L.、Yamamoto Maki、Yoda Ken
    • Journal Title

      The Journal of Experimental Biology

      Volume: 221 Pages: jeb182758

    • DOI

      10.1242/jeb.182758

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Advances in bio-logging techniques and their application to study navigation in wild seabirds2018

    • Author(s)
      Yoda Ken
    • Journal Title

      Advanced Robotics

      Volume: 33 Pages: 108~117

    • DOI

      10.1080/01691864.2018.1553686

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multisensory enhancement of burst activity in an insect auditory neuron2018

    • Author(s)
      Someya Makoto、Ogawa Hiroto
    • Journal Title

      Journal of Neurophysiology

      Volume: 120 Pages: 139~148

    • DOI

      10.1152/jn.00798.2017

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detecting Door Events Using a Smartphone via Active Sound Sensing2018

    • Author(s)
      Dissanayake Thilina、Maekawa Takuya、Amagata Daichi、Hara Takahiro
    • Journal Title

      Proceedings of the ACM on Interactive, Mobile, Wearable and Ubiquitous Technologies

      Volume: 2 Pages: 1~26

    • DOI

      https://doi.org/10.1145/3287038

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Estimating the Physical Distance between Two Locations with Wi-Fi Received Signal Strength Information Using Obstacle-aware Approach2018

    • Author(s)
      Nakatani Tomoya、Maekawa Takuya、Shirakawa Masumi、Hara Takahiro
    • Journal Title

      Proceedings of the ACM on Interactive, Mobile, Wearable and Ubiquitous Technologies

      Volume: 2 Pages: 1~26

    • DOI

      https://doi.org/10.1145/3264940

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bats enhance their call identities to solve the cocktail party problem2018

    • Author(s)
      Hase Kazuma、Kadoya Yukimi、Maitani Yosuke、Miyamoto Takara、Kobayasi Kohta I、Hiryu Shizuko
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 1 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0045-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Organization of projection from brainstem auditory nuclei to the inferior colliculus of Japanese house bat (Pipistrellus abramus)2018

    • Author(s)
      Ito Tetsufumi、Furuyama Takafumi、Hase Kazuma、Kobayasi Kohta I.、Hiryu Shizuko
    • Journal Title

      Brain and Behavior

      Volume: 8 Pages: e01059~e01059

    • DOI

      10.1002/brb3.1059

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Adaptive frequency shifts of echolocation sounds in Miniopterus fuliginosus according to the frequency-modulated pattern of jamming sounds2018

    • Author(s)
      Maitani Yosuke、Hase Kazuma、Kobayasi Kohta I.、Hiryu Shizuko
    • Journal Title

      The Journal of Experimental Biology

      Volume: - Pages: jeb.188565

    • DOI

      10.1242/jeb.188565

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Hippocampal Ensemble Code for Spatial Navigation and Episodic Memory2018

    • Author(s)
      Takahashi Susumu
    • Journal Title

      Advances in Neurobiology

      Volume: - Pages: 49~70

    • DOI

      10.1007/978-3-319-94593-4_3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Whale rover moving along the surface of sperm whale2018

    • Author(s)
      Tsuchiya Kosuke、Tsumaki Yuichi、Mori Kyoichi、Okamoto Ryosuke
    • Journal Title

      Advanced Robotics

      Volume: 33 Pages: 195~206

    • DOI

      10.1080/01691864.2018.1555058

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neural Mechanisms of Animal Navigation2018

    • Author(s)
      Kimura Koutarou D.、Sato Masaaki、Sakura Midori
    • Journal Title

      Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)

      Volume: - Pages: 65~81

    • DOI

      10.1007/978-3-319-91131-1_5

    • Peer Reviewed
  • [Remarks] 新学術領域研究 生物移動情報学

    • URL

      http://navi-science.org/

  • [Funded Workshop] Symposium on Systems Science of Bio-Navigation 20182018

URL: 

Published: 2019-12-27  

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