• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2020 Fiscal Year Annual Research Report

Integrative understanding of biological signaling networks based on mathematical science

Administrative Group

Project AreaIntegrative understanding of biological signaling networks based on mathematical science
Project/Area Number 16H06573
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

武川 睦寛  東京大学, 医科学研究所, 教授 (30322332)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 貴  大阪大学, 数理・データ科学教育研究センター, 特任教授(常勤) (40114516)
井上 純一郎  東京大学, 医科学研究所, 特任研究員 (70176428)
Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywordsシグナル伝達 / 数理科学 / 情報科学 / オミクス解析 / 構造生物学 / ケミカルバイオロジー / タンパク質 / システムズバイオロジー
Outline of Annual Research Achievements

本領域では、生命科学および数理科学研究者が連携して、実験と理論を融合させる事により、細胞内シグナル伝達ネットワークと生命機能制御の基本原理、及びその破綻がもたらす疾患を統合的に解き明かす新たな学術分野「数理シグナル」を創出する事を目標としている。総括班では、異分野連携を促進し、領域内の共同研究を効率よく生み出し、深化させる為のシステムを構築した。
【計画班合同会議・領域推進会議】COVID-19の影響により、今年度はオンライン会議とし、計画・公募班員全員が発表を行った。この会議では、各自の研究成果・方法を共有すると共に、研究進捗状況を確認して領域の運営方針を周知した。また、領域会議には班員の研究室に所属する若手研究者の参加を促し、若手育成の機会とした。一方で、合宿形式で行ってきた若手ワークショップは感染防御の観点から中止した。【異分野相談窓口】数理解析、質量分析、プロテインアレイ・分子間相互作用、システム生物学・数理モデル、構造解析の各相談窓口を設置し、班員が学際的研究を遂行しやすい体制を構築した。【Web討論・情報交換】ホームページ上に、班員間の自由な討論や情報交換の場を設定し、恒常的な研究者間の連携を図った。また、コロナ禍においても班員間の情報共有と共同研究を遅滞なく推進するため、班員専用ページ内に班員全員が研究進捗状況の纏め(未発表データを含む)を掲載し、いつでも相互確認出来る様にした。【広報活動】Webサイトの構築やニュースレターの配布等により、領域の研究成果を広く発信した。【国内・国際シンポジウム】米国、欧州、アジアの研究者にも参加して頂き、3日間に渡る国際会議をオンラインで実施した。また国内学会でもシンポジウムを3回実施した【数理解析ワーキンググループ研修会】生物系研究者および数理科学者が共同してシグナル伝達の数理解析を実際に体験し、その活用法を学ぶ機会を設けた。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (27 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] German Cancer Research Center(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      German Cancer Research Center
  • [Int'l Joint Research] Johns Hopkins School of Medicine/MD Anderson Cancer Center/Vanderbilt University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Johns Hopkins School of Medicine/MD Anderson Cancer Center/Vanderbilt University
  • [Int'l Joint Research] セントアンドリューズ大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      セントアンドリューズ大学
  • [Int'l Joint Research] INRIAボルドー南西研究センター(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      INRIAボルドー南西研究センター
  • [Journal Article] Stress-responsive MTK1 SAPKKK serves as a redox sensor that mediates delayed and sustained activation of SAPKs by oxidative stress2020

    • Author(s)
      Matsushita Moe、Nakamura Takanori、Moriizumi Hisashi、Miki Hiroaki、Takekawa Mutsuhiro
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 6 Pages: 1

    • DOI

      10.1126/sciadv.aay9778

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Prohibitin-1 Contributes to Cell-to-Cell Transmission of Herpes Simplex Virus 1 via the MAPK/ERK Signaling Pathway2020

    • Author(s)
      Watanabe Mizuki、Arii Jun、Takeshima Kosuke、Fukui Ayano、Shimojima Masayuki、Kozuka-Hata Hiroko、Oyama Masaaki、Minamitani Takeharu、Yasui Teruhito、Kubota Yuji、Takekawa Mutsuhiro、Kosugi Isao、Maruzuru Yuhei、Koyanagi Naoto、Kato Akihisa、Mori Yasuko、Kawaguchi Yasushi
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 95 Pages: -

    • DOI

      10.1128/JVI.01413-20

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Small Molecule Inhibitors of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Fusion by Targeting Cavities on Heptad Repeat Trimers2020

    • Author(s)
      Kandeel Mahmoud、Yamamoto Mizuki、Al-Taher Abdulla、Watanabe Aya、Oh-hashi Kentaro、Park Byoung Kwon、Kwon Hyung-Joo、Inoue Jun-ichiro、Al-Nazawi Mohammed
    • Journal Title

      Biomolecules & Therapeutics

      Volume: 28 Pages: 311~319

    • DOI

      10.4062/biomolther.2019.202

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural analysis of TIFA: Insight into TIFA-dependent signal transduction in innate immunity2020

    • Author(s)
      Nakamura Teruya、Hashikawa Chie、Okabe Kohtaro、Yokote Yuya、Chirifu Mami、Toma-Fukai Sachiko、Nakamura Narushi、Matsuo Mihoko、Kamikariya Miho、Okamoto Yoshinari、Gohda Jin、Akiyama Taishin、Semba Kentaro、Ikemizu Shinji、Otsuka Masami、Inoue Jun-ichiro、Yamagata Yuriko
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-020-61972-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] System-Wide Analysis of Protein Acetylation and Ubiquitination Reveals a Diversified Regulation in Human Cancer Cells2020

    • Author(s)
      Kozuka-Hata Hiroko、Kitamura Aya、Hiroki Tomoko、Aizawa Aiko、Tsumoto Kouhei、Inoue Jun-ichiro、Oyama Masaaki
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 411~411

    • DOI

      10.3390/biom10030411

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TIFAB Regulates USP15-Mediated p53 Signaling during Stressed and Malignant Hematopoiesis2020

    • Author(s)
      Niederkorn Madeline、Hueneman Kathleen、Choi Kwangmin、Varney Melinda E.、Romano Laurel、Pujato Mario A.、Greis Kenneth D.、Inoue Jun-ichiro、Meetei Ruhikanta、Starczynowski Daniel T.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 30 Pages: -

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.01.093

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] EXOSC9 depletion attenuates P-body formation, stress resistance, and tumorigenicity of cancer cells2020

    • Author(s)
      Yoshino Seiko、Matsui Yusuke、Fukui Yuya、Seki Masahide、Yamaguchi Kiyoshi、Kanamori Akane、Saitoh Yurika、Shimamura Teppei、Suzuki Yutaka、Furukawa Yoichi、Kaneko Shuichi、Seiki Motoharu、Murakami Yoshinori、Inoue Jun-ichiro、Sakamoto Takeharu
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-020-66455-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Anticoagulant Nafamostat Potently Inhibits SARS-CoV-2 S Protein-Mediated Fusion in a Cell Fusion Assay System and Viral Infection In Vitro in a Cell-Type-Dependent Manner2020

    • Author(s)
      Yamamoto Mizuki、Kiso Maki、Sakai-Tagawa Yuko、Iwatsuki-Horimoto Kiyoko、Imai Masaki、Takeda Makoto、Kinoshita Noriko、Ohmagari Norio、Gohda Jin、Semba Kentaro、Matsuda Zene、Kawaguchi Yasushi、Kawaoka Yoshihiro、Inoue Jun-ichiro
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 12 Pages: 629~629

    • DOI

      10.3390/v12060629

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Regulation of stress-induced apoptotic cell death by stress granule formation2021

    • Author(s)
      Mutsuhiro Takekawa
    • Organizer
      OIST seminar
    • Invited
  • [Presentation] Spatio-temporal dynamics of SAPKK regulates cell fate decisions under stress conditions2020

    • Author(s)
      Mutsuhiro Takekawa
    • Organizer
      JSPS Core-to-Core Program “Establishing International Research Network of Mathematical Oncology"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mathematical modeling of the recruitment of centriole biogenesis regulators to mother centrioles in the S-phase2020

    • Author(s)
      Nakamura T, Nishizumi-Tokai N, Nakazawa T, Mori T, Suzuki T, Takekawa M
    • Organizer
      JSPS Core-to-Core Program “Establishing International Research Network of Mathematical Oncology”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ERKシグナル誘導遺伝子による細胞機能制御と発癌2020

    • Author(s)
      武川睦寛
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 新規酸化ストレスセンサー分子によるp38/JNKシグナルとサイトカイン産生の制御2020

    • Author(s)
      武川睦寛
    • Organizer
      MBSJ2020、第43回日本分子生物学会年会ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] 数理解析に基づくMAPKシグナルと生命機能制御機構の解明2020

    • Author(s)
      武川睦寛
    • Organizer
      令和2年度新学術領域研究数理シグナル領域推進会議
    • Invited
  • [Presentation] DNA損傷に応答するSAPKシグナル伝達機構の解析2020

    • Author(s)
      塩崎ゆかり、久保田裕二、武川睦寛
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] カスパーゼ依存的蛋白質切断によるERKシグナル抑制機構2020

    • Author(s)
      久保田裕二、武川睦寛
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 癌遺伝子によるストレス応答シグナル伝達経路の活性化機構の解析2020

    • Author(s)
      川瀧紗英子、久保田裕二、武川睦寛
    • Organizer
      第20回東京大学生命科学シンポジウム
  • [Presentation] カスパーゼ依存的な蛋白質切断を介したERKシグナルの新規活性制御機構2020

    • Author(s)
      久保田裕二、武川睦寛
    • Organizer
      第71回日本電気泳動学会総会
  • [Presentation] ERK経路の異常活性化により発現誘導される新規遺伝子の同定および機能解析2020

    • Author(s)
      高木祐輔、久保田裕二、武川睦寛
    • Organizer
      第71回日本電気泳動学会総会
  • [Presentation] 発癌シグナルによる p38/JNK 経路活性化の分子機構の解明2020

    • Author(s)
      川瀧紗英子、久保田裕二、武川睦寛
    • Organizer
      第71回日本電気泳動学会総会
  • [Presentation] ストレス顆粒の新規構成因子およびその生理機能の解析2020

    • Author(s)
      吉岡 大介、中村 貴紀、武川 睦寛
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Elucidation of the molecular mechanism underlying oncogene-induced activation of the p38 and JNK pathways2020

    • Author(s)
      Saeko Kawataki, Yuji Kubota, Mutsuhiro Takekawa
    • Organizer
      G2 plus Retreat
  • [Remarks] 新学術領域研究「数理シグナル」ホームページ

    • URL

      http://math-signal.umin.jp/

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi