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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Toward an integrative understanding of functional zones in organelles

Administrative Group

Project AreaToward an integrative understanding of functional zones in organelles
Project/Area Number 17H06413
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

清水 重臣  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (70271020)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 花田 賢太郎  国立感染症研究所, 細胞化学部, 部長 (30192701)
新井 洋由  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (40167987)
原田 彰宏  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (40251441)
黒川 量雄  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 専任研究員 (40333504)
後藤 聡  立教大学, 理学部, 教授 (60280575)
齊藤 達哉  徳島大学, 先端酵素学研究所(次世代), 非常勤講師 (60456936)
森 和俊  京都大学, 理学研究科, 教授 (70182194)
加藤 薫  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (80356782)
中野 明彦  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (90142140)
今泉 和則  広島大学, 医歯薬保健学研究科(医), 教授 (90332767)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywordsオルガネラ / ミトコンドリア / ゴルジ体 / 小胞体 / エンドソーム
Outline of Annual Research Achievements

オルガネラ・ゾーン研究を、領域全体で有機的に進めることができるように、様々な施策を行った。特に、公募班に対する支援体制の整備、情報の相互交換、共同研究の推進を図った。
具体的には、6月に全ての研究班が発表する「第1回全体班会議」を開催し、研究の進捗状況を班員全員で共有する場を設けた。さらに、「第2回プログレスレポート」を12月に開催し、領域一体となって研究を進めていった。また、本領域では、若手研究者のプロモーションにも力を入れており、12月に「若手プロモーションの会」改め「第2回オルガネラゾーン研究会」(東京医科歯科大学)を開催した。さらに、平成31年1月には、若手研究者が主催する「オルガネラゾーン若手の会」を開催し、ジュニアクラスの若手の育成にも努めた。
本領域では、オルガネラゾーンという学問領域を確立することを目指している。国外向けには、Golgi meeting2018で複数の領域内研究者が講演を行った。また、世界最大の細胞生物学大会であるASCB/EMBO2018においては、organella zoneがセッションタイトルに選定され、領域内研究者がシンポジストの半数を占めることができた。さらに、JB誌において英文の総説特集号を発刊したほか、海外研究者の招聘2件、国内若手研究者の海外派遣3件を行った。国内向けには、多くの学会において、オルガネラゾーン関連のシンポジウムを行ったほか、分子生物学会のフォーラムでは、オルガネラゾーン研究の進め方を領域の枠にこだわらず議論する場を設けた。技術支援部門では、イメージングやプロテオミクスなどの技術を、計画班、公募班に提供し、約40件の技術支援が行われた。事務部門では、ホームページを随時更新し、種々の情報を迅速に発信した。また、第2号のニュースレターを発刊し、研究成果の公開を行なった。総括班会議は2度開催し、領域の施策を議論した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初予定していた、総括班会議、ホームページ開設、ニュースレター発刊、「全体班会議」、「プログレスレポート」の開催を順調に行った。また、多くの共同研究を実施することができた。重要なことに、これらの研究を進める間に、領域内のメンバー間の信頼が深まり、領域一体となって研究を行う意識が涵養された。さらに、SCLIM顕微鏡、超解像顕微鏡、電子顕微鏡、糖鎖解析、リピドミクス、プロテオミクス、siRNAスクリーニングライブラリー、ケミカルバイオロジーなど、お互いの技術を班内で共有する技術支援も非常に有効に機能した。実際に、これらを活用した共同研究も多く進行している。若手育成に関しても、独立研究者を目指すシニア若手を対象とした「オルガネラゾーン研究会」、大学院生などのジュニア若手を対象とした「オルガネラゾーン若手の会」、国際学会への派遣などを予定通り行なった。国際化に関しては、ASCB/EMBO2018において"organella zone"がセッションタイトルに選ばれたのが特筆すべき点である。「オルガネラ・ゾーン統合解析プロジェクト」の研究も進みつつあるほか、領域内共同研究も進行している。以上のことから、総括班の活動は極めて順調に遂行されていると判断される。

Strategy for Future Research Activity

引き続き、現在の管理体制、技術支援体制を継続して行う。また、平成31年度には国際シンポジウムも予定しており、「オルガネラ・ゾーンの概念」の国際化を推進するために、総括班として企画、調整、評価を行う。班会議は、半年おきに、全体会議とプログレスレポートを開催し、お互いの研究成果や研究手法の共有、研究者間の情報交換、研究材料の相互活用などを行う。また本年も、若手育成に重点をおいた、若手のみからなる研究会を企画している。研究支援面では、さらに技術支援を相互利用するよう勧奨する。ホームページでは、引き続きオルガネラゾーンに関する情報を提供する。また、「オルガネラ・ゾーン統合解析プロジェクト」を遂行する。

  • Research Products

    (22 results)

All 2019 2018

All Journal Article (22 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 22 results)

  • [Journal Article] Visualization of secretory cargo transport within the Golgi apparatus2019

    • Author(s)
      Kurokawa Kazuo、Osakada Hiroko、Kojidani Tomoko、Waga Miho、Suda Yasuyuki、Asakawa Haruhiko、Haraguchi Tokuko、Nakano Akihiko
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology

      Volume: 218 Pages: 1602~1618

    • DOI

      10.1083/jcb.201807194

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The activity of Sac1 across ER?TGN contact sites requires the four-phosphate-adaptor-protein-12019

    • Author(s)
      Venditti Rossella、Masone Maria Chiara、Rega Laura Rita、Di Tullio Giuseppe、Santoro Michele、Polishchuk Elena、Serrano Ivan Castello、Olkkonen Vesa M.、Harada Akihiro、Medina Diego L.、La Montagna Raffaele、De Matteis Maria Antonietta
    • Journal Title

      The Journal of Cell Biology

      Volume: 218 Pages: 783~797

    • DOI

      10.1083/jcb.201812021

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Beclin 1 regulates recycling endosome and is required for skin development in mice2019

    • Author(s)
      Noguchi Saori、Honda Shinya、Saitoh Tatsuya、Matsumura Hiroyuki、Nishimura Emi、Akira Shizuo、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 2 Pages: 37

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0279-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Uric Acid-Induced Enhancements of Kv1.5 Protein Expression and Channel Activity via the Akt-HSF1-Hsp70 Pathway in HL-1 Atrial Myocytes2019

    • Author(s)
      Taufiq Fikri、Maharani Nani、Li Peili、Kurata Yasutaka、Ikeda Nobuhito、Kuwabara Masanari、Otani Naoyuki、Miake Junichiro、Hasegawa Akira、Tsuneto Motokazu、Shirayoshi Yasuaki、Ninomiya Haruaki、Saitoh Tatsuya、Nakai Akira、Yamamoto Kazuhiro、Hisatome Ichiro
    • Journal Title

      Circulation Journal

      Volume: 83 Pages: 718~726

    • DOI

      10.1253/circj.CJ-18-1088

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Novel Contact by a Novel Protein Complex Supports Cholesterol Transport to the Endoplasmic Reticulum2018

    • Author(s)
      Harada Akihiro
    • Journal Title

      Contact

      Volume: 1 Pages: 77968~77968

    • DOI

      10.1177/2515256418779685

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Rab11-binding protein RELCH/KIAA1468 controls intracellular cholesterol distribution2018

    • Author(s)
      Sobajima Tomoaki、Yoshimura Shin-ichiro、Maeda Tomomi、Miyata Haruhiko、Miyoshi Eiji、Harada Akihiro
    • Journal Title

      The Journal of Cell Biology

      Volume: 217 Pages: 1777~1796

    • DOI

      10.1083/jcb.201709123

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear envelope localization of PIG-B is essential for GPI-anchor synthesis in Drosophila2018

    • Author(s)
      Yamamoto-Hino Miki、Katsumata Eri、Suzuki Emiko、Maeda Yusuke、Kinoshita Taroh、Goto Satoshi
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 131 Pages: jcs218024

    • DOI

      10.1242/jcs.218024

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Paradigm shift from ‘Compartment’ to ‘Zone’ in the understanding of organelles2018

    • Author(s)
      Nishitoh Hideki
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 165 Pages: 97~99

    • DOI

      10.1093/jb/mvy107

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Collection of Transgenic Medaka Strains for Efficient Site-Directed Transgenesis Mediated by phiC31 Integrase2018

    • Author(s)
      Ishikawa Tokiro、Ansai Satoshi、Kinoshita Masato、Mori Kazutoshi
    • Journal Title

      G3: Genes|Genomes|Genetics

      Volume: 8 Pages: 2585~2593

    • DOI

      10.1534/g3.118.200130

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The binding of TBK1 to STING requires exocytic membrane traffic from the ER2018

    • Author(s)
      Ogawa Emari、Mukai Kojiro、Saito Kota、Arai Hiroyuki、Taguchi Tomohiko
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 503 Pages: 138~145

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.05.199

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nitro-fatty acids are formed in response to virus infection and are potent inhibitors of STING palmitoylation and signaling2018

    • Author(s)
      Hansen AL、Buchan GJ、R?hl M、Mukai K、Salvatore SR、Ogawa E、Andersen SD、Iversen MB、Thielke AL、Gunderstofte C、Motwani M、M?ller CT、Jakobsen AS、Fitzgerald KA、Roos J、Lin R、Maier T. J、Goldbach-Mansky R、Miner CA、Qian W、Miner JJ、Rigby RE、Rehwinkel J、Jakobsen MR、Arai H、Taguchi T、Holm CK
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 115 Pages: E7768~E7775

    • DOI

      10.1073/pnas.1806239115

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of a Series of Practical Fluorescent Chemical Tools To Measure pH Values in Living Samples2018

    • Author(s)
      Takahashi Shodai、Kagami Yu、Hanaoka Kenjiro、Terai Takuya、Komatsu Toru、Ueno Tasuku、Uchiyama Masanobu、Koyama-Honda Ikuko、Mizushima Noboru、Taguchi Tomohiko、Arai Hiroyuki、Nagano Tetsuo、Urano Yasuteru
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 140 Pages: 5925~5933

    • DOI

      10.1021/jacs.8b00277

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Membrane closure in stress induced-autophagosome formation2018

    • Author(s)
      Morita Eiji
    • Journal Title

      Cell Stress

      Volume: 2 Pages: 122~124

    • DOI

      10.15698/cst2018.06.138

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] NFAT5 up-regulates expression of the kidney-specific ubiquitin ligase gene Rnf183 under hypertonic conditions in inner-medullary collecting duct cells2018

    • Author(s)
      Maeoka Yujiro、Wu Yan、Okamoto Takumi、Kanemoto Soshi、Guo Xiao Peng、Saito Atsushi、Asada Rie、Matsuhisa Koji、Masaki Takao、Imaizumi Kazunori、Kaneko Masayuki
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 294 Pages: 101~115

    • DOI

      10.1074/jbc.RA118.002896

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Unfolded Protein Response-Dependent Communication and Contact among Endoplasmic Reticulum, Mitochondria, and Plasma Membrane2018

    • Author(s)
      Saito Atsushi、Imaizumi Kazunori
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 19 Pages: 3215~3215

    • DOI

      10.3390/ijms19103215

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Shutdown of ER-associated degradation pathway rescues functions of mutant iduronate 2-sulfatase linked to mucopolysaccharidosis type II2018

    • Author(s)
      Osaki Yosuke、Saito Atsushi、Kanemoto Soshi、Kaneko Masayuki、Matsuhisa Koji、Asada Rie、Masaki Takao、Orii Kenji、Fukao Toshiyuki、Tomatsu Shunji、Imaizumi Kazunori
    • Journal Title

      Cell Death & Disease

      Volume: 9 Pages: 808

    • DOI

      10.1038/s41419-018-0871-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Axonal Activation of the Unfolded Protein Response Promotes Axonal Regeneration Following Peripheral Nerve Injury2018

    • Author(s)
      Ohtake Yosuke、Matsuhisa Koji、Kaneko Masayuki、Kanemoto Soshi、Asada Rie、Imaizumi Kazunori、Saito Atsushi
    • Journal Title

      Neuroscience

      Volume: 375 Pages: 34~48

    • DOI

      10.1016/j.neuroscience.2018.02.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RAB GTPases in the Basal Land Plant Marchantia polymorpha2018

    • Author(s)
      Minamino Naoki、Kanazawa Takehiko、Era Atsuko、Ebine Kazuo、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 59 Pages: 850~861

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy027

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Integration of two RAB5 groups during endosomal transport in plants2018

    • Author(s)
      Ito Emi、Ebine Kazuo、Choi Seung-won、Ichinose Sakura、Uemura Tomohiro、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 7 Pages: e34064

    • DOI

      10.7554/eLife.34064

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detailed Analysis of the Interaction of Yeast COG Complex2018

    • Author(s)
      Ishii Midori、Lupashin Vladimir V.、Nakano Akihiko
    • Journal Title

      Cell Structure and Function

      Volume: 43 Pages: 119~127

    • DOI

      10.1247/csf.18014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ANTH domain-containing proteins are required for the pollen tube plasma membrane integrity via recycling ANXUR kinases2018

    • Author(s)
      Muro Keita、Matsuura-Tokita Kumi、Tsukamoto Ryoko、Kanaoka Masahiro M.、Ebine Kazuo、Higashiyama Tetsuya、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 1 Pages: 152

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0158-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Golgi-Released Subpopulation of the Trans-Golgi Network Mediates Protein Secretion in Arabidopsis2018

    • Author(s)
      Uemura Tomohiro、Nakano Ryohei Thomas、Takagi Junpei、Wang Yiming、Kramer Katharina、Finkemeier Iris、Nakagami Hirofumi、Tsuda Kenichi、Ueda Takashi、Schulze-Lefert Paul、Nakano Akihiko
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 179 Pages: 519~532

    • DOI

      10.1104/pp.18.01228

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2019-12-27  

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