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2022 Fiscal Year Annual Research Report

New frontier for ubiquitin biology driven by chemo-technologies

Administrative Group

Project AreaNew frontier for ubiquitin biology driven by chemo-technologies
Project/Area Number 18H05497
Research InstitutionTokyo Metropolitan Institute of Medical Science

Principal Investigator

佐伯 泰  公益財団法人東京都医学総合研究所, 基礎医科学研究分野, プロジェクトリーダー (80462779)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 内藤 幹彦  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 特任教授 (00198011)
村田 茂穂  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (20344070)
岩井 一宏  京都大学, 医学研究科, 教授 (60252459)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
Keywordsユビキチン / ケミカルバイオロジー / 翻訳後修飾 / タンパク質分解 / 標的タンパク質分解誘導剤
Outline of Annual Research Achievements

最終年度となる2022年度は以下の活動を実施した。
(1)総括班会議:2023年3月14日にオンライン開催し、2022年度の領域の研究活動全般の報告、領域主催国際シンポジウムの会計報告の他、ユビキチン研究会の開催および領域事後評価報告書のとりまとめ等について討議し決定した。
(2)領域全体会議:2022年12月3日~4日の2日間、領域主催の国際会議Ubiquitin New Frontierと合同会議として伊藤国際学術研究センターにて対面で実施した。招聘演者11名(海外8名)と領域班員20名による計31題の口頭発表、領域班員および大学院生による55題のポスター発表、ポスターフラッシュトークおよびランチョンセミナーを実施した。参加者数は180名(企業研究者20名、若手研究者・大学院生50名を含む)であり、口頭発表の質疑応答やポスターセッションにおいては活発な議論が展開され、国際共同研究や企業との連携研究の契機となった。また、サテライトシンポジウムとして東京都医学総合研究所国際シンポジウムを開催し、若手研究者の口頭発表の場とした。
(3)研究支援:総括班による研究支援や共同研究のマッチング等を実施し、異分野連携による共同研究を含めて90件の原著論文発表があった。
(4)若手育成支援:国際会議参加旅費支援を3件実施するとともに、上述の2件の国際シンポジウムにおいて、口頭発表、ポスター発表の機会を設けた。
(5)広報活動:領域ホームページを定期的に更新するとともに、ニュースレターを540部発行した。また、日本ケミカルバイオロジー学会、日本細胞生物学会年会、日本生化学会大会、日本分子生物学会、日本農芸化学会にて異分野融合研究を意識した共催シンポジウムを開催した。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (33 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 14 results,  Open Access: 4 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 15 results) Remarks (2 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Journal Article] Structural insight into the recognition of the linear ubiquitin assembly complex by Shigella E3 ligase IpaH1.4/2.52023

    • Author(s)
      Hiragi Keito、Nishide Akira、Takagi Kenji、Iwai Kazuhiro、Kim Minsoo、Mizushima Tsunehiro
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 173 Pages: 317~326

    • DOI

      10.1093/jb/mvac109

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] ENTREP/FAM189A2 encodes a new ITCH ubiquitin ligase activator that is downregulated in breast cancer2022

    • Author(s)
      Tsunoda Takumi、Riku Miho、Yamada Norika、Tsuchiya Hikaru、Tomita Takuya、Suzuki Minako、Kizuki Mari、Inoko Akihito、Ito Hideaki、Murotani Kenta、Murakami Hideki、Saeki Yasushi、Kasai Kenji
    • Journal Title

      EMBO reports

      Volume: 23 Pages: e51182

    • DOI

      10.15252/embr.202051182

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The TGN/EE SNARE protein SYP61 and the ubiquitin ligase ATL31 cooperatively regulate plant responses to carbon/nitrogen conditions in Arabidopsis2022

    • Author(s)
      Hasegawa Yoko、Huarancca Reyes Thais、Uemura Tomohiro、Baral Anirban、Fujimaki Akari、Luo Yongming、Morita Yoshie、Saeki Yasushi、Maekawa Shugo、Yasuda Shigetaka、Mukuta Koki、Fukao Yoichiro、Tanaka Keiji、Nakano Akihiko、Takagi Junpei、Bhalerao Rishikesh P、Yamaguchi Junji、Sato Takeo
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 34 Pages: 1354~1374

    • DOI

      10.1093/plcell/koac014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] cIAP1-based degraders induce degradation via branched ubiquitin architectures2022

    • Author(s)
      Akizuki Yoshino、Morita Mai、Mori Yuki、Kaiho-Soma Ai、Dixit Shivani、Endo Akinori、Shimogawa Marie、Hayashi Gosuke、Naito Mikihiko、Okamoto Akimitsu、Tanaka Keiji、Saeki Yasushi、Ohtake Fumiaki
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 19 Pages: 311~322

    • DOI

      10.1038/s41589-022-01178-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Gilteritinib-Based Chimeric Small Molecules that Potently Induce Degradation of FLT3-ITD Protein2022

    • Author(s)
      Ohoka Nobumichi、Suzuki Masanori、Uchida Takuya、Tsuji Genichiro、Tsukumo Yoshinori、Yoshida Masayuki、Inoue Takao、Demizu Yosuke、Ohki Hitoshi、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      ACS Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 13 Pages: 1885~1891

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.2c00402

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a degrader against oncogenic fusion protein FGFR3-TACC32022

    • Author(s)
      Shibata Norihito、Cho Nobuo、Koyama Hiroo、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 60 Pages: 128584~128584

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2022.128584

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inducing Protein Degradation to Overcome Resistance to Kinase Inhibitors2022

    • Author(s)
      Sato Waka、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 62 Pages: 557~558

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.2c00223

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ABIN1 is a signal‐induced autophagy receptor that attenuates NF‐κB activation by recognizing linear ubiquitin chains2022

    • Author(s)
      Shinkawa Yutaka、Imami Koshi、Fuseya Yasuhiro、Sasaki Katsuhiro、Ohmura Koichiro、Ishihama Yasushi、Morinobu Akio、Iwai Kazuhiro
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 596 Pages: 1147~1164

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14323

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] HOIL1 regulates group 2 innate lymphoid cell numbers and type 2 inflammation in the small intestine2022

    • Author(s)
      Wood Matthew J.、Marshall Jeffrey N.、Hartley Victoria L.、Liu Ta-Chiang、Iwai Kazuhiro、Stappenbeck Thaddeus S.、MacDuff Donna A.
    • Journal Title

      Mucosal Immunology

      Volume: 15 Pages: 642~655

    • DOI

      10.1038/s41385-022-00520-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic deletion and pharmacologic inhibition of E3 ubiquitin ligase HOIP impairs the propagation of myeloid leukemia2022

    • Author(s)
      Jimbo Koji、Hattori Ayuna、Koide Shuhei、Ito Takahiro、Sasaki Katsuhiro、Iwai Kazuhiro、Nannya Yasuhito、Iwama Atsushi、Tojo Arinobu、Konuma Takaaki
    • Journal Title

      Leukemia

      Volume: 37 Pages: 122~133

    • DOI

      10.1038/s41375-022-01750-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of linear ubiquitination in inflammatory responses and tissue homeostasis2022

    • Author(s)
      Sasaki Katsuhiro、Iwai Kazuhiro
    • Journal Title

      International Immunology

      Volume: 35 Pages: 19~25

    • DOI

      10.1093/intimm/dxac047

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The effect of nutrient deprivation on proteasome activity in 4-week-old mice and 24-week-old mice2022

    • Author(s)
      Tanahashi Nobuyuki、Komiyama Moeko、Tanaka Mina、Yokobori Yuta、Murata Shigeo、Tanaka Keiji
    • Journal Title

      The Journal of Nutritional Biochemistry

      Volume: 105 Pages: 108993~108993

    • DOI

      10.1016/j.jnutbio.2022.108993

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Controlled Tetradeuteration of Straight‐Chain Fatty Acids: Synthesis, Application, and Insight into the Metabolism of Oxidized Linoleic Acid2022

    • Author(s)
      Watanabe Ayako、Hama Kotaro、Watanabe Kohei、Fujiwara Yuko、Yokoyama Kazuaki、Murata Shigeo、Takita Ryo
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 61 Pages: e202202779

    • DOI

      10.1002/anie.202202779

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Molecular Mechanisms Governing the Assembly of the Immuno- and Thymoproteasomes in the Presence of Constitutive Proteasomes2022

    • Author(s)
      Watanabe Ayaka、Yashiroda Hideki、Ishihara Satoshi、Lo Megan、Murata Shigeo
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 11 Pages: 1580~1580

    • DOI

      10.3390/cells11091580

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ケモテクノロジーが拓くユビキチンニューフロンティア2022

    • Author(s)
      佐伯 泰
    • Organizer
      第16回日本ケミカルバイオロジー学会年会
    • Invited
  • [Presentation] プロテアソーム基質の選別機構2022

    • Author(s)
      佐伯 泰、土屋光、林剛介、遠藤彬則
    • Organizer
      第74回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] ユビキチンコード研究の最前線~基本原理の理解と創薬~2022

    • Author(s)
      佐伯 泰
    • Organizer
      ゲノム創薬・創発フォーラム第10回シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] ケモユビキチン:生物学と合成化学の融合がもたらす新発想の創薬の芽2022

    • Author(s)
      古畑隆史、佐伯泰、岡本晃光
    • Organizer
      第1回日本科学振興協会(JAAS)キックオフミーティング
  • [Presentation] 最先端プロテオミクスによって見えてきたプロテアソーム経路の基質選別メカニズム2022

    • Author(s)
      佐伯 泰、土屋光、遠藤彬則
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2022年大会
    • Invited
  • [Presentation] Ubiquitylation-dependent phase separation of the proteasome2022

    • Author(s)
      Yasushi Saeki
    • Organizer
      XI-ZOMES
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 頑張って若さを保とう!老化とタンパク質分解2022

    • Author(s)
      佐伯 泰
    • Organizer
      第12回CSJ化学フェスタ2022
    • Invited
  • [Presentation] 最先端プロテオミクスによって見えてきたプロテアソーム経路の基質選別メカニズム2022

    • Author(s)
      佐伯 泰
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Ubiquitylation-dependent phase separation of the proteasome2022

    • Author(s)
      Yasushi Saeki
    • Organizer
      Ubiquitin New Frontier "from Neo-Biology to Targeted Protein Degradation"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Targeted protein degradation by chimeric molecules, PROTACs and SNIPERs2022

    • Author(s)
      Mikihiko Naito
    • Organizer
      Korean Society of Biochemistry and Molecular Biology International Conference 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Targeted protein degradation as a novel strategy for precision medicine against cancers2022

    • Author(s)
      Mikihiko Naito
    • Organizer
      Ubiquitin New Frontier "from Neo-Biology to Targeted Protein Degradation"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] タンパク質分解技術と創薬2022

    • Author(s)
      内藤幹彦
    • Organizer
      ゲノム創薬・創発フォーラム第10回シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 選択的なタンパク質分解技術と創薬2022

    • Author(s)
      内藤幹彦
    • Organizer
      JBIC研究会
    • Invited
  • [Presentation] Unexpected functions of HOIL-1L E3: regulation of LUBAC, glycogen metabolism and beyond2022

    • Author(s)
      Kazuhiro Iwai
    • Organizer
      EMBO Workshop "Ubiquitin and ubiquitin-like proteins in health and disease"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Unexpected regulation and function of LUBAC-mediated linear ubiquitination in immunity2022

    • Author(s)
      Kazuhiro Iwai
    • Organizer
      The first OIST-Kyoto University Joint Workshop “Challenges in Biomedical Complexities”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Role of senescence-associated nuclear proteasome foci2022

    • Author(s)
      Shigeo Murata
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Remarks] 新学術領域研究「ケモテクノロジーが拓くユビキチンニューフロンティア」ホームページ

    • URL

      http://www.ubiquitin.jp/

  • [Remarks] 領域主催国際シンポジウムUbiquitin New Frontierホームページ

    • URL

      https://ub-tokyo-2022.com/

  • [Funded Workshop] The International Symposium in Tokyo, Ubiquitin New Frontier "from Neo-Biology to Targeted Protein Degradation"2022

URL: 

Published: 2023-12-25  

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