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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanisms underlying replication of non-genomic codes that mediate plasticity and robustness for cellular inheritance

Administrative Group

Project AreaMechanisms underlying replication of non-genomic codes that mediate plasticity and robustness for cellular inheritance
Project/Area Number 19H05739
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

中西 真  東京大学, 医科学研究所, 教授 (40217774)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 河本 宏  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 教授 (00343228)
油谷 浩幸  東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (10202657)
有田 恭平  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 准教授 (40549648)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2024-03-31
KeywordsDNAメチル化 / ゲノム安定性 / DNA損傷
Outline of Annual Research Achievements

多様な非ゲノム情報複製機構を解明する当該分野を新学術領域研究として推進し、新たな研究分野として確立するためには、多様な解析システムと技術を持つ研究者が研究代表者となり研究を推進する一方、多様な分野の経験知識豊富なアドバイザーを加えた総括班を設置して領域の推進を図る必要がある。総括班は、領域全体の総括、研究の進捗状況の確認・評価のみならず、技術支援及び班員間の調整を行う。また一般社会向けの公開シンポジウムや、アウトリーチ活動を支援するとともに、成果の取りまとめや国際活動等の領域全体の企画・運営を行うことを目的とする。令和元年度の総括班活動として国際シンポジウムの開催を2月に予定して準備を進めていた。しかしながら、同年2月からのCOVID-19パンデミックにより海外演者の招聘が困難となり、さらに国内の移動についても制限がかかったため、国際シンポジウム開催を翌年令和2年度に延期した。しかしCOVID-19パンデミックの収束は令和3年度末においても未だ見られないため、国際シンポジウムの開催が令和4年度初めにおいて未だ開催されていない。一方、総括班会議、さらには領域全体会議については年2回程度オンラインにおいて開催し、各班員の研究成果を議論するとともに、新たな共同研究の推進を図った。また領域のホームページを作成し公開することで国内外の研究者のみならず一般社会に対しても情報発信を行なった。またNews letterを年二回発刊し、領域の研究成果や新たな技術等について研究者向けに発信を行なった。技術提供については、オンラインの領域全体会議において提供可能な技術を報告するとともに、広く希望を募って技術を提供した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

研究概要の項目でも記載したが、総括班活動の重要なものとして国際シンポジウムの開催が挙げられる。これは、当該領域の研究進歩が、新たな技術革新とともに非常に早いため、国外の一流研究者を招聘して研究交流を促進することが、領域全体の研究推進に必要不可欠であると考えたからである。しかしながら、COVID-19パンデミックにより全世界的な人流抑制により、研究成果発表のみならず共同研究そのものも大きな影響を受けて停滞した。このような中、領域ではオンラインを駆使することで、世界の一流あるいは若手研究者のWebinarを開催し、当該領域のみならず他の新学術領域にも広げて情報を発信し、国際共同研究の推進を図ってきた。これによりCOVID-19パンデミックの影響を最小限にすることに尽力した。また国内あるいは領域内の共同研究についても国内での人流抑制により大きな影響を受けたが、Web会議を多用することで、その影響を最小化するよう尽力した。一方、ホームページやNews letterなどの活用により領域全体の研究成果を広く一般に発信することは順調に進捗していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度においても未だCOVID-19が収束する気配は見せないが、国内外の人流抑制についてはかなり緩和されてきた。とりわけ、欧米諸国においては国際会議を対面で行うなど、COVID-19の影響を最小化する方向となっている。従って、令和4年度においては何とか国際シンポジウムや総括班会議、さらには領域全体会議についてCOVID-19感染防止対策を十分にとった上で、対面で開催するように努力したい。これにより2年半にも及ぶ、人的交流や共同研究の抑制による総括班活動の遅れを取り戻すことに最大限の努力を払いたい。

  • Research Products

    (22 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 9 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 8 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of inhibitor-bound human MSPL that can activate high pathogenic avian influenza2021

    • Author(s)
      Ohno Ayako、Maita Nobuo、Tabata Takanori、Nagano Hikaru、Arita Kyohei、Ariyoshi Mariko、Uchida Takayuki、Nakao Reiko、Ulla Anayt、Sugiura Kosuke、Kishimoto Koji、Teshima-Kondo Shigetada、Okumura Yuushi、Nikawa Takeshi
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 4 Pages: -

    • DOI

      10.26508/lsa.202000849

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structure-based screening combined with computational and biochemical analyses identified the inhibitor targeting the binding of DNA Ligase 1 to UHRF12021

    • Author(s)
      Kori Satomi、Shibahashi Yuki、Ekimoto Toru、Nishiyama Atsuya、Yoshimi Sae、Yamaguchi Kosuke、Nagatoishi Satoru、Ohta Masateru、Tsumoto Kouhei、Nakanishi Makoto、Defossez Pierre-Antoine、Ikeguchi Mitsunori、Arita Kyohei
    • Journal Title

      Bioorg Med Chem

      Volume: 52 Pages: 116500~116500

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2021.116500

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Preparation of the ubiquitination-triggered active form of SETDB1 in Escherichia coli for biochemical and structural analyses2021

    • Author(s)
      Funyu Tomoko、Kanemaru Yuka、Onoda Hiroki、Arita Kyohei
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 170 Pages: 655~662

    • DOI

      10.1093/jb/mvab087

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Two distinct modes of DNMT1 recruitment ensure stable maintenance DNA methylation2020

    • Author(s)
      Nishiyama Atsuya、Mulholland Christopher B.、Bultmann Sebastian、Kori Satomi、Endo Akinori、Saeki Yasushi、Qin Weihua、Trummer Carina、Chiba Yoshie、Yokoyama Haruka、Kumamoto Soichiro、Kawakami Toru、Hojo Hironobu、Nagae Genta、Aburatani Hiroyuki、Tanaka Keiji、Arita Kyohei、Leonhardt Heinrich、Nakanishi Makoto
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15006-4

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2020

    • Author(s)
      Higashijima Y, Matsui Y, Shimamura T, Nakaki R, Nagai N, Tsutsumi S, Abe Y, Link VM, Osaka M, Yoshida M, Watanabe R, Tanaka T, Taguchi A, Miura M, Ruan X, Li G, Inoue T, Nangaku M, Kimura H, Furukawa T, Aburatani H, Wada Y, Ruan Y, Glass CK, Kanki Y
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 39 Pages: 77

    • DOI

      10.15252/embj.2019103949

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High Frequency Production of T Cell-Derived iPSC Clones Capable of Generating Potent Cytotoxic T Cells2020

    • Author(s)
      Nagano Seiji、Maeda Takuya、Ichise Hiroshi、Kashima Soki、Ohtaka Manami、Nakanishi Mahito、Kitawaki Toshio、Kadowaki Norimitsu、Takaori-Kondo Akifumi、Masuda Kyoko、Kawamoto Hiroshi
    • Journal Title

      Molecular Therapy - Methods & Clinical Development

      Volume: 16 Pages: 126~135

    • DOI

      10.1016/j.omtm.2019.12.006

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Enhanced processivity of Dnmt1 by monoubiquitinated histone H32019

    • Author(s)
      Mishima Yuichi、Brueckner Laura、Takahashi Saori、Kawakami Toru、Otani Junji、Shinohara Akira、Takeshita Kohei、Garvilles Ronald Garingalao、Watanabe Mikio、Sakai Norio、Takeshima Hideyuki、Nachtegael Charlotte、Nishiyama Atsuya、Nakanishi Makoto、Arita Kyohei、Nakashima Kinichi、Hojo Hironobu、Suetake Isao
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 25 Pages: 22~32

    • DOI

      10.1111/gtc.12732

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comprehensive epigenome characterization reveals diverse transcriptional regulation across human vascular endothelial cells.2019

    • Author(s)
      Nakato R, Wada Y, Nakaki R, Nagae G, Tsutsumi S, Kanki Y, Saito Y, Kobayashi M, Osato N, Tatsuno K, Kamio A, Wada H, Ohta S, Aikawa M, Nakajima H, Nakamura M, McGee RC, Heppner KW, Kawakatsu T, Genno M, Yanase H, Kume H, Senbonmatsu T, Homma Y, Nishimura S, Mitsuyama T, Aburatani H, Kimura H, Shirahige K
    • Journal Title

      Epigenetics Chromatin

      Volume: 12 Pages: -

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Organoid-based ex vivo reconstitution of Kras-driven pancreatic ductal carcinogenesis2019

    • Author(s)
      Matsuura Tetsuya、Maru Yoshiaki、Izumiya Masashi、Hoshi Daisuke、Kato Shingo、Ochiai Masako、Hori Mika、Yamamoto Shogo、Tatsuno Kenji、Imai Toshio、Aburatani Hiroyuki、Nakajima Atsushi、Hippo Yoshitaka
    • Journal Title

      Carcinogenesis

      Volume: 41 Pages: 490~501

    • DOI

      10.1093/carcin/bgz122

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞老化の代謝的特性とSenolysis2019

    • Author(s)
      中西 真
    • Organizer
      第28回 日本Cell Death学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 細胞老化と加齢性疾患2019

    • Author(s)
      中西 真
    • Organizer
      第81回 日本血液学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] Metabolic vulnerability in senescent cells2019

    • Author(s)
      中西 真
    • Organizer
      第42回 日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Liver cancer and Wnt signaling2019

    • Author(s)
      Hiroyuki Aburatani
    • Organizer
      The 38th Sapporo International Cancer Symposium
  • [Presentation] Liver cancer and Wnt signaling2019

    • Author(s)
      Hiroyuki Aburatani
    • Organizer
      78th Annual meeting of the Japanese Cancer Association
  • [Presentation] Integrated genomic analysis of hepatoblastoma2019

    • Author(s)
      Hiroyuki Aburatani
    • Organizer
      EMBL Workshop on Cancer Genomics
  • [Presentation] Epigenetic heterogeneity of Hepatic Lineage tumor2019

    • Author(s)
      Hiroyuki Aburatani
    • Organizer
      The 50th Commemorative International Symposium of The Princess Takamatsu Cancer Research Fund
  • [Presentation] 統合ゲノム解析による肝腫瘍進展メカニズムの解明2019

    • Author(s)
      油谷 浩幸
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] CTLs regenerated from iPSCs transduced with clinically used TCR genes exert therapeutic effect in xenograft models2019

    • Author(s)
      Kawamoto, H.
    • Organizer
      ThymE: T cell and thymus biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] iPS細胞技術を用いたがん抗原特異的キラーT細胞の量産-即納型T細胞製剤の開発に向けて-2019

    • Author(s)
      河本宏
    • Organizer
      第30回日本医学会総会2019
    • Invited
  • [Presentation] iPS細胞技術を用いた抗原特異的T細胞の再生-「即納型T細胞製剤」の開発-2019

    • Author(s)
      河本宏
    • Organizer
      第40回阿蘇シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Generation of CTLs from iPSCs transduced with TCR genes: toward the development of “off- the-shelf T cells”2019

    • Author(s)
      河本宏
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] iPS細胞技術を用いたがん抗原特異的T細胞の量産-即納型T細胞製剤の開発-2019

    • Author(s)
      河本宏
    • Organizer
      第57回日本癌治療学会学術集会
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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