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2008 Fiscal Year Annual Research Report

「細胞内ロジスティクス:病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究」の運営

Administrative Group

Project AreaIntracellular logistics: interdisciplinary approaches to pathophysiology of membrane traffic
Project/Area Number 20113001
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

吉森 保  Osaka University, 微生物病研究所, 教授 (60191649)

Keywordsオルガネラ / メンブレントラフィック / 細胞内ロジスティクス / 病態の理解 / 情報科学 / ケミカルバイオロジー / 融合研究 / 高次生体システム
Research Abstract

細胞内の多くのオルガネラや細胞膜を膜ダイナミクスによって結ぶ物流ネットワーク・メンブレントラフィックの実態は、単なる物質運搬ではなく、経済用語のロジスティクス、すなわち「原材料の調達から製品消費までのものの流れの総合的なマネジメント」により近い。この細胞内ロジスティクスは個々の細胞の生存のみならず神経、内分泌、免疫などの高次生体システムをも担い、その障害や破綻は疾患の原因となる。本領域ではその根底にある分子基盤の解明による病態の理解を目指し、分子細胞生物学的なアプローチと共に情報科学・工学及びケミカルバイオロジーとの融合研究を展開する。本研究(総括班)は、融合研究である本領域が的確に推進され、大きな成果を挙げられるような体制を整える役割を担う。今年度は以下の活動を行った。
まず第1回総括班会議を開催し、毎年行う全体班会議の責任者の決定や、融合研究推進の具体策の検討を行った。また、ケミカルバイオロジーとの融合研究として実施する、各計画班が対象とする物流経路に影響を及ぼす化合物の網羅的探索のため、多検体の生細胞を自動で培養・ライブ蛍光観察・記録するBioStationCT(ニコン)を購入し、本領域の融合研究・研究支援の中核である牧野内、清水両計画研究代表者が所属する理化学研究所和光キャンパスに設置した。それを用いた解析に必要な消耗品類も購入した。さらか、平成20年度に終了した特定領域「メンブレントラフィック」と共催で公開シンポジウムを実施し、127名が参加し活発な討論が行われた。

  • Research Products

    (20 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (6 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Effect of Helicobacter pylori's vacuolating cytotoxin on the autophagy pathway in gastric epithelial cells2009

    • Author(s)
      Terebiznik MR, Raju D, Vazquez CL, Torbricki K, Kulkarni R, Blanke SR, Yoshimori T, Colombo MI, Jones NL.
    • Journal Title

      Autophagy Apr 19 ; 5(3)(Epub ahead of print)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Atg16L Complex Specifies the Site of LC3 Lipidation for Membrane Biogenesis in Autophagy2008

    • Author(s)
      Fujita N, Itoh T, Fukuda M, Noda T, Yoshimori T.
    • Journal Title

      Mol Biol Cell 19

      Pages: 2092-2100

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynein-dependent Movement of Autophagosomes Mediates Efficient Encounters with Lysosomes2008

    • Author(s)
      Kimura S, Noda T, Yoshimori T.
    • Journal Title

      Cell Struct Funct 33

      Pages: 109-122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional Analysis of α5β1 Integrin and Lipid Rafts in Invasion of Epithelial Cells by Porphyromonas gingivalis using Fluorescent Beads Coated with Bacterial Membrane Vesicle2008

    • Author(s)
      Tsuda K, Furuta N, Inaba H, Kawai S, Hanada K, Yoshimori T, Amano A.
    • Journal Title

      Cell Struct Funct 33

      Pages: 123-132

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Golgi-resident small GTPase Rab33B interacts with Atg16L and modulates autophagosome formation2008

    • Author(s)
      Itoh T, Fujita N, Kanno E, Yamamoto A, Yoshimori T, Fukuda M.
    • Journal Title

      Mol. Biol Cell 19

      Pages: 2916-2925

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ubc4/5 and c-Cb1 Continue to Ubiquitinate EGF Receptor after Intemalization to Facilitate Polyubiquitination and Degradation2008

    • Author(s)
      Umebayashi K, Stenmark H, Yoshimori T.
    • Journal Title

      Mol Biol Cell 19

      Pages: 3454-3462

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Autophagic control of listeria through intracellular innate immune recognition in drosophila2008

    • Author(s)
      Yano T, Mita S, Ohmori H, Oshima Y, Fujimoto Y, Ueda R, Takada H, Goldman WE, Fukase K, Silverman N, Yoshimori T, Kurata S.
    • Journal Title

      Nat Immunol 9

      Pages: 908-916

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An Atg4B Mutant Hampers the Lipidation of LC3 Paralogues and Causes Defects in Autophagosome Closure2008

    • Author(s)
      Fujita N, Hayashi M, Fukumoto H, Omori H, Yamamoto A, Noda T, Yoshimori T.
    • Journal Title

      Mol Biol Cell 19

      Pages: 14651-4659

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DAP-kinase is a mediator of endoplasmic reticulum stress-induced caspase activation and autophagic cell death2008

    • Author(s)
      Gozuacik D, Bialik S, Raveh T, Mitou G, Shohat G, Sabanay H, Mizushima N, Yoshimori T, Kimchi A.
    • Journal Title

      Cell Death Differ 15

      Pages: 1875-1886

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of the autophagy protein Atg16L1 enhances endotoxin-induced IL-1 beta production2008

    • Author(s)
      Saitoh T, Fujita N, Jang MH, Uematsu S, Yang BG, Satoh T, Omori H, Noda T, Yamamoto N, Komatsu M, Tanaka K, Kawai T, Tsujimura T, Takeuchi O, Yoshimori T, Akira S.(*These authors contributed equally to this work.)
    • Journal Title

      Nature 456

      Pages: 1264-268

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nucleotide-Dependent Conformational Changes and Assembly of the AAA ATPase SKD1/VPS4B2008

    • Author(s)
      Inoue M, Kamikubo H, Kataoka M, Kato R, Yoshimori T, Wakatsuki S, Kawasaki M.
    • Journal Title

      Traffic 9

      Pages: 2180-2189

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分解系ロジスティクスの疾患における役割と作動機構2009

    • Author(s)
      吉森保
    • Organizer
      特定領域研究「トラフィック」終了・新学術領域研究「ロジスティクス」発足合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      航空会館(東京)
    • Year and Date
      2009-01-29
  • [Presentation] Autophagy as a Cellular Defense System against Pathogens and Unfolding Proteins2008

    • Author(s)
      Tamotsu Yoshimori
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)Symposium 3S3 : Intracellular Logistics : Approach to Pathophy siology of Membrane Traffic
    • Place of Presentation
      神戸ポーピアホテル
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Molecular Machinery of Autophagy and Its Role in Diseases2008

    • Author(s)
      Tamotsu Yoshimori
    • Organizer
      11th Western Pacific Cingress on Chemotherapy and Infectious Diseases, Symposium 9 : Invasive Group A Streptococcal Infections
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      20081129-1203
  • [Presentation] Mechanistic Insight into Membrane Dynamics in Mammalian Autophagy2008

    • Author(s)
      Tamotsu Yoshimori
    • Organizer
      Center for the Study of Inflammatory Bowel Disease 18th Annual Workshop on Autophagy in Immunity
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Year and Date
      20081114-15
  • [Presentation] Autophagy : Molecular Machinery and Role in Cellular Defense2008

    • Author(s)
      Tamotsu Yoshimori
    • Organizer
      Korean Society of Medical Biochemistry and Molecular Biology Annual International Conference : In Commemoration of the 60th KSMBMB Anniversary, Symposium SY17 : Autophagy and Human Diseases
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      20081029-31
  • [Presentation] 細胞内自己消化システム・オートファジーによる生体防御2008

    • Author(s)
      吉森保
    • Organizer
      日本細菌学会関東支部総会特別講演
    • Place of Presentation
      生命の森リゾート(千葉)
    • Year and Date
      2008-10-24
  • [Book] Methods Enzymol. 4522009

    • Author(s)
      Kimura S, Fujita N, Noda T, Yoshimori T.
    • Total Pages
      1-12
    • Publisher
      Academic Press
  • [Book] 分子細胞生物学辞典(第2版)2008

    • Author(s)
      吉森保
    • Total Pages
      173-175
    • Publisher
      (株)東京化学同人
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biken.osaka-u.ac.jp/act/act_yoshimor.php

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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