2010 Fiscal Year Annual Research Report
| Project Area | Water plays a key role in ATP hydrolysis and ATP-driven functions of proteins |
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20118001
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
鈴木 誠 東北大学, 大学院・工学研究科, 教授 (60282109)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
木下 正弘 京都大学, エネルギー理工学研究所, 教授 (90195339)
松林 伸幸 京都大学, 化学研究所, 准教授 (20281107)
櫻井 実 東京工業大学, バイオ研究基盤支援総合センター, 教授 (50162342)
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| Keywords | ATPエネルギー / タンパク質の水和 / ATP加水分解反応 / ATP駆動タンパク質 / 水和エントロピー / 溶媒和 / 自由エネルギー / ハイパーモバイル水 |
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| Research Abstract |
「ATPのエネルギーとは何か?」この課題に計画研究と公募研究を有機的連携を図るため、有効な情報交流の場の提供と研究資金の提供を通じて、問題解決に効率的に取り組めるよう支援する。今年度、計画研究メンバーに関連する公募研究の視察や具体的連携を進めた。計画班員が主力となって公募研究も含めて情報交換や連携・共同研究推進をはかった。その過程に博士研究員の複数アドバイザも含めるなど、計画研究と公募研究をあわせて、バーチャルラボとして運営を行った。また、研究会開催と、外部委員を含めた自己評価(7月)を実施した。その結果を踏まえ、後期の計画調整と公募採択の方向を定めた。また、Webを通じて引き続き成果を公開・発信し、目標実現に向けて活動を行った。
1)計画研究班長+総括班顧問による運営会議を開催し、今年度の活動計画と自己評価の実施方法を決めた。参画研究者の研究状況の把握のために領域研究中間報告書を作成した。内部評価のため外部評価者にこの領域研究中間報告書をもとに評価をお願いした。
2)国際シンポジウムを3月に企画したが東日本大地震で被災したため急遽中止となり、替わりに23年8月に領域全体会議を開催し研究者間の交流を進めた。方法論の基礎からの最新成果まで含めた議論を行い、研究支援の必要性の情報収集の場とした。多数の共同研究が進んでいることが報告された。
4)広報活動:領域研究の内容を紹介するホームページを継続的に拡充更新した。
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[Journal Article] Nonequilibrium Energetics of a Single F_1-ATPase Molecule2010
Author(s)
Toyabe, S., Okamoto, T., Watanabe-Nakayama, T., Taketani, H., Kudo, S., Muneyuki, E.
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Journal Title
Phys.Rev.Lett.
Volume: 104
Pages: 198103
Peer Reviewed
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[Journal Article] Observation of DNA pinning at laser focal point on Au surface and its application to single DNA nanowire and cross-wire formation2010
Author(s)
Fujii, S.Kobayashi, K., Kanaizuka.K., Okamoto, T., Toyabe, S., Muneyuki, E., Haga, M.
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Journal Title
Bioelectrochemistry
Volume: 80
Pages: 26-30
Peer Reviewed
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[Presentation] Effects of Side-Chain Packing on the Formation of Secondary Structures in Protein Folding2010
Author(s)
S.Yasuda, T.Yoshidome, H.Oshima, R.Kodama, Y.Harano, M.Kinoshita
Organizer
Pacifichem 2010, Topic Area-Physical, Theoretical & Computational, "New Experimental and Computational Probes of Water in Biological Systems (#130)"
Place of Presentation
Honolulu, Hawaii, USA
Year and Date
2010-12-19
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[Presentation] Free-Energy Function for Discriminating the Native Fold of a Protein from Misfolded Decoys2010
Author(s)
S.Yasuda, T.Yoshidome, Y.Harano, R.Roth, H.Oshima, Y.Sugita, M.Ikeguchi, M.Kinoshita
Organizer
International Symposium of Advanced Energy Science
Place of Presentation
Obaku Plaza, Kyoto University, Uji, Japan
Year and Date
2010-11-18
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[Presentation] ヌクレオチドとF1-ATPaseとの結合の熱力学パラメータの測定Thermodynamic parameters of nucleotide binding to the catalytic sites of F1-ATPase revealed by fluorescence measurement2010
Author(s)
Kikuchi, Y., Naka, Y., Osakabe, H., Toyabe, S., Ueno, H., Muneyuki, E.
Organizer
日本生物物理学会第48回年会
Place of Presentation
東北大学川内キャンパス
Year and Date
2010-09-22
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[Presentation] ミトコンドリア外膜タンパク質Tom20-プレ配列複合体の分子動力学計算Molecular dynamics simulation of outer mitochondrial protein Tom20-presequence complex2010
Author(s)
Komuro, Y., Mori, T., Muneyuki, M., Saito, T., Kohda, D., Sugita, Y.
Organizer
日本生物物理学会第48回年会
Place of Presentation
東北大学川内キャンパス
Year and Date
2010-09-21
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