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2021 Fiscal Year Annual Research Report

翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展

Administrative Group

Project AreaParametric biology based on translation rate regulatory mechanism
Project/Area Number 20H05782
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

土居 雅夫  京都大学, 薬学研究科, 教授 (20432578)

Project Period (FY) 2020-10-02 – 2023-03-31
Keywords翻訳 / パラメトリック制御
Outline of Annual Research Achievements

翻訳パラメトリック生物学の創成に向け、総括班として領域方針の策定・企画・評価を行った。特にA01班(土居、京大、翻訳速度制御を介した睡眠・代謝・体内時計のパラメトリック制御)、A02班(岩崎、理研、新規Disome-Seq法: パラメトリックなリボソーム渋滞の網羅的探索)、A03班(原田、阪大・細胞内局所パラメトリック翻訳における物理化学的調節機構)、A04班(池内、東大、柔軟な神経らしさを作り出すパラメトリック翻訳制御)の4班間で行う共同研究の支援を行った。コアメンバーによる月例会議の他、全体の領域会議を令和3年6月30日に領域アドバイザーの本間さと札幌花園病院睡眠医療センターセンター長ならびに梅田眞郷京都大学名誉教授、および学術調査官の田中良和東北大学教授の臨席のもと開催した。これに加え、第59回日本生物物理学会年会、および、第44回日本分子生物学会年会において、それぞれ本総括班共催のシンポジウムを企画・開催することができた。さらに、領域ホームページにおいて研究の紹介動画や領域で生まれた最新の研究成果の発信を行うとともに(http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/)、昨年度発足させたParametric Translation Club(http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/club.html)において領域外からの研究者を交えた研究討論会を令和3年4月13日と令和4年3月8日に行った。このように、当初の総括班の計画を計画通りに推し進めることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の活動計画に従って翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展を目指した総括班による支援活動を行うことができた。総括班は、計画研究の研究代表者4名(土居・岩崎・原田・池内)と温度制御・計測技術を担当する計画研究の研究分担者1名(岡部)の計5名で構成し、領域代表者の土居を研究代表者、他の班員を連携研究者とした。このような体制において当初の活動計画に従い以下の計画を実施することができた。すなわち、総括班代表土居が中心となり領域会議(2021/6/30)と月例コア会議を実施し、班員間の研究活動の後押しをするとともに、学会でのシンポジウムとして、令和3年11月27日オンライン開催の第59回日本生物物理学会年会にてシンポジウム「パラメトリックな翻訳調節機構」(オーガナイザー:岡部弘基、原田慶恵;学術変革B「パラメトリク翻訳」共催)、および、令和3年12月2日横浜開催の第44回日本分子生物学会年会にてシンポジウム「Parametric Biology Based on Translation Rate Control」(オーガナイザー:土居雅夫、原田慶恵;学術変革B「パラメトリク翻訳」共催)を開催した。後者では米カリフォルニア大バークレー校のINGOLIA博士とLAREAU博士にも登壇いただき、200名を超えるシンポジウムへの参加があった。この他にも、本総括班が企画するParametric Translation Clubで外部識者を混じえた研究討論会を行うとともに、岩崎が中心となり次世代シークエンサーRibo-Seq技術習得ブートキャンプの開催、領域融合型若手支援活動を原田・岡部が行い、領域ホームページを介して池内が本領域の研究活動を広報にあたった。このように総括班の活動は大変順調に進んでおり、領域内外での共同研究促進にも貢献できたといえる。

Strategy for Future Research Activity

前年度に引き続き、当初の活動計画に従って翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展を目指した総括班による支援活動を行う。特に、3年目の最終年度にあたる2022年度は、これまでの活動を継続するとともに、研究成果の取りまとめに向けて各計画班に対しての支援をさらに充実させることが最も重要であると考えている。その上で、本領域で生まれた新たな研究成果や実験技術を多くの研究者と共有することで、本研究領域をさらに広く発展させることに努めたい。

  • Research Products

    (21 results)

All 2022 2021 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 6 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Intracrine activity involving NAD-dependent circadian steroidogenic activity governs age-associated meibomian gland dysfunction.2022

    • Author(s)
      Sasaki L, Hamada Y, Daisuke Yarimizu D, Suzuki T, Nakamura H, Shimada A, Nguyen Pham KT, Shao X, Yamamura K, Inatomi T, Morinaga H, Nishimura EK, Kudo F, Manabe I, Haraguchi S, Sugiura Y, Suematsu M, Kinoshita S, Machida M, Nakajima T, Hiroshi Kiyonari H, Okamura H, Yamaguchi Y, Miyake T, Doi M
    • Journal Title

      Nature Aging

      Volume: 2 Pages: 105-114

    • DOI

      10.1038/s43587-021-00167-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 体温の日内リズム制御における概日時計機構の役割 Roles of the circadian clock mechanism in the regulation of daily rhythms of body temperature2022

    • Author(s)
      三宅崇仁、土居雅夫
    • Journal Title

      BRAIN and NERVE

      Volume: 74 Pages: 159-166

  • [Journal Article] Gpr19 is a circadian clock-controlled orphan GPCR with a role in modulating free-running period and light resetting capacity of the circadian clock.2021

    • Author(s)
      Yamaguchi Y, Murai I, Goto K, Doi S, Zhou H, Setsu G, Shimatani H, Okamura H, Miyake T, Doi M
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 11 Pages: 22406

    • DOI

      10.1038/s41598-021-01764-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Thermographic imaging of mouse across circadian time reveals body surface temperature elevation associated with non-locomotor body movements2021

    • Author(s)
      Shimatani H, Inoue Y, Maekawa Y, Miyake T, Yamaguchi Y, Doi M
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 16 Pages: e0252447

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0252447

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 老化と体内時計:加齢による脳内中枢時計の機能低下を中心に2021

    • Author(s)
      濵田悠貴、山口賀章、土居雅夫
    • Journal Title

      Geriatric Medicine(老年医学)

      Volume: 59 Pages: 683-687

  • [Journal Article] 時間生物学と医療の融合-現状と将来-2021

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Journal Title

      Medical Science Digest

      Volume: 47 Pages: 6-8

  • [Presentation] 組織局所ステロイド合成による加齢性マイボーム腺機能障害の時間薬物治療法的アプローチ2022

    • Author(s)
      濵田悠貴、佐々木玲奈、鑓水大介、土居雅夫
    • Organizer
      第142回日本薬学会年会
  • [Presentation] 新奇のイントラクライン機構を介した加齢性眼疾患・ドライアイ症治療法の開発―NAD+要求性ステロイド合成のサーカディアンリズムが鍵―2022

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Organizer
      第10回 AAA(Academy of Aging and CArdiovascular-Diabetes Research)
    • Invited
  • [Presentation] Circadian clock: disease etiology and drug target exploration2021

    • Author(s)
      Masao Doi
    • Organizer
      The 5th Asian Forum on Chronobiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Necessity of de novo protein translation for continuous PER2 oscillation2021

    • Author(s)
      Xinyan Shao, Takahito Miyake, and Masao Doi
    • Organizer
      The 5th Asian Forum on Chronobiology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Time as medicine and disease etiology2021

    • Author(s)
      Masao Doi
    • Organizer
      The CFBT Summer Showcase, Manchester, UK
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 微小な温度変化がもたらすmRNA翻訳速度調節と概日時計制御2021

    • Author(s)
      三宅崇仁、井ノ上雄一、土居雅夫
    • Organizer
      Biothermology Workshop - 2021's Annual Workshop
    • Invited
  • [Presentation] 脳内中枢時計の時刻調節に関与する新規オーファン受容体Gpr192021

    • Author(s)
      山口賀章、土居雅夫
    • Organizer
      生理学研究所研究会 運動器/代謝系連関による生体機能制御とその変容の仕組み
  • [Presentation] 生体リズムを基盤とした時間医薬科学の展開2021

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Organizer
      日本薬学会東海支部主催特別講演会
    • Invited
  • [Presentation] 翻訳速度制御を介した体内時計のパラメトリック制御2021

    • Author(s)
      三宅崇仁、井ノ上雄一、土居雅夫
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 生理的体温変化による体内時計のパラメトリック制御2021

    • Author(s)
      三宅崇仁、井ノ上雄一、土居雅夫
    • Organizer
      第59回日本生物物理学会
  • [Presentation] Thermographic imaging of mouse across circadian time reveals body surface temperature elevation associated with non-locomotor body movements2021

    • Author(s)
      三宅崇仁、嶋谷寛之、土居雅夫
    • Organizer
      第28回日本時間生物学会年会
  • [Presentation] A robust and sustained circadian rhythm of Per2::Luc expression in the mouse meibomian gland acinar cells2021

    • Author(s)
      グエン ファム カン ティエン、三宅崇仁、土居雅夫
    • Organizer
      第28回日本時間生物学会年会
  • [Presentation] 高血圧症の病理・薬理における時間生物学視点2021

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Organizer
      Premium Hypertension Conference
    • Invited
  • [Remarks] 学術変革領域(B) パラメトリク翻訳

    • URL

      http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/index.html

  • [Remarks] 京都大学大学院薬学研究科医薬創成情報科学専攻システムバイオロジー分野

    • URL

      https://systems-biology.pharm.kyoto-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2022-12-28  

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