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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the mechanisms of transcriptional unity by understanding spatiotemporal multifactorial interactions

Administrative Group

Project AreaElucidation of the mechanisms of transcriptional unity by understanding spatiotemporal multifactorial interactions
Project/Area Number 21H05158
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

二村 圭祐  大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (00462713)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高橋 秀尚  横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (30423544)
仙石 徹  横浜市立大学, 医学部, 准教授 (60576312)
Project Period (FY) 2021-08-23 – 2024-03-31
Keywords転写ユニティー
Outline of Annual Research Achievements

「時空間的な多因子間相互作用の理解による転写ユニティー機構の解明」領域を発展させるためには、領域内で共同研究を推進すること、技術交流を積極的に進めることが重要である。また外部に向けて、領域の活動を積極的に広報することも必要である。現在までに、二村と高橋は共同研究を行い、その成果を論文として発表した。さらに腫瘍を増悪化させる遺伝子制御機構の解明研究を行い、その成果を論文として投稿中である。また、二村は開発中の新規タンパク質を構造学的視点から深めるために仙石とディスカッションを行っている。また、高橋は仙石と転写ユニティーを構築する因子に関して共同研究を行っている。新たな技術を開発するために、領域内で積極的に議論を行い、現在の技術でアプローチできない課題や、その課題を解決するために開発するべき技術の方向性などに関するブレインストーミングを行っている。その中から、転写ユニティー機構をさらに詳細に解析する新技術を考案し、現在その開発に向けて準備を行っている。また、構造生物学においてAlpha fold2のような構造を予測・解析する新規手法についても積極的に取り入れ、領域内の研究の進捗を加速するために利用している。
広報のために転写ユニティー領域のホームページを公開している。今後、研究業績など、領域の活動を広く国民に対して公開していく予定である。また、領域内での研究交流セミナーを行うことで、さらに共同研究を増やし、迅速に研究成果を論文化できるように進めていく。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023

All Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 12 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Distinct Transcriptional Profiles in the Different Phenotypes of Neurofibroma from the Same Subject with Neurofibromatosis 12024

    • Author(s)
      Wang Wei-Ning、Koguchi-Yoshioka Hanako、Nimura Keisuke、Watanabe Rei、Tanemura Atsushi、Fujimoto Manabu、Wataya-Kaneda Mari
    • Journal Title

      Journal of Investigative Dermatology

      Volume: 144 Pages: 133~141.e4

    • DOI

      10.1016/j.jid.2023.03.1688

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] B細胞における転写制御機構2024

    • Author(s)
      二村圭祐
    • Journal Title

      臨床免疫・アレルギー科

      Volume: 81 Pages: 116-121

  • [Journal Article] A Compact Reprogrammed Genetic Code for De Novo Discovery of Proteolytically Stable Thiopeptides2024

    • Author(s)
      Vinogradov Alexander A.、Zhang Yue、Hamada Keisuke、Kobayashi Shunsuke、Ogata Kazuhiro、Sengoku Toru、Goto Yuki、Suga Hiroaki
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 146 Pages: 8058~8070

    • DOI

      10.1021/jacs.3c12037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of the human Bre1 complex bound to the nucleosome2024

    • Author(s)
      Onishi Shuhei、Uchiyama Kotone、Sato Ko、Okada Chikako、Kobayashi Shunsuke、Hamada Keisuke、Nishizawa Tomohiro、Nureki Osamu、Ogata Kazuhiro、Sengoku Toru
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-024-46910-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chimera RNA transcribed from integrated HPV18 genome with adjacent host genomic region promotes oncogenic gene expression through condensate formation.2024

    • Author(s)
      Furugori K, Suzuki H, Abe R, Horiuchi K, Akiyama T, Hirose T, Toyoda A, Takahashi H
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: - Pages: -

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GREB1 isoform 4 is specifically transcribed by MITF and required for melanoma proliferation2023

    • Author(s)
      Shinzawa Koei、Matsumoto Shinji、Sada Ryota、Harada Akikazu、Saitoh Kaori、Kato Keiko、Ikeda Satsuki、Hirayama Akiyoshi、Yokoi Kazunori、Tanemura Atsushi、Nimura Keisuke、Ikawa Masahito、Soga Tomoyoshi、Kikuchi Akira
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: 42 Pages: 3142~3156

    • DOI

      10.1038/s41388-023-02803-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of 4-acetoxypentanamide derivatives of spliceostatin A and their biological evaluation towards prostate cancer treatment2023

    • Author(s)
      Hirabayashi Satoru、Tsuyuguchi Yuko、Li Yue、Ohta Noriko、Yoshikawa Yusuke、Lin Bangzhong、Fumimoto Megumi、Nunomura Kazuto、Suzuki Takeyuki、Haruta Junichi、Nimura Keisuke、Arisawa Mitsuhiro
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 91 Pages: 129333~129333

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2023.129333

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Switching Prenyl Donor Specificities of Cyanobactin Prenyltransferases2023

    • Author(s)
      Zhang Yuchen、Hamada Keisuke、Satake Masayuki、Sengoku Toru、Goto Yuki、Suga Hiroaki
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Pages: 23893~23898

    • DOI

      10.1021/jacs.3c07373

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biallelic structural variations within FGF12 detected by long-read sequencing in epilepsy2023

    • Author(s)
      Ohori Sachiko、Miyauchi Akihiko、Osaka Hitoshi、et al.
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 6 Pages: -

    • DOI

      10.26508/lsa.202302025

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Brain monoamine vesicular transport disease caused by homozygous SLC18A2 variants: A study in 42 affected individuals2023

    • Author(s)
      Saida Ken、Maroofian Reza、Sengoku Toru、et al.
    • Journal Title

      Genetics in Medicine

      Volume: 25 Pages: 90~102

    • DOI

      10.1016/j.gim.2022.09.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA Foci in Two bi‐Allelic RFC1 Expansion Carriers2023

    • Author(s)
      Wada Taishi、Doi Hiroshi、Okubo Masaki、et al.
    • Journal Title

      Annals of Neurology

      Volume: 95 Pages: 607~613

    • DOI

      10.1002/ana.26848

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sez6l2 autoimmunity in a large cohort study2023

    • Author(s)
      Abe Megumi、Yaguchi Hiroaki、Kudo Akihiko、et al.
    • Journal Title

      Journal of Neurology, Neurosurgery & Psychiatry

      Volume: 94 Pages: 667~668

    • DOI

      10.1136/jnnp-2022-330194

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MED26‐containing Mediator may orchestrate multiple transcription processes through organization of nuclear bodies2023

    • Author(s)
      Suzuki Hidefumi、Furugori Kazuki、Abe Ryota、Ogawa Shintaro、Ito Sayaka、Akiyama Tomohiko、Horiuchi Keiko、Takahashi Hidehisa
    • Journal Title

      BioEssays

      Volume: 45 Pages: -

    • DOI

      10.1002/bies.202200178

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 腫瘍の制御を目指した遺伝子発現制御機構の解明2023

    • Author(s)
      二村圭祐
    • Organizer
      第73回日本電気泳動学会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 多因子間相互作用による遺伝子発現制御機構の解明2023

    • Author(s)
      二村圭祐
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] RNAスプライシング因子が誘発する転写異常による腫瘍増悪化機序2023

    • Author(s)
      二村圭祐
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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