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2014 Fiscal Year Annual Research Report

生合成マシナリー研究の総括

Administrative Group

Project AreaBiosynthetic machinery: Deciphering and regulating the system for bioactive metabolite diversification
Project/Area Number 22108001
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

及川 英秋  北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00185175)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywords生合成 / 天然物 / ゲノム情報 / 物質生産
Outline of Annual Research Achievements

本年度も例年通り、2回の公開シンポジウムを6月および12月に開催した(ともに東京)。異種発現を利用した物質生産法に関する方法は、かなり充実してきている印象である。天然物の生合成遺伝子クラスターの同定はかなりルーチン化し、宿主も放線菌、糸状菌および酵母と天然物の生産生物によって使い分けられ、多くの天然物が作られている印象である。まだまだ植物由来の天然物に関しては、様々な制約が多く、課題が残るものの、本領域が目指していた目標はかなり達成できたことを感じさせる成果が多かった。ポスター発表でも、共同研究が進んで成果が出ていることがわかった。以上を反映してか、企業の参加者も増えている。計画班員を中心としたメンバーが企画する本領域の関連したシンポジウムとして、9月にチトクロームP450国際会議が京都で、11月には天然薬物の開発と応用シンポジウムが、東京で開催され、本領域の関係者も口頭発表、ポスター発表に多くが参加したことから、支援させて頂いた。このほか2015年3月には日本化学会第95春季年会でイブニングセッション(船橋)、日本農芸化学年会でも当領域メンバーが中心となったシンポジウムが開催され、多くの聴衆にアピールすることができた。今後増々使用頻度が高まることが予想される技術に、任意の長さのDNAを末端配列の相同性を利用して酵母内で組み上げるgap-repair cloning法がある。この方法論は、生合成遺伝子を多数組み込んで適切な宿主に導入することで、天然物を生産することができ、海外では次第に一般化しつつある。本手法を自在に扱って研究している公募班員の守屋央朗氏に、技術移転の講習会を岡山大学で開催して頂いた。若手シンポジウム(東京)、地域密着型セミナー(札幌、首都圏)、アウトリーチ活動(サイエンスアゴラ、東京)など、各地で積極的に活動を行った。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2015 2014

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Acknowledgement Compliant: 9 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 6 results)

  • [Journal Article] Reconstitution of biosynthetic machinery for highly elaborated indole diterpene penitrem2015

    • Author(s)
      C. W. Liu, K. Tagami, A. Minami, T. Matsumoto, J. C. Frisvad, H. Suzuki, J. Ishikawa, K. Gomi, and H. Oikawa
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 2015 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1002/anie.201501072R1

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A Peptide Ligase and the Ribosome Cooperate to Synthesize the Peptide Pheganomycin2015

    • Author(s)
      M. Noike, T. Matsui, K. Ooya, I. Sasaki, S. Ohtaki, Y. Hamano, C. Maruyama, J. Ishikawa, Y. Satoh, H. Ito, H. Morita, and T. Dairi
    • Journal Title

      Nat. Chem. Biol.

      Volume: 11 Pages: 71

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Terpene synthases are widely distributed in bacteria.2015

    • Author(s)
      Y. Yamada, T. Kuzuyama, M. Komatsu, K. Shin-ya, S. Omura, D.E. Cane, H. Ikeda
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 112 Pages: 857

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Characterization of a Radical Adenosyl-L-methionine Epimerase, NeoN, in the Last Step of Neomycin B Biosynthesis2014

    • Author(s)
      F. Kudo, S. Hoshi, T. Kawashima, T. Kamachi, and T. Eguchi
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 136 Pages: 13909

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A Methyltransferase Initiates Terpene Cyclization in Teleocidin B Biosynthesis2014

    • Author(s)
      T. Awakawa, L. H. Zhang, T. Wakimoto, S. Hoshino, T. Mori, T. Ito, J. Ishikawa, M. E. Tanner and I. Abe
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 136 Pages: 9910

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Calyculin biogenesis from a pyrophosphate protoxin produced by a sponge symbiont2014

    • Author(s)
      T. Wakimoto, Y. Egami, Y. Nakashima, Y. Wakimoto, T. Mori, T. Awakawa, T. Ito, H. Kenmoku, Y. Asakawa, J. Piel and I. Abe
    • Journal Title

      Nat. Chem. Biol.

      Volume: 10 Pages: 648

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A flavonoid 3-O-glucoside: 2 ''-O-glucosyltransferase responsible for terminal modification of pollen-specific flavonols in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      K. Yonekura-Sakakibara, R. Nakabayashi, S. Sugawara, T. Tohge, T. Ito, M. Koyanagi, M. Kitajima, H. Takayama and K. Saito
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: 79 Pages: 769

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Clustering of 3D-Structure Similarity Based Network of Secondary Metabolites Reveals Their Relationships with Biological Activities2014

    • Author(s)
      S. Kanaya, T. Shirai
    • Journal Title

      Mol. Inf.

      Volume: 33 Pages: 780

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Draft genome sequence of Rhodococcus erythropolis JCM 6824, an aurachin RE antibiotic producer2014

    • Author(s)
      Kitagawa, W., Hata, M., Sekizuka, T., Kuroda, M., and Ishikawa, J.
    • Journal Title

      Genome Announcement

      Volume: 2 Pages: e01026

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Effects of α -1,3-glucan synthase gene knockout on α -amylase adsorption onto the cell wall and productivity of enzymes and metabolites in Aspergillus oryzae2015

    • Author(s)
      Katsuya Gomi
    • Organizer
      12th International Aspergillus meeting (Asperfest12)
    • Place of Presentation
      Asilomar, USA
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-17
    • Invited
  • [Presentation] Crystal Structure of a Menaquinone Biosynthetic Enzyme, MqnD, Complexed with its Substrate and Product2014

    • Author(s)
      Tohru Dairi
    • Organizer
      15th IUBMB Conference
    • Place of Presentation
      Academia Sinica, Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2014-10-21 – 2014-10-26
    • Invited
  • [Presentation] 2ndFind: a web-based support tool to find secondary metabolite biosynthetic gene cluster2014

    • Author(s)
      Ishikawa, J. and Hoshino, Y.
    • Organizer
      17th International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • Place of Presentation
      Kusadasi, Turkey
    • Year and Date
      2014-10-08 – 2014-10-12
    • Invited
  • [Presentation] Total Biosynthesis of Bioactive Fungal Metabolites2014

    • Author(s)
      Hideaki Oikawa
    • Organizer
      24th French-Japanese Symposium on Medicinal and Fine Chemistry
    • Place of Presentation
      Lyon, France
    • Year and Date
      2014-09-14 – 2014-09-17
    • Invited
  • [Presentation] Biosynthesis of fungal meroterpenoids2014

    • Author(s)
      Ikuro Abe
    • Organizer
      97th Canadian Chemistry Conference and Exhibition
    • Place of Presentation
      Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-06-01 – 2014-06-05
    • Invited
  • [Presentation] Metabolomics-based functional genomics from Arabidopsis to crops and medicinal plants2014

    • Author(s)
      Kazuki Saito
    • Organizer
      ICREA Workshop: From model systems to crops, challenge for a new era in plant biology
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2014-05-07 – 2014-05-08
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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