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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Cross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular system

Administrative Group

Project AreaCross-talk between moving cells and microenvironment as a basis of emerging order in multicellular systems
Project/Area Number 22111001
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

宮田 卓樹  名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (70311751)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 上田 昌宏  大阪大学, 理学系研究科, 教授 (40444517)
木梨 達雄  関西医科大学, 医学部, 教授 (30202039)
仲嶋 一範  慶應義塾大学, 医学部, 教授 (90280734)
西脇 清二  関西学院大学, 理工学部, 教授 (30342827)
林 茂生  理化学研究所, 形態形成シグナル研究グループ, グループディレクター (60183092)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywords細胞移動 / ゆらぎ / イメージング / 秩序形成 / シミュレーション / 細胞外環境 / 形態形成 / 定量的解析
Outline of Annual Research Achievements

班会議(9月,1月)に加えて,「若手の会」(3月)を通じて領域内の交流に務めた.さらに「研究支援」も昨年度に続き積極的に実施した.多くの共同研究が始まり,進行した.国領域の「外」へ向けて学び・教わりの機会を求めるよう以下のように活動してきた.H23年度には,「数理モデル化」についての学びの場として貴重な「定量生物学の会」の年会の開催を支援し,当領域から多数の参加者が情報収集を行なったほか,三浦(公募)がオーガナイズする学会シンポジウムにモデル構築の専門家を招待するための支援も行なった.また,公開シンポジウム(1月)に大量画像情報処理や力学的問題の先端的講師を招き,交流した.一方,当領域のアンケートで浮かび上がった研究戦略上の欲求をほぼ共有すると判断された4つの新学術領域(「細胞コミュニティー [H21発足]」,「蛍光生体イメージ [H22発足]」,「秩序形成ロジック [H22発足]」,当「動く細胞と秩序 [H22発足]」)の連携的な取り組みにも加わった.まず,「多細胞動態イニシアティブ」の会合(H23年9月,京都)においてお互いの紹介と将来展開について議論がなされ,交流的ブレインストーミングやレクチャーコースを企画する等の合意を得た.そしてH24年度,「多細胞動態の力学的制御とそのモデル化」(6月26-27日,神戸: 当領域から宮田らが話題提供),「数理生物学サマーレクチャーコース」(7月9-12日,神戸: 当領域から班員が講師として参加)開催.「秩序形成ロジック」とは,H24年度終盤(H25. 1月)の国際シンポジウム(「企画」担当,林)を共同で行った.別途,神経系を接点として「血管と神経 [H22発足]」,「神経と糖鎖 [H23発足]」との合同シンポジウムも開催(H24年7月,仙台,仲嶋らが話題提供).

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

旅費の支援も含めた技術サポートによって研究交流が進み,共同研究があらたにスタートしており,また昨年度からはじまった共同的取り組みは着実な進展を見せ,学会発表や,一部では論文投稿の段階まで進んだ.また,領域外との交流も複数の機会を持つことができ,次年度の計画に着手するなど,継続的な取り組みがなされつつある.定量的な解析やシミュレーションなど,当領域が目指す新しい取り組みにおける準備段階としての前半期間は着実に進んだ.中間評価で「A」の判定を受けた.

Strategy for Future Research Activity

H25年度には,新しい公募班員を迎えての班会議を6月に開催する. 中間評価で,これまでの営みについて示された「よく連携している」との評価を踏まえ,これまで同様に領域内で技術支援や若手交流を促進する.そのための予算措置を行なう.一方で,「意識共有」にさらなる留意が必要であることも指摘を受けたので,班会議,HP,ニュースレターを通じて領域内の概念・用語についての意思疎通を一層行なう.また,「動きの意味」についての理解を深めるため,また「共通の原理」抽出につながるように,「数理モデル化」「シミュレーション」についてこれまで以上に積極性を持つ必要があるので,新研究項目「A04動く細胞の理論」の班員を中心としてアプローチ法のプラットフォーム的な共有化につなげられるよう総括班が工夫する. 冬期には国内公開シンポジウムを予定.H26年度には,国際シンポジウムを行なう. これまで同様に,領域外(他の新学術領域,学会,研究会等)との連携・交流も行なう.また,国民に向けた発信についても一層努める.

  • Research Products

    (23 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (16 results) (of which Peer Reviewed: 16 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Improved orange and red Ca2+ indicators and photophysical considerations for optogenetic applications.2013

    • Author(s)
      Wu J
    • Journal Title

      ACS Chem. Neurosci.

      Volume: - Pages: Epub ahead

    • DOI

      10.1021/cn400012b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Asymmetric PTEN distribution regulated by spatial heterogeneity in membrane-binding state transitions.2013

    • Author(s)
      Matsuoka S
    • Journal Title

      PLoS Computational Biology

      Volume: 9 Pages: e1002862

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1002862

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mitotic cell rounding accelerates epithelial invagination2013

    • Author(s)
      Kondo T
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 494 Pages: 125-129

    • DOI

      10.1038/nature11792

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rab9 and retromer regulates retrograde trafficking of luminal protein required for epithelial tube length control.2013

    • Author(s)
      Dong B
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15;4 Pages: 1358

    • DOI

      10.1038/ncomms2347

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of centrosome translocation and microtubule organization in neocortical neurons during distinct modes of polarization.2013

    • Author(s)
      Sakakibara A
    • Journal Title

      Cereb. Cortex

      Volume: 109 Pages: Epub ahead

    • DOI

      10.1093/cercor/bhs411

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Video-rate confocal microscopy for single-molecule imaging in live cells and super-resolution fluorescence imaging2012

    • Author(s)
      Lee J
    • Journal Title

      Biophys. J.

      Volume: 103 Pages: 1691-1697

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2012.09.014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reelin-dependent ApoER2 downregulation uncouples newborn neurons from progenitor cells.2012

    • Author(s)
      Perez-Martinez F.J
    • Journal Title

      Biology Open

      Volume: 1 Pages: 1258-1263

    • DOI

      10.1242/bio.20122816

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reelin controls neuronal positioning by promoting cell-matrix adhesion via inside-out activation of integrin α5β1.2012

    • Author(s)
      Sekine K
    • Journal Title

      Neuron

      Volume: 76(2) Pages: 353-369

    • DOI

      10.1016/j.neuron.2012.07.020.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mst1 regulates integrin-dependent thymocyte trafficking and antigen-recognition in the thymus.2012

    • Author(s)
      Ueda Y
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 3 Pages: 1098

    • DOI

      10.1038/ncomms2105

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modeling the self-organized phosphatidylinositol lipid signaling system in chemotactic cells using quantitative image analysis2012

    • Author(s)
      Shibata T
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 125 Pages: 5138-5150

    • DOI

      10.1242/jcs.108373

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A phosphatidylinositol lipids system, Lamellipodin and Ena/VASP regulate dynamic morphology of multipolar migrating cells in the developing cerebral cortex.2012

    • Author(s)
      Yoshinaga S
    • Journal Title

      J. Neurosci

      Volume: 32 (34) Pages: 11643-11656

    • DOI

      10.1523/JNEUROSCI.0738-12.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Talin couples the actomyosin cortex to the plasma membrane during rear retraction and cytokinesis.2012

    • Author(s)
      Tsujioka M
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. USA

      Volume: 109(32) Pages: 12992-7

    • DOI

      10.1073/pnas.1208296109

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robo1 regulates the migration and laminar distribution of upper-layer pyramidal neurons of the cerebral cortex.2012

    • Author(s)
      Gonda Y
    • Journal Title

      Cereb. Cortex

      Volume: - Pages: Epub ahead

    • DOI

      10.1093/cercor/bhs141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-Brownian dynamics and strategy of amoeboid cell locomotion.2012

    • Author(s)
      Nishimura S
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 85I Pages: 041909

    • DOI

      10.1103/PhysRevE.85.041909

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] WAVE2-Abi2 complexcontrols growth cone activity and regulates the multipolar-bipolar transitionas well as the initiation of glia-guided migration.2012

    • Author(s)
      Xie M-J
    • Journal Title

      Cereb.Cortex

      Volume: - Pages: Epub ahead

    • DOI

      10.1093/cercor/bhs123

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Leucine-rich glioma inactivated1(Lgi1), an epilepsy-related secreted protein, has a nuclear localization signal and localizes both to the cytoplasm and nucleus of the caudal ganglionic eminence neurons2012

    • Author(s)
      Kusuzawa S
    • Journal Title

      Eur. J. Neurosci

      Volume: 36(3) Pages: 2284-2292

    • DOI

      10.1111/j.1460-9568.2012.08129.x.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 動く細胞と場のクロストークによる秩序の生成2013

    • Author(s)
      宮田卓樹ほか
    • Organizer
      第35回 CDBミーティング
    • Place of Presentation
      理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(神戸市)
    • Year and Date
      2013-01-22 – 2013-01-23
  • [Presentation] 動く細胞と場のクロストークによる秩序の生成2013

    • Author(s)
      宮田卓樹ほか
    • Organizer
      第6回 領域班会議
    • Place of Presentation
      ニチイ学館 神戸ポートアイランドセンター(神戸市)
    • Year and Date
      2013-01-21 – 2013-01-21
  • [Presentation] Extracellular proteolysis in cell behavior, and beyond2012

    • Author(s)
      西脇清二
    • Organizer
      第35回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2012-11-13 – 2012-11-13
  • [Presentation] 動く細胞と場のクロストークによる秩序の生成2012

    • Author(s)
      宮田卓樹ほか
    • Organizer
      第5回 領域班会議
    • Place of Presentation
      湘南国際村センター(三浦郡葉山町)
    • Year and Date
      2012-09-08 – 2012-09-09
  • [Presentation] 細胞外と細胞内クロストーク2012

    • Author(s)
      宮田卓樹 仲嶋一範
    • Organizer
      包括型脳科学研究推進支援ネットワーク 夏のワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台市)
    • Year and Date
      2012-07-27 – 2012-07-27
  • [Presentation] 細胞運動・組織形成での力学―化学応答2012

    • Author(s)
      宮田卓樹 仲嶋一範
    • Organizer
      第1回 多細胞動態研究のためのブレインストーミング・ワークショップ
    • Place of Presentation
      理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(神戸市)
    • Year and Date
      2012-06-26 – 2012-06-27
  • [Remarks] 動く細胞と場のクロストークによる秩序の生成

    • URL

      http://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp/d_biosci/cross-talk/

URL: 

Published: 2018-02-02  

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