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2014 Fiscal Year Annual Research Report

ノンコーディングRNAネオタクソノミ

Administrative Group

Project AreaNeo-taxonomy of noncoding RNAs
Project/Area Number 26113001
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

廣瀬 哲郎  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (30273220)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 泊 幸秀  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90447368)
Project Period (FY) 2014-07-10 – 2019-03-31
Keywords遺伝子 / ゲノム / 発現制御 / 発生・分化 / 生体分子
Outline of Annual Research Achievements

領域の円滑な運営のために、研究計画で挙げた項目について以下のように実施した。
(1) 領域会議の開催:研究領域の方向性や目的を計画班員内でお互いに理解し、さらに各計画研究の現状と実施計画を領域内で共有するために12月24日に小樽市にて第一回領域班会議を開催した。(2) 領域運営体制の確立:領域発足直後に事務担当者を新しく雇用し事務体制を整え、領域運営を滞りなく行える体制を整備した。(3) 領域ウェッブサイトの開設:領域活動を広く発信するためのウェップサイト(https://ncrna.jp)を立ち上げ、領域の活動方針、活動記録、班員情報などを掲載した。さらに新たに領域ブログを立ち上げ、計画班員によるリレーエッセイを開始した。(4) 共用機器の設置:超解像顕微鏡を東京大学分子細胞生物学研究所の専用スペースに設置し、担当計画班員が機器の立ち上げ、実験条件の至適化を経て共同利用が可能な状況までに整備した。この機器の立ち上げ作業は、当初予定していたより時間を要したため、領域班員に向けた内部講習会費を次年度に繰越し、実際の講習会は、次年度9/9~11に開催した。(5)若手支援:当該分野の若手研究者が中心に毎年開催しているRNAフロンティアミーティング(2014年9月16~18日に和歌山県で開催)の開催費の一部をサポートした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画していたすべての項目について、ほぼ予定通り遂行することができた。領域の共用機器として総括班費から購入し東京大学に設置した超解像顕微鏡も初期的な立ち上げ作業が完了し、領域内で共用できる体制が整ったことも重要な点として挙げられる。

Strategy for Future Research Activity

共用機器として設置した超解像顕微鏡をncRNAタクソノミ研究の強力な武器として有効利用し、実際の成果に結びつけることを実現する。また領域関連の若手支援を活発化し、多くの若手に国際学会参加をはじめとした経験を踏ませる機会をサポートすることに力を入れたいと考えている。

  • Research Products

    (15 results)

All 2015 2014 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] マサチューセッツ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      マサチューセッツ大学
  • [Int'l Joint Research] VIB(ベルギー)

    • Country Name
      BELGIUM
    • Counterpart Institution
      VIB
  • [Int'l Joint Research] CNRS(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      CNRS
  • [Int'l Joint Research] 西オーストラリア大学(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      西オーストラリア大学
  • [Journal Article] DNA methylation analysis of human myoblasts during in vitro myogenic differentiation: de novo methylation of promoters of muscle-related genes and its involvement in transcriptional down-regulation.2015

    • Author(s)
      Miyata K, Miyata T, Nakabayashi K, Okamura K, Naito M, Kawai T, Takada S, Kato K, Miyamoto S, Hata K, Asahara H.
    • Journal Title

      Hum Mol Genet.

      Volume: 24 Pages: 410-423

    • DOI

      10.1093/hmg/ddu457

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The lncRNA Neat1 is required for corpus luteum formation and the establishment of pregnancy in a subpopulation of mice.2014

    • Author(s)
      Nakagawa S, Shimada M, Yanaka K, Mito M, Arai T, Takahashi E, Fujita Y, Fujimori T, Standaert L, Marine JC, Hirose T.
    • Journal Title

      Development

      Volume: 141 Pages: 4618-4627

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2014.09.004.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] MicroRNAs block assembly of eIF4F translation initiation complex in Drosophila.2014

    • Author(s)
      Fukaya T, Iwakawa HO, Tomari Y
    • Journal Title

      Mol Cell

      Volume: 56 Pages: 67-78

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2014.10.016.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A single acetylation of 18S rRNA is essential for biogenesis of the small ribosomal subunit in Saccharomyces cerevisiae2014

    • Author(s)
      Ito, S., Akamatsu, Y., Noma, A., Kimura, S., Miyauchi, K., Ikeuchi, Y., Suzuki, T. and Suzuki, T
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 289 Pages: 26201-26212

    • DOI

      10.1242/dev.110544.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Respective functions of two distinct Siwi complexes assembled during PIWI-interacting RNA biogenesis in Bombyx germ cells.2014

    • Author(s)
      Nishida KM, Iwasaki YW, Murota Y, Nagao A, Mannen T, Kato Y, Siomi H and Siomi MC
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 10 Pages: 193-203

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2014.12.013

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Essential RNA acetyltransferase required for ribosome biogenesis and tRNA modification2015

    • Author(s)
      鈴木勉
    • Organizer
      Gordon Research Conference on RNA editing and modification
    • Place of Presentation
      Lucca in Tuscany, Italy
    • Year and Date
      2015-03-09
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The critical role of miRNAs at the edge of Hox-code during skeletal development2014

    • Author(s)
      浅原 弘嗣、佐藤 天平、乾 雅史
    • Organizer
      日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-11-27
    • Invited
  • [Presentation] The possible common mechanism underlying assembly of the nuclear bodies on architectural long noncoding RNAs2014

    • Author(s)
      廣瀬哲郎
    • Organizer
      Joint Australa and Japan RNA meeting 2014
    • Place of Presentation
      Sydney, Australia
    • Year and Date
      2014-11-02 – 2014-11-05
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Defining fundamental steps in the assembly of Drosophila RNAi enzyme complex2014

    • Author(s)
      泊幸秀
    • Organizer
      Joint Australia-Japan RNA Conference
    • Place of Presentation
      Sydney, Australia
    • Year and Date
      2014-11-02 – 2014-11-05
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Biogenesis of PIWI-interacting RNAs in Drosophila germline2014

    • Author(s)
      塩見美喜子
    • Organizer
      ComBio2014
    • Place of Presentation
      Canberra, Australia
    • Year and Date
      2014-09-27
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The common mechanism underlying assembly of the nuclear granules on the architectural noncoding RNAs2014

    • Author(s)
      廣瀬哲郎
    • Organizer
      ESF/EMBO Conference
    • Place of Presentation
      Polonia Castle, Poland
    • Year and Date
      2014-09-13 – 2014-09-18
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-27  

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