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2016 Fiscal Year Annual Research Report

膜の疎水領域でのリポクオリティ認識機構とナノ膜ドメインの解明

Planned Research

Project AreaQuality of lipids in biological systems
Project/Area Number 15H05901
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

岡村 康司  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (80201987)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中川 敦史  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (20188890)
Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywordsイオンチャネル / タンパク質ドメイン / 電位センサー
Outline of Annual Research Achievements

1,電位依存性プロトンチャネルHv1:ダイマー内サブユニット間相互作用をFRETで解析する目的で、これまでアフリカツメガエル卵母細胞での発現が困難であったマウスHv1のN末端側に、アフリカツメガエル卵母細胞に多く発現させることが可能なCi-Hv1のN末端側細胞質配列をつけた分子を作成したところ、アフリカツメガエル卵母細胞で電位依存性プロトン電流が出現することを確認した。このコンストラクトを用いて、S3-S4リンカー部分にシステインの変異を導入し、Cy3とCy5の二重標識を行って全細胞からのFRET計測を試みたところ、Cy3とCy5間で(つまりプロトマー間で)FRETが効率よく生じることが明らかになった。リポソーム再構成系および培養細胞などを用いた1分子計測に必要な全反射照明蛍光顕微鏡のセットアップを行った。また、電位依存的な蛍光変化を観測するために電気生理計測用のアンプと取得装置を設置して、培養細胞から膜電位固定法による蛍光観察を試みた。
2,電位依存性ホスファターゼVSP:前年度明らかにされた新規の膜相互作用部位(以下hydrophobic spineと呼ぶ)に着目し、様々なアミノ酸への置換や、酵素内の様々な部位の構造変化の蛍光計測を行った。その結果、L284、F285ともに親水性アミノ酸への変異は電位依存的酵素活性を顕著に減弱させ、疎水性アミノ酸への変異は活性を維持することが判明した。更に芳香環をもつアミノ酸(Phe、Tyr、Trp)への変異は活性を増強することが明らかになった。中川・研究分担者は、昨年度から引き続き、基質との共結晶化を試みた。本年度は等温滴定型カロリメトリーを用いて各種リン脂質との結合定数を測定し、結晶化に適した安定な複合体の探索を行い,安定な複合体を中心に結晶化スクリーニングを行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度の解析において電位依存性プロトンチャネルHv1/VSOPへの不飽和脂肪酸の作用にはダイマー内プロトマー間の相互作用が重要であることが判明した。サブユニット間の相互作用を詳細に明らかにするため蛍光分子Cy3、Cy5をアミノ酸に導入して実験を行い、全細胞からのFRET計測が可能であることを確認した。中川・研究分担者とのVSPの基質との共結晶化については精製、結晶化ともに条件検討が十分に行われ、現在良い結晶が得られつつある。一方Hv1/VSOPとアラキドン酸との共結晶化は必ずしも容易ではないことから、X線結晶構造解析以外の解析法を検討していく必要がある。

Strategy for Future Research Activity

電位依存性プロトンチャネルHv1/VSOPについては、1分子FRETの計測系に向けて、蛍光分子ラベル部位の最適化を試みるとともに全反射蛍光顕微鏡での観察条件の検討を始める。また有田班から脂質ライブラリーの提供を受け、アラキドン酸以外の不飽和脂肪酸について電気生理学測定を行い、構造活性相関について明らかにしていく。また、NMRにより不飽和脂肪酸とHv1/VSOPとの直接相互作用を解析する目的で公募班員の大澤博士と連携してコンストラクトの検討を行う。
VSPについては、酵素内の様々な部位の構造変化を非天然蛍光アミノ酸であるAnapを用いて解析し、今回見出された新規膜相互作用部位がどのように電位依存性酵素活性を制御するのかを明らかにする。更にこの結果を、中川・研究分担者が進めるX線結晶構造の情報と対照し実験を再デザインしていく。

  • Research Products

    (36 results)

All 2017 2016

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (27 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] AMPA glutamate receptors are required for sensory-organ formation and morphogenesis in the basal chordate.2017

    • Author(s)
      Shinobu Hirai, Kohji Hotta, Yoshihiro Kubo, Atsuo Nishino, Shigeo Okabe, Yasushi Okamura, Haruo Okado
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1073/pnas.1612943114

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetically encoded bioluminescent voltage indicator for multi-purpose use in wide range of bioimaging.2017

    • Author(s)
      Inagaki S, Tsutsui H, Suzuki K, Agetsuma M, Arai Y, Jinno Y, Bai G, Daniels M, Okamura Y, Matsuda M, and Nagai T
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 42398

    • DOI

      10.1038/srep42398

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comparison between mouse and sea urchin orthologs of voltage-gated proton channel suggests role of S3 segment in activation gating2016

    • Author(s)
      Sakata S, Miyawaki N, McCormack TJ, Arima H, Kawanabe A, Ozkucur N, Kurokawa T, Jinno Y, Fujiwara Y, Okamura Y
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Acta.

      Volume: 1858 Pages: 2972-2983

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2016.09.008.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Voltage-dependent motion of the catalytic region of voltage-sensing phosphatase monitored by a fluorescent amino acid2016

    • Author(s)
      Sakata S, Jinno Y, Kawanabe A, Okamura Y
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.

      Volume: 113 Pages: 7521-7526

    • DOI

      10.1073/pnas.1604218113

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural basis for the membrane association of ankyrinG via palmitoylation.2016

    • Author(s)
      Fujiwara Y, Kondo H, Shirota M, Kobayashi M, Takeshita K, Nakagawa A, Okamura Y, Kinoshita K.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: 23981

    • DOI

      10.1038/srep23981.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 電位依存性プロトンチャネルにおけるプロトン透過機構について2016

    • Author(s)
      岡村 康司
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 56 Pages: 154-158

    • DOI

      10.2142/biophys.56.154

    • Open Access
  • [Journal Article] Simple scheme of lipid enzyme can explain complex lives of phosphoinositides.2016

    • Author(s)
      Okamura Y.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 113 Pages: 7012-7014

    • DOI

      10.1073/pnas.1607427113

  • [Journal Article] SPring-8 BL44XU, beamline designed for structure analysis of large biological macromolecular assemblies2016

    • Author(s)
      Akifumi Higashiura, Eiki Yamashita, Masato Yoshimura, Kazuya Hasegawa, Yukito Furukawa, Takashi, Kumasaka, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Tomitake Tsukihara and Atsushi Nakagawa
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings

      Volume: 1741 Pages: -

    • DOI

      10.1063/1.492851

  • [Presentation] 電位依存性ホスファターゼにおける膜相互作用の動態と役割2017

    • Author(s)
      岡村 康司、川鍋 陽、西澤 和久、中川 敦史、成田 宏隆、坂田 宗平、神野 有香
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-30 – 2017-03-30
    • Invited
  • [Presentation] 電位依存性ホスファターゼの構造生物学的研究2017

    • Author(s)
      中川 敦史、成田 宏隆、神田 直樹、川鍋 陽、岡村 康司
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-30 – 2017-03-30
  • [Presentation] カルシウムイオン透過性を持つ電位センサードメインの機能解析2017

    • Author(s)
      有馬 大貴、筒井 秀和、岡村 康司
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-29 – 2017-03-29
  • [Presentation] マウス好中球においてHv1/VSOPはfMLPに対する走化性行動を抑制する2017

    • Author(s)
      大河内 善史、岡村 康司
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-29 – 2017-03-29
  • [Presentation] 電位依存性ホスファターゼVSPの新規膜相互作用部位の重要性2017

    • Author(s)
      川鍋 陽、橋本 真宜、米澤 智子、神野 有香、坂田 宗平、岡村 康司
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-29 – 2017-03-29
  • [Presentation] 初代培養ミクログリアにおける電位依存性プロトンチャネルのダイナミクス2017

    • Author(s)
      河合 喬文、川村 名子、小泉 修一、阿部 学、崎村 建司、岡村 康司
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-28 – 2017-03-28
  • [Presentation] Voltage-gated proton channel in zebrafish (DrHv1): from culture dish to living animal2017

    • Author(s)
      Adisorn Ratanayotha, Takafumi Kawai, Yasushi Okamura
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2017-03-28 – 2017-03-28
  • [Presentation] Principle and biodiversity of voltage sensor domain in channels and enzyme2017

    • Author(s)
      Yasushi Okamura
    • Organizer
      Campus Asia faculty meeting
    • Place of Presentation
      大阪府吹田市
    • Year and Date
      2017-02-16 – 2017-02-16
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 膜電位非印加状態で開状態をとるVSOP/Hv1変異体から見る2量体間協調性2016

    • Author(s)
      木村仁美、持田理子、渋村里美、中川敦史、岡村康司、竹下浩平
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2016-12-02 – 2016-12-02
  • [Presentation] 新規電位センサータンパク質VSOP2のX線結晶構造解析に向けて2016

    • Author(s)
      西川翔士、成田宏隆、岡村康司、中川敦史
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2016-12-02 – 2016-12-02
  • [Presentation] Crossroad of electricity and lipid signaling: voltage-sensing phosphoinositide phosphatase (VSP)2016

    • Author(s)
      Yasushi Okamura, Akira Kawanabe, Souhei Sakata
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-11-30
    • Invited
  • [Presentation] 自由行動マウスの脳活動計測を可能にする化学発光膜電位センサーの開発2016

    • Author(s)
      稲垣成矩、揚妻正和、筒井秀和、新井由之、鈴木和志、神野有香、岡村康司、松田知己、永井健治
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-11-30
  • [Presentation] Direct observation og voltage-gated proton channels by high speed AFM2016

    • Author(s)
      Hayato Yamashita, Akira Kawanabe, Yasushi Okamura, Msayuki Abe
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      茨城県つくば市
    • Year and Date
      2016-11-27 – 2016-11-27
  • [Presentation] Development of a chemiluminescent voltage indicator applicable to brain activity recording in freely moving mice2016

    • Author(s)
      Shigenori Inagaki, Masakazu Agetsuma, Hidekazu Tsutsui, Yoshiyuki Arai, Kazushi Suzuki, Yuka Jinno, Yasushi Okamura, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      茨城県つくば市
    • Year and Date
      2016-11-26 – 2016-11-26
  • [Presentation] The role of membrane interacting region of phosphatase domain in voltage-sensing phosohatase (VSP)2016

    • Author(s)
      Akira Kawanabe, Masaki Hashimoto, Tomoko Yonezawa, Yuka Jinno, Souhei Sakata, Yasushi Okamura
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      茨城県つくば市
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-25
  • [Presentation] Metal binding to the voltage-gated proton channel VSOP studied by ATR-FTIR2016

    • Author(s)
      Masayo Iwaki, Kohei takeshita, Yasushi Okamura, Atushi Nakagawa, Hideki Kandori
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      茨城県つくば市
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-25
  • [Presentation] Characterization of Voltage-Gated Proton Channel in Zebrafish. (DrHv1)2016

    • Author(s)
      Adisorn Ratanayotha,Takafumi Kawai, Yasushi Okamura
    • Organizer
      第109回近畿生理学談話会
    • Place of Presentation
      大阪府大阪市
    • Year and Date
      2016-11-05 – 2016-11-05
  • [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルノックアウトマウスの代謝表現型解析2016

    • Author(s)
      辰巳翔基、河合喬文、山本浩靖、崎村建司、木原進士、岡村康司
    • Organizer
      第109回近畿生理学談話会
    • Place of Presentation
      大阪府大阪市
    • Year and Date
      2016-11-05 – 2016-11-05
  • [Presentation] 細胞内膜の膜電位を可視化する-貪食細胞の食胞膜電位の測定-2016

    • Author(s)
      大河内善史、岡村康司
    • Organizer
      第109回近畿生理学談話会
    • Place of Presentation
      大阪府大阪市
    • Year and Date
      2016-11-05 – 2016-11-05
  • [Presentation] CatSperの電位センサードメインはカルシウムイオン透過性を持つ2016

    • Author(s)
      有馬大貴、筒井秀和、吉田学、岡村康司
    • Organizer
      第3回ホヤ研究会
    • Place of Presentation
      大阪府豊中市
    • Year and Date
      2016-10-15 – 2016-10-15
  • [Presentation] Molecular mechanisms of voltage-sensing phosphatase, VSP2016

    • Author(s)
      Yasushi Okamura
    • Organizer
      2016 International Conference of Physiological Sciences
    • Place of Presentation
      中国・北京
    • Year and Date
      2016-09-28 – 2016-09-28
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The common regulation of phosphatase activity of voltage-sensing phostophase (VSP) and PTEN by conserved putative membrane interacting region2016

    • Author(s)
      Akira Kawanabe, Tomoko Yonezawa, Yuka Jinno, Souhei Sakata, Yasushi Okamura
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-25
  • [Presentation] How does voltage sensor domain regulate downstream effecter?: lesson from voltage-sensor domain proteins2016

    • Author(s)
      Yasushi Okamura, Souhei Sakata, Akira Kawanabe, Yuichiro Fujiwara, Yuka Jinno
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2016-07-22 – 2016-07-22
    • Invited
  • [Presentation] Bidirectional regulation of ROS production by voltage-gated proton channels in microglia2016

    • Author(s)
      Takafumi Kawai,Yoshifumi Okochi,Tomohiko Ozaki,Yoshio Imura,Kenji Sakimura,Schuichi Koizumi,Toshihide Yamashita,Yasushi Okamura
    • Organizer
      第39回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2016-07-22 – 2016-07-22
  • [Presentation] 膜の疎水領域でのリポクオリティ認識機構とナノなくドメインの解明2016

    • Author(s)
      岡村康司
    • Organizer
      新学術領域研究「脂質クオオリティが解き明かす生命現象」第2回領域会議
    • Place of Presentation
      静岡県伊豆市
    • Year and Date
      2016-07-20 – 2016-07-20
  • [Presentation] Principle and biodiversity of voltage sensor domain proteins2016

    • Author(s)
      Yasushi Okamura
    • Organizer
      Dutch Neuroscience Meeting
    • Place of Presentation
      Lunteren, Netherlands
    • Year and Date
      2016-06-10 – 2016-06-10
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 電位依存性ホスファターゼVSPとPTENに共通する膜との相互作用部位の重要性2016

    • Author(s)
      川鍋陽、米澤智子、岡村康司
    • Organizer
      第63回日本生化学会 近畿支部例会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市
    • Year and Date
      2016-05-21 – 2016-05-21
  • [Book] Reference Module in Life Sciences, 'Voltage-gated proton channels'2017

    • Author(s)
      Y. Okamura
    • Total Pages
      199-222
    • Publisher
      Elsevier

URL: 

Published: 2018-01-16  

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