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2015 Fiscal Year Annual Research Report

リポクオリティが演出する膜の形態と性質

Planned Research

Project AreaQuality of lipids in biological systems
Project/Area Number 15H05902
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

藤本 豊士  名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (50115929)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 末次 志郎  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (70345031)
Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywords膜脂質 / 電子顕微鏡 / 膜ドメイン / 脂質結合ドメイン
Outline of Annual Research Achievements

1)細胞内物質輸送など多様な現象に関与するホスファチジルイノシトール3,5-二燐酸(PtdIns(3,5)P2)の局在を急速凍結・凍結割断レプリカ標識電子顕微鏡法で解析するための方法を新たに開発した。プローブとして出芽酵母ATG18にGST, 4xFLAGのタグを付加したリコンビナント蛋白質を精製し、抗FLAG抗体、プロテインA標識金コロイドを用いて可視化した。上記プローブはホスファチジルイノシトール3燐酸(PtdIns3P)にも結合を示すが、過剰量のp40phoxのPXドメインを共存させてPtdIns3Pとの反応を抑制した。この方法を用いることにより、出芽酵母では高浸透圧処理した際に形成される液胞膜のラフト様ドメインにPtdIns(3,5)P2が集中すること、一方、哺乳類細胞ではにPtdIns(3,5)P2は管・小胞状構造を示すエンドソームの小胞部分に集まり、管状部分にはほとんど存在しないことなどを見出した。
2)BARタンパク質の中から、脂質膜への挿入部位を持つと推定されるタンパク質としてendophilinに注目した。BARドメインは、ダイマーとして機能するが、ほとんどのBARドメインと脂質膜の相互作用は、塩基性アミノ酸残基と酸性脂質の間の静電的な相互作用によっている。BARドメインの中でもendophilinは特に、その両端及び中央部に両親媒性部位を持つ。この両親媒性部位は、二重層からなる脂質膜の一層に挿入されることから、脂肪酸の多様性を認識できる可能性がある。本年度の研究では、様々な組織より抽出された脂質とendophilinの結合を調べたところ、脂質膜との結合や、結合の結果生じる脂質膜の形態の違いを見出した。また、ARDを含むタンパク質の中にも、脂質の組成により異なる結合を示すものを見出した。すなわち、endophilinやARDを含むタンパク質は、組織により異なるリポクオティの違いを認識できる可能性がある。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は新たな膜脂質可視化法の開発に成功し、またリポクオリティの違いを認識できる可能性のある蛋白質を見出した。いずれも翌年度以降の研究の発展に直結する成果であると言える。

Strategy for Future Research Activity

昨年度の成果に基づいた研究の展開を目指すだけでなく、さらに新たな方向をめざす研究を開始し、リポクオリティの意義を明らかにする取り組みを展開する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2016 2015

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Higher-order assemblies of BAR domain proteins for shaping membranes2016

    • Author(s)
      Suetsugu S
    • Journal Title

      Microscopy

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfw002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate-rich membrane domains in endosomes and lysosomes2016

    • Author(s)
      Takatori S, Tatematsu T, Cheng J, Matsumoto J, Akano T, Fujimoto T
    • Journal Title

      Traffic

      Volume: 17 Pages: 154-167

    • DOI

      10.1111/tra.12346

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A novel imaging method revealed phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate-rich domains in the endosome/lysosome membrane2016

    • Author(s)
      Takatori S, Fujimoto T
    • Journal Title

      Commun Integr Biol

      Volume: 9 Pages: in press

    • DOI

      10.1080/19420889

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Possible regulation of caveolar endocytosis and flattening by phosphorylation of F-BAR domain protein PACSIN2/Syndapin II2015

    • Author(s)
      Senju Y, Suetsugu S
    • Journal Title

      Bioarchitecture

      Volume: 5 Pages: 70-77

    • DOI

      10.1080/19490992.2015.1128604

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphorylation of PACSIN2 by protein kinase C triggers the removal of caveolae from the plasma membrane2015

    • Author(s)
      Senju Y, Rosenbaum E, Shah C, Hamada-Nakahara S, Itoh Y, Yamamoto K, Hanawa-Suetsugu K, Daumke O, Suetsugu S
    • Journal Title

      J Cell Sci

      Volume: 128 Pages: 2766-2780

    • DOI

      10.1242/jcs.167775

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Yeast Ivy1p Is a Putative I-BAR-domain Protein with pH-sensitive Filament Forming Ability in vitro2015

    • Author(s)
      Itoh Y, Kida K, Hanawa-Suetsugu K, Suetsugu S
    • Journal Title

      Cell Struct Funct

      Volume: 41 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1247/csf.15014

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Electron Microscopy to observe the nano-scale distribution of membrane lipids2016

    • Author(s)
      Toyoshi Fujimoto
    • Organizer
      The 7th Asia-Pacific Congress of Anatomy
    • Place of Presentation
      シンガポール国立大学,Singapore
    • Year and Date
      2016-03-17 – 2016-03-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Looking at the nano-level membrane lipid distribution by electron microscopy2015

    • Author(s)
      Toyoshi Fujimoto
    • Organizer
      The 12th Multinational Congress on Microscopy (MCM2015)
    • Place of Presentation
      Eger, Hungary
    • Year and Date
      2015-08-23 – 2015-08-28
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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