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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Morphology and characteristics of membranes directed by lipoquality

Planned Research

Project AreaQuality of lipids in biological systems
Project/Area Number 15H05902
Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

藤本 豊士  順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任教授 (50115929)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 末次 志郎  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (70345031)
Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywords膜脂質 / 電子顕微鏡 / 脂質結合タンパク質 / F-BAR / エンドフィリン
Outline of Annual Research Achievements

1)酵母細胞膜のホスファチジルイノシトール4,5-2燐酸分布を凍結割断レプリカ標識電顕法(QF-FRL法)で詳細に解析し、エイソソームで裏打ちされた陥凹構造(MCC)に高度に集中することを明らかにした。MCCへの集中は静止期でさらに顕著になり、ATP欠乏条件で短時間培養した場合などでも維持された。一方、蛍光バイオセンサーを用いた方法では静止期、ATP欠乏条件では細胞膜のホスファチジルイノシトール4,5-2燐酸を検出できなかった。これらの結果は蛍光バイオセンサーがMCCのホスファチジルイノシトール4,5-2燐酸を認識できないことを示唆する。
2)エンドフィリンの脂質膜切断に関して、ライブイメージングなどにより、脂質膜の切断は、エンドフィリンの程よい強さの膜結合が、エンドフィリンの膜局在に偏りを生じさせることに依存することを見出した。この際に、エンドフィリンの膜への結合度は変化せず、解離のみが変化した。また、F-BARドメインのほとんどは、陥入膜形成に関与しているが、GAS7のF-BARドメインは、その特徴的なループ構造により、脂質膜表面で、平面状に重合し、脂質膜の電荷に依存して、ファゴサイトーシス構造を形成することを見出した。さらに、ARDを含むタンパク質の中にも、ANKHD1などの脂質の組成により異なる結合を示すものを見出した。ANKHD1の両親媒性ヘリックスに注目し、変異を導入し、両親媒性ヘリックス依存的な膜変形活性を見出した。すなわち、エンドフィリン、MTSS1、GAS7などのBARドメインを含むタンパク質やARDを含むタンパク質は、組織により異なるリポクオティの違いを認識できる可能性がある。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2020 2019

All Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 4 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] ESCRT machinery mediates selective microautophagy of endoplasmic reticulum in yeast2020

    • Author(s)
      Schafer Jasmin A、Schessner Julia P、Bircham Peter W、Tsuji Takuma、Funaya Charlotta、Pajonk Oliver、Schaeff Katharina、Ruffini Giulia、Papagiannidis Dimitrios、Knop Michael、Fujimoto Toyoshi、Schuck Sebastian
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 39 Pages: -

    • DOI

      10.15252/embj.2019102586

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] オルガネラ膜上のリン脂質分子分布の可視化2020

    • Author(s)
      辻琢磨、藤本豊士
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: - Pages: -

  • [Journal Article] The membrane binding and deformation property of vaccinia virus K1 ankyrin repeat domain protein2020

    • Author(s)
      Kitamata Manabu、Hotta Mitsukuni、Hamada‐Nakahara Sayaka、Suetsugu Shiro
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 25 Pages: 187~196

    • DOI

      10.1111/gtc.12749

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of caveolae through cholesterol-depletion dependent tubulation by PACSIN2/Syndapin II2020

    • Author(s)
      Amir Aini Gusmira、Takemura Kazuhiro、Hanawa-Suetsugu Kyoko、Oono-Yakura Kayoko、Yasuhara Kazuma、Kitao Akio、Suetsugu Shiro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2020.03.25.008854

    • Open Access
  • [Journal Article] Predominant localization of phosphatidylserine at the cytoplasmic leaflet of the ER, and its TMEM16K-dependent redistribution2019

    • Author(s)
      Tsuji Takuma、Cheng Jinglei、Tatematsu Tsuyako、Ebata Aoi、Kamikawa Hiroki、Fujita Akikazu、Gyobu Sayuri、Segawa Katsumori、Arai Hiroyuki、Taguchi Tomohiko、Nagata Shigekazu、Fujimoto Toyoshi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 13368~13373

    • DOI

      10.1073/pnas.1822025116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polarized PtdIns(4,5)P2distribution mediated by a voltage-sensing phosphatase (VSP) regulates sperm motility2019

    • Author(s)
      Kawai Takafumi、Miyata Haruhiko、Nakanishi Hiroki、Sakata Souhei、Morioka Shin、Sasaki Junko、Watanabe Masahiko、Sakimura Kenji、Fujimoto Toyoshi、Sasaki Takehiko、Ikawa Masahito、Okamura Yasushi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 26020~26028

    • DOI

      10.1073/pnas.1916867116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 電子顕微鏡を用いた観察2019

    • Author(s)
      辻琢磨、藤本豊士
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 別冊 Pages: 260-267

  • [Journal Article] PACSIN2 Interacts with Nonstructural Protein 5A and Regulates Hepatitis C Virus Assembly2019

    • Author(s)
      Nguyen Lap P.、Tran Si C.、Suetsugu Shiro、Lim Yun-Sook、Hwang Soon B.
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 94 Pages: -

    • DOI

      10.1128/JVI.01531-19

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Phagocytosis is mediated by two-dimensional assemblies of the F-BAR protein GAS72019

    • Author(s)
      Hanawa-Suetsugu K、Itoh Y、Ab Fatah M、Nishimura T、Takemura K、Takeshita K、Kubota S、Miyazaki N、Wan Mohamad Noor Wan Nurul Izzati、Inaba Takehiko、Nguyen Nhung Thi Hong、Hamada-Nakahara S、Oono-Yakura K、Tachikawa M、Iwasaki K、Kohda D、Yamamoto M、Kitao A、Shimada A、Suetsugu S
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12738-w

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Membrane-Deformation Ability of ANKHD1 Is Involved in the Early Endosome Enlargement2019

    • Author(s)
      Kitamata Manabu、Hanawa-Suetsugu Kyoko、Maruyama Kohei、Suetsugu Shiro
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 17 Pages: 101~118

    • DOI

      10.1016/j.isci.2019.06.020

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Membrane Deformation Switching of an Endocytic Protein by Membrane Electrostatic Charge and Packing2019

    • Author(s)
      Kida Kazuki、Kitamata Manabu、Ikeda Kazutaka、Takemura Kazuhiro、Inaba Takehiko、Hayashi Yugo、Hanawa-Suetsugu Kyoko、Kamikubo Hironari、Kitao Akio、Arita Makoto、Suetsugu Shiro
    • Journal Title

      SSRN Electronic Journal

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.2139/ssrn.3471315

    • Open Access
  • [Presentation] 脂質の細胞生物学 ~脂肪滴と脂質ドメインの解析~2020

    • Author(s)
      藤本豊士
    • Organizer
      The Future of Diabetes Conference 2020
    • Invited
  • [Presentation] Phospholipid landscape in cellular membranes2019

    • Author(s)
      Toyoshi Fujimoto
    • Organizer
      60th ICBL LipoQuality Satellite Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The role of the lipid composition on the membrane deformation by the BAR domain proteins2019

    • Author(s)
      Shiro Suetsugu
    • Organizer
      EMBO Workshop Caveolae and nanodomains: Translating structural principles and dynamics into function
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The mode switch of endophilin membrane deformation based on packing-defects and electrostatic charge2019

    • Author(s)
      Shiro Suetsugu
    • Organizer
      60th ICBL LipoQuality Satellite Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2021-03-11  

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