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2016 Fiscal Year Annual Research Report

環境刺激による細胞リプログラミング制御

Planned Research

Project AreaIntegrative system of autonomous environmental signal recognition and memorization for plant plasticity
Project/Area Number 15H05961
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

杉本 慶子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (30455349)

Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywordsエピジェネティックス / ヒストン修飾 / 細胞リプログラミング / 傷害ストレス / シロイヌナズナ
Outline of Annual Research Achievements

植物細胞は一般的に動物細胞に比べて分化全能性を発揮しやすく、一旦分化した細胞が傷害ストレスなどの過酷な環境刺激に応答して脱分化、再分化するが、その分子機構はほとんど解明されていない。本研究では、環境ストレスがクロマチン状態によって規定される細胞記憶をリセットすることにより細胞リプログラミングを誘導するという仮説を検証し、その分子機構を解明する。具体的には植物のエピジェネティックな細胞記憶の分子実体の解明、細胞リプログラミングを誘導する環境シグナル伝達機構の解明、環境ストレスによる細胞リプログラミングの分子機構の解明を目指している。先行研究から、シロイヌナズナでは傷害及び高温ストレスがWIND1-4を初めとするリプログラミング遺伝子の発現を誘導することを見いだしている。今年度はこれらの環境ストレスによって発生する初期シグナル分子の探索を進め、これらのシグナルがリプログラミング遺伝子の発現を誘導する転写制御ネットワークの解析を進めた。今年度は特に高温ストレス応答のシグナル伝達に関与することが知られる転写因子群が細胞リプログラミングを制御することを見いだし、その分子機構の解明を進めた。またWIND1遺伝子の発現が幹細胞維持に関与する転写因子ERF115とその相互作用因子PAT1によって制御されること、またWIND1が茎葉再生を促進するENHANCER OF SHOOT REGENERATION 1 (ESR1) 遺伝子の発現を直接誘導することで傷口からの再生を促進することを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでに細胞リプログラミングを誘導する環境シグナル伝達機構の一部の解明に成功し、今年度はWIND1-ESR1経路に関する論文をPlant Cell誌に発表することができた。またヒストン修飾を介した植物のエピジェネティックな細胞記憶の分子実体の解明にも着手し、ChIP-seq, RNA-seqの実験系を順調に立ち上げることができた。

Strategy for Future Research Activity

これまでに同定したリプログラミング遺伝子の多くは非ストレス条件下ではPRC2によるH3K27me3を受け発現抑制されるが、ストレス条件下で発現が誘導される。今後はこうしたエピジェネティックな発現抑制が解除される仕組みの解明を進める。ストレス条件下におけるリプログラミング遺伝子近傍のクロマチン修飾の変化を解析し、ヒストンの脱メチル化やアセチル化の変化と遺伝子発現制御との関係を解析する。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Sainsbury Lab Cambridge University(United Kingdom)

    • Country Name
      United Kingdom
    • Counterpart Institution
      Sainsbury Lab Cambridge University
  • [Int'l Joint Research] IISER(India)

    • Country Name
      India
    • Counterpart Institution
      IISER
  • [Journal Article] Molecular networks orchestrating plant cell growth2017

    • Author(s)
      Franciosini Anna、Rymen Bart、Shibata Michitaro、Favero David S、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      Current Opinion in Plant Biology

      Volume: 35 Pages: 98~104

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2016.11.010

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] WIND1 Promotes Shoot Regeneration through Transcriptional Activation of ENHANCER OF SHOOT REGENERATION1 in Arabidopsis2016

    • Author(s)
      Iwase Akira、Harashima Hirofumi、Ikeuchi Momoko、Rymen Bart、Ohnuma Mariko、Komaki Shinichiro、Morohashi Kengo、Kurata Tetsuya、Nakata Masaru、Ohme-Takagi Masaru、Grotewold Erich、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 29 Pages: 54~69

    • DOI

      10.1105/tpc.16.00623

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The heterodimeric transcription factor complex ERF115?PAT1 grants regeneration competence2016

    • Author(s)
      Heyman Jefri、Cools Toon、Canher Balkan、Shavialenka Sviatlana、Traas Jan、Vercauteren Ilse、Van den Daele Hilde、Persiau Geert、De Jaeger Geert、Sugimoto Keiko、De Veylder Lieven
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 2 Pages: 16165~16165

    • DOI

      10.1038/nplants.2016.165

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Transcriptional Regulation of Arabidopsis Polycomb Repressive Complex 2 Coordinates Cell-Type Proliferation and Differentiation2016

    • Author(s)
      de Lucas Miguel、Pu Li、Turco Gina、Gaudinier Allison、Morao Ana Karina、Harashima Hirofumi、Kim Dahae、Ron Mily、Sugimoto Keiko、Roudier Francois、Brady Siobhan M.
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 28 Pages: 2616~2631

    • DOI

      https://doi.org/10.1105/tpc.15.00744

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Plant regeneration: cellular origins and molecular mechanisms2016

    • Author(s)
      Ikeuchi Momoko、Ogawa Yoichi、Iwase Akira、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      Development

      Volume: 143 Pages: 1442~1451

    • DOI

      10.1242/dev.134668

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Epigenetic control of plant cellular reprogramming2017

    • Author(s)
      Sugimoto K
    • Organizer
      Joint Meeting for German and Japanese Societies of Developmental Biologists
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Epigenetic control of plant cellular reprogramming2016

    • Author(s)
      Sugimoto K
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Totipotency: the plant’s view2016

    • Author(s)
      Sugimoto K
    • Organizer
      Lausanne Genomics Days
    • Invited
  • [Remarks] Cell Function Research Team

    • URL

      http://cellfunction.riken.jp/index.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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