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2018 Fiscal Year Annual Research Report

環境刺激による細胞リプログラミング制御

Planned Research

Project AreaIntegrative system of autonomous environmental signal recognition and memorization for plant plasticity
Project/Area Number 15H05961
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

杉本 慶子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (30455349)

Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywordsエピジェネティックス / ヒストン修飾 / 細胞リプログラミング / 傷害ストレス / シロイヌナズナ
Outline of Annual Research Achievements

これまでにシロイヌナズナでは傷害ストレスが細胞リプログラミングを誘導することを明らかにしてきた。今年度は主に傷害ストレスシグナルがリプログラミング遺伝子の発現を誘導する転写制御ネットワークの解析を進めた。特に植物の非生物的ストレス応答に関与することが知られる転写因子が傷害誘導性の細胞リプログラミングを制御することを見いだし、変異体や過剰発現体を用いたRNAseq解析を行って下流因子の同定を進めた。特にこの転写因子がWIND1の発現を制御する上流制御因子として機能する可能性を検討した。またこれまでに行ったChIPseq及びRNAseq データを用いてWIND1の下流因子の解析を進め、WIND1が細胞リプログラミングだけでなく、広範な傷害ストレス応答に関与することを見いだした。また傷害誘導後のヒストン修飾の経時的な変化と遺伝子発現変化の相関について解析を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は傷害誘導性の転写制御ネットワークを論文化することができた。また傷害誘導性の遺伝子発現にヒストンのアセチル化が重要であることを示唆するデータを得ることができ、研究は順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

今後はWIND1の上流、下流因子候補の機能解析を進め、ストレス受容から細胞リプログラミング起動をつなぐ転写制御ネットワークの全貌を明らかにしていく。またエピジェネティック関連の変異体や薬剤を用いて細胞リプログラミングへの関与をさらに詳細に解析する。

  • Research Products

    (6 results)

All 2018 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Sainsbury Lab Cambridge University(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Sainsbury Lab Cambridge University
  • [Int'l Joint Research] University of California, Davis(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California, Davis
  • [Journal Article] WIND1 induces dynamic metabolomic reprogramming during regeneration in Brassica napus2018

    • Author(s)
      Iwase Akira、Mita Kento、Favero David S.、Mitsuda Nobutaka、Sasaki Ryosuke、Kobayshi Makoto、Takebayashi Yumiko、Kojima Mikiko、Kusano Miyako、Oikawa Akira、Sakakibara Hitoshi、Saito Kazuki、Imamura Jun、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      Developmental Biology

      Volume: 442 Pages: 40~52

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2018.07.006

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Gene Regulatory Network for Cellular Reprogramming in Plant Regeneration2018

    • Author(s)
      Ikeuchi Momoko、Shibata Michitaro、Rymen Bart、Iwase Akira、B?gman Anne-Maarit、Watt Lewis、Coleman Duncan、Favero David S、Takahashi Tatsuya、Ahnert Sebastian E、Brady Siobhan M、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 59 Pages: 770~782

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy013

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] GTL1 and DF1 regulate root hair growth through transcriptional repression of ROOT HAIR DEFECTIVE 6-LIKE 4 in Arabidopsis2018

    • Author(s)
      Shibata Michitaro、Breuer Christian、Kawamura Ayako、Clark Natalie M.、Rymen Bart、Braidwood Luke、Morohashi Kengo、Busch Wolfgang、Benfey Philip N.、Sozzani Rosangela、Sugimoto Keiko
    • Journal Title

      Development

      Volume: 145 Pages: 159707

    • DOI

      10.1242/dev.159707

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Remarks] 細胞機能研究チーム

    • URL

      http://cellfunction.riken.jp/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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