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2016 Fiscal Year Annual Research Report

セントロメアを中心とした染色体構築原理

Planned Research

Project AreaChromosome Orchestration System
Project/Area Number 15H05972
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

深川 竜郎  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (60321600)

Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywordsセントロメア / 動原体 / 高次クロマチン / エピジェネティックス / タンパク質複合体 / ゲノム科学
Outline of Annual Research Achievements

1) セントロメアの再構築及び他の染色体機能ドメインとの組み合わせによるモデル化染色体の作成
27年度より開始したin vitroでセントロメアの再構築を継続して進め、複数の複合体の再構成の完了を確認した。これと並行して、染色体工学的手法を用いて、培養細胞や酵母細胞内でセントロメアの再構築を目指した。ニワトリ細胞中で、ある任意の染色体上の非セントロメア領域に適当なセントロメアタンパク質を集合させて、機能的なセントロメアを再構築し、人工セントロメアを保持する染色体を作成した。この染色体をヒト細胞へ移行させたが、安定性の点でやや問題があり、この方法が直接使用できないと考えている。
2) セントロメア構造のダイナミックな構造変換
深川らは、ニワトリの細胞を対象にセントロメアタンパク質抗体を用いたChIP-seq解析によって、ニワトリの3本の染色体では反復配列を含まない40kbの領域に動原体が形成されることを見出している。ChIP-seq解析によって、高精度にセントロメア領域が同定できたが、本年度は、細胞ごとにセントロメアの領域が変動することを見いだし、CENP-HやCENP-Sがこのセントロメア領域の変動に関わっていることを明らかにした。また、4C、5Cなど用いて高次クロマチン構造の変化とセントロメア形成の関連についてネオセントロメア作出の系を活用して解析し、複数のネオセントロメアを保有する株での4C解析が終了した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

セントロメアの再構成実験に関しては、in vitro、in vivoで予定通り進んでいる。ただし、ニワトリ細胞で再構築した染色体が、ヒト細胞で活用できないことが判明したので、その方策を練る必要がある。セントロメア構造のダイナミックな変化に関しては、予定通り研究が進展して、セントロメア変動に関与するタンパク質を同定して論文発表を行った。

Strategy for Future Research Activity

これまでの研究は、概ね順調に推進できているので、基本的には、引き続き研究計画に沿って研究を推進する。

  • Research Products

    (25 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 6 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 8 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] MIT/Stanford 大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      MIT/Stanford 大学
  • [Int'l Joint Research] エジンバラ大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      エジンバラ大学
  • [Int'l Joint Research] サントペテルブルグ 大学(ロシア連邦)

    • Country Name
      RUSSIA FEDERATION
    • Counterpart Institution
      サントペテルブルグ 大学
  • [Int'l Joint Research] IFOM(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      IFOM
  • [Journal Article] Constitutive centromere-associated network controls centromere drift in vertebrate cells.2017

    • Author(s)
      Hori T, Kagawa N, Toyoda A, Fujiyama A, Misu S, Monma N, Makino F, Ikeo K, Fukagawa T.
    • Journal Title

      J Cell Biol.

      Volume: 216 Pages: 101-113

    • DOI

      10.1083/jcb.201605001.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chromatin binding of RCC1 during mitosis is important for its nuclear localization in interphase.2016

    • Author(s)
      Furuta M, Hori T, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Mol Biol Cell.

      Volume: 27 Pages: 371-381

    • DOI

      10.1091/mbc.E15-07-0497.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] RbAp48 is essential for viability of vertebrate cells and plays a role in chromosome stability.2016

    • Author(s)
      Satrimafitrah P, Barman HK, Ahmad A, Nishitoh H, Nakayama T, Fukagawa T, Takami Y.
    • Journal Title

      Chromosome Res.

      Volume: 24 Pages: 161-173

    • DOI

      10.1007/s10577-015-9510-8.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Auxin/AID versus conventional knockouts: distinguishing the roles of CENP-T/W in mitotic kinetochore assembly and stability.2016

    • Author(s)
      Wood L, Booth DG, Vargiu G, Ohta S, deLima Alves F, Samejima K, Fukagawa T, Rappsilber J, Earnshaw WC.
    • Journal Title

      Open Biol.

      Volume: 6 Pages: 150230

    • DOI

      10.1098/rsob.150230.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genetic complementation analysis showed distinct contributions of the N-terminal tail of H2A.Z to epigenetic regulations.2016

    • Author(s)
      Kusakabe M, Oku H, Matsuda R, Hori T, Muto A, Igarashi K, Fukagawa T, Harata M.
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 21 Pages: 122-135

    • DOI

      10.1111/gtc.12327.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Biochemical and Structural Analysis of Kinetochore Histone-Fold Complexes.2016

    • Author(s)
      Nishino T, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 1413 Pages: 135-146

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-3542-0_9.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chicken rRNA Gene Cluster Structure.2016

    • Author(s)
      Dyomin AG, Koshel EI, Kiselev AM, Saifitdinova AF, Galkina SA, Fukagawa T, Kostareva AA, Gaginskaya ER.
    • Journal Title

      PLoS One.

      Volume: 11 Pages: e0157464

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0157464.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Kinetochore assembly and function through the cell cycle.2016

    • Author(s)
      Nagpal H, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Chromosoma

      Volume: 125 Pages: 645-659

    • DOI

      10.1007/s00412-016-0608-3.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Chromatin determinants of the inner-centromere rely on replication factors with functions that impart cohesion.2016

    • Author(s)
      Abe T, Kawasumi R, Arakawa H, Hori T, Shirahige K, Losada A, Fukagawa T, Branzei D.
    • Journal Title

      Oncotarget.

      Volume: 7 Pages: 67934-67947

    • DOI

      10.18632/oncotarget.11982.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Acetylation of histone H4 lysine 5 and 12 is required for CENP-A deposition into centromeres.2016

    • Author(s)
      Shang WH, Hori T, Westhorpe FG, Godek KM, Toyoda A, Misu S, Monma N, Ikeo K, Carroll CW, Takami Y, Fujiyama A, Kimura H, Straight AF, Fukagawa T.
    • Journal Title

      Nature Commun.

      Volume: 7 Pages: 13465

    • DOI

      10.1038/ncomms13465.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Molecular assembly of vertebrate kinetochore2017

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      染色体研究の最前線
    • Place of Presentation
      大阪大学 (大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2017-01-16 – 2017-01-17
    • Invited
  • [Presentation] セントロメア・キネトコアの構築機構2016

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      岡崎フラグメント50周年シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学 (愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2016-12-21 – 2016-12-22
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation for kinetochore specification and assembly in vertebrates2016

    • Author(s)
      Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      Chromosome Stability 2016
    • Place of Presentation
      Thiruvananthapuram, india
    • Year and Date
      2016-12-15 – 2016-12-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular architecture of the kinetochore in vertebrates2016

    • Author(s)
      Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation of centromere specification and kinetochore assembly2016

    • Author(s)
      Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      国立遺伝学研究所研究会
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所 (静岡県三島市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-28
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation of centromere specification and kinetochore assembly2016

    • Author(s)
      Tatsuo Fukagawa
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Centromere Biology
    • Place of Presentation
      Mount Snow, USA
    • Year and Date
      2016-07-24 – 2016-07-29
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] セントロメア・キネトコア形成におけるエピジェネティック制御2016

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会
    • Place of Presentation
      京都テルサ (京都府京都市)
    • Year and Date
      2016-06-15 – 2016-06-17
    • Invited
  • [Presentation] セントロメア・キネトコアの形成機構2016

    • Author(s)
      深川竜郎
    • Organizer
      「タイムシグナルと制御」シンポジウム
    • Place of Presentation
      筑波大学下田臨海実験センター (静岡県下田市)
    • Year and Date
      2016-06-10 – 2016-06-11
    • Invited
  • [Remarks] 遺伝子が次世代へ伝わるメカニズムを解明

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/events/achievement/shang-fukagawa-20161104/

  • [Remarks] 遺伝子伝達の鍵、解明 がん細胞死滅に道 大阪大研究チーム

    • URL

      http://www.sankei.com/west/news/161105/wst1611050079-n1.html

  • [Remarks] セントロメアは動くことができる

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/events/achievement/hori-fukagawa-20161209/

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-09-13  

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