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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Control of chromosome functions by axis-loop structure (chromosome 3D) during meiosis

Planned Research

Project AreaChromosome Orchestration System
Project/Area Number 15H05973
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

篠原 彰  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (00252578)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 篠原 美紀  近畿大学, 農学部, 教授 (80335687)
吉田 佳世  大阪市立大学, 大学院医学研究科, 准教授 (30311921)
Project Period (FY) 2015-06-29 – 2020-03-31
Keywords染色体 / 減数分裂 / 組換え / コヒーシン / Rec8 / 染色体OS
Outline of Annual Research Achievements

染色体が調和して機能する仕組みを染色体オーケストレーションシステム(染色体OS) と呼び、精子、卵子などの配偶子形成に必須な減数分裂では染色体OSがより劇的に変化する。減数分裂期には染色体3D構造が大きく変化するだけでなく、染色体を場として組換えなどの様々なDNA代謝反応が“制御された形”で起き、その制御プラットフォームが染色体OSであると考えられる。本計画研究は減数分裂期染色体を染色体OSのモデル系として捉え、減数分裂期染色体構造、特にその基盤となる染色体軸―ループ構造と機能を理解し、減数分裂期特異的染色体上で起きる減数分裂期組換えの制御の分子メニズムを明らかにすることを目的とする。2019年度では、染色体構造とその上で起こる組換えの連携の分子メカニズムを解明することを目標とし、超解像度蛍光顕微鏡とクロマチン免疫沈降-DNA sequencing (ChIP-seq)法で、減数分裂期の染色体構造、特に高次構造(軸―ループ構造)を、減数分裂期染色体の軸構成要素であるコヒーシンの局在を解析した。その結果、減数第一、第二分裂期に起こるセパレースによる切断に依存しない仕組みで、コヒーシン複合体が染色体から減数分裂第1分裂後期で解離すること、その解離には特異的なリン酸化酵素Polo-likeキナーゼ(PLK)とDbf4依存性Cdc7キナーゼ(DDK)のキナーゼの協調的は働きにより、コヒーシン制御因子の1つWAPL(Rad61)とRec8がリン酸化されることが必要であることを見出した。また、ChIP-seq法による局在を解析したところ、その解離は動原体を含め、染色体全体に起き、コヒーシンは解離後に再結合できること、つまり動的な結合制御を受けることも明らかになった。減数分裂期の染色体構造形成は必須構成因子のコヒーシンの結合を動的に制御することで、機能的な高次構造を作ると考えられる。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (22 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California, Davis(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California, Davis
  • [Int'l Joint Research] University of Vienna(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      University of Vienna
  • [Int'l Joint Research] IISER Thirunapanthapuram(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      IISER Thirunapanthapuram
  • [Int'l Joint Research] FMI(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      FMI
  • [Int'l Joint Research] Institute of Curie(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Institute of Curie
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      2
  • [Journal Article] Rad50 zinc hook functions as a constitutive dimerization module interchangeable with SMC hinge2020

    • Author(s)
      Tatebe Hisashi、Lim Chew Theng、Konno Hiroki、Shiozaki Kazuhiro、Shinohara Akira、Uchihashi Takayuki、Furukohri Asako
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 370

    • DOI

      10.1038/s41467-019-14025-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genetic interactions of histone modification machinery, Set1 and PAF1C, with the recombination complex, Rec114-Mer2-Mei4, in the formation of meiotic DNA double-strand breaks2020

    • Author(s)
      69.Zhang Y., Suzuki T., Li K., Gothwal S.K., Shinohara M., and A. Shinohara
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.3390/ijms21082679

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Toward Global Standardization of Conducting Fair Investigations of Allegations of Research Misconducts2020

    • Author(s)
      Nouchi R, Aihara H, Arie F, Asashima M, Daida H, Fudano J, Fujiwara Y, Fushiki S, Geller RJ, Hatano K, Homma T, Kimura M, Kuroki T, Miki K, Morita I, Nitta K, Shinohara A, Siomi MC, Yoshida M, Ichikawa I
    • Journal Title

      Accountability in Research: Policies and Quality Assurance

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1080/08989621.2020.1747019.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Human RAD51 paralogue SWSAP1 fosters RAD51 filament by regulating the anti-recombinase FIGNL1 AAA+ ATPase2019

    • Author(s)
      Matsuzaki Kenichiro、Kondo Shizuka、Ishikawa Tatsuya、Shinohara Akira
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 1407

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09190-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Srs2 helicase prevents the formation of aberrant DNA damage during late prophase I of yeast meiosis2019

    • Author(s)
      Sasanuma, H., Sabhan, H.M.S., Furihata, Y., Challa, K., Palmer, L. Gasser, S.M., Shinohara, M., and A. Shinohara
    • Journal Title

      Chromosoma

      Volume: 128 Pages: 453-471

    • DOI

      10.1007/s00412-019-00709-5

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Distinct Functions in Regulation of Meiotic Crossovers for DNA Damage Response Clamp Loader Rad24(Rad17) and Mec1(ATR) Kinase2019

    • Author(s)
      Shinohara Miki、Bishop Douglas K.、Shinohara Akira
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: 213 Pages: 1255~1269

    • DOI

      10.1534/genetics.119.302427

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Enhanced processivity of Dnmt1 by monoubiquitinated histone H32019

    • Author(s)
      Mishima Yuichi、Brueckner Laura、Takahashi Saori、Kawakami Toru、Otani Junji、Shinohara Akira、Takeshita Kohei、Garvilles Ronald Garingalao、Watanabe Mikio、Sakai Norio、Takeshima Hideyuki、Nachtegael Charlotte、Nishiyama Atsuya、Nakanishi Makoto、Arita Kyohei、Nakashima Kinichi、Hojo Hironobu、Suetake Isao
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 25 Pages: 22~32

    • DOI

      10.1111/gtc.12732

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Human RAD51 paralog, SWSAP1, promotes RAD51 assembly by regulating the anti-recombinase, FIGNL1 AAA+ ATPase2020

    • Author(s)
      Akira Shinohara
    • Organizer
      Workshop on Genome Biology and Mutagenesis, IISER TRV, India
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Human RAD51 paralog, SWSAP1, promotes RAD51 assembly by regulating the anti-recombinase, FIGNL1 AAA+ ATPase2019

    • Author(s)
      Akira Shinohara
    • Organizer
      ASEB meeting on recombination & genome rearrangement, USA
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Human RAD51 paralog, SWSAP1, promotes RAD51 assembly by regulating the anti-recombinase, FIGNL1 AAA+ ATPase2019

    • Author(s)
      Akira Shinohara
    • Organizer
      EMBO workshop on meiosis, France
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A New Role of Srs2 DNA helicase, anti-recombinase, during Yeast Meiosis2019

    • Author(s)
      H. Sabhan, A. Shinohara
    • Organizer
      第25回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] Role of Mei5-Sae3 complex in Dmc1 assembly in Yeast meiosis2019

    • Author(s)
      P. Swant, A. Shinohara
    • Organizer
      第25回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] The role of PCSS (Psy3-Csm2-Shu1-Shu2) complex, a Rad51 mediator, in meiotic recombination2019

    • Author(s)
      S. Wangui, A. Shinohara
    • Organizer
      第25回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] 減数分裂期におけるマウスRAD51パラログSwsap1の機能解析2019

    • Author(s)
      近藤静香、篠原 彰
    • Organizer
      第25回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Remarks] ゲノムー染色体研究室ホームページ

    • URL

      http://www.protein.osaka-u.ac.jp/genome/index.html

  • [Funded Workshop] Chromosome Dynamics Symposium, FMI, Basel, Switzerlnad2019

URL: 

Published: 2021-01-27  

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