2020 Fiscal Year Annual Research Report
Symbiotic Relationship between Influenza Virus and Waterfowl in Nature
| Project Area | Neo-virology: the raison d'etre of viruses |
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| Project/Area Number |
16H06434
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
渡辺 登喜子 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (60557479)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
河岡 義裕 東京大学, 医科学研究所, 教授 (70135838)
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| Project Period (FY) |
2016-06-30 – 2021-03-31
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| Keywords | インフルエンザウイルス / 共生 / バイローム解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
インフルエンザウイルスは、人間界では病原微生物として認識されているが、自然宿主であるカモなどの野生の水禽では、感染しても病気を発症することはない。 本研究では、インフルエンザウイルスと水禽との共生の自然界における意義を理解するために、１）インフルエンザウイルスとの共生が水禽の腸内微生物叢や生理機能に及ぼす影響の解析、２）インフルエンザウイルスと水禽との共生メカニズムの解析、および ３）野生動物におけるバイローム解析による新規ウイルスの探索を行っている。
野生動物におけるバイローム解析については、これまでに鹿児島県に飛来するツルの糞便サンプルのメタゲノム解析によって、新規のツルアデノウイルスを同定している。続いて、これらの糞便サンプルを用いて、野生の水鳥の腸内微生物叢の解析を実施した。具体的には、鹿児島県出水市に飛来したナベヅル、および同じ場所に生息するカモの糞便から抽出したDNAサンプルのメタゲノム解析を行なった。各サンプルにおいて、真核生物や細菌、古細菌、ウイルスについて、目レベルと属レベルでの生物の割合を明らかにすることができた。リードの長さが150 ヌクレオチドと短く、各サンプルの正確な種を特定することは困難であったが、短いリードのアセンブリーを行うことによって、サンプルに含まれる生物の種レベルでの解析を行なった。
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] Identification of a novel bat alphacoronavirus in Sierra Leone by using multiple degenerate primers2022
Author(s)
Shintaro Shichinohe, Kosuke Takada, Pascal Hingamp, Yuriko Tomita, Tadashi Maemura, Alhaji U. N'jai, Tohru Suzuki, Yoshihiro Kawaoka, Hisashi Endo, Hiroyuki Ogata, Tokiko Watanabe
Organizer
20th Awaji International Forumon Infection and Immunity
Int'l Joint Research
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[Presentation] Characterization of an antibody that neutralizes a wide range of SARS-CoV-2 variants2022
Author(s)
Itsuki Anzai, Junso Fujita, Chikako Ono, Yoichiro Kosaka, Yuki Miyamoto, Shintaro Shichinohe, Kosuke Takada, Shiho Torii, Shuhei Taguwa, Koichiro Suzuki, Fumiaki Makino, Tadahiro Kajita, Tsuyoshi Inoue, Keiichi Namba, Tokiko Watanabe, Yoshiharu Matsuura
Organizer
20th Awaji International Forumon Infection and Immunity
Int'l Joint Research
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